晁天柱 作品数:19 被引量:19 H指数:3 供职机构: 东华大学生物科学与技术研究所 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 上海市科学技术委员会科研基金 中央高校基本科研业务费专项资金 更多>> 相关领域: 生物学 医药卫生 更多>>
一种单面96孔易于多孔道移液器取样的离心管架 本实用新型提供了一种单面96孔易于多孔道移液器取样的离心管架,其特征在于,包括长方体形的底座,底座的上表面为孔洞排布面,孔洞排布面上设有96个孔洞,所述的96个孔洞沿孔洞排布面的长度方向排列为12列,沿孔洞排布面的宽度方... 肖君华 陈科 徐福义 晁天柱 周宇荀 李凯文献传递 构建基于荧光多重cPCR的小鼠基因拷贝数检测方法 2015年 目的建立基于竞争性聚合酶链式反应(competitive polymerase chain reaction,cPCR)小鼠基因拷贝数变异(copy number variations,CNVs)的检测方法,用于检测野生小家鼠来源一号染色体替换系群体(population of specific chromosome 1 substitution strains,PCSSs)的CNVs。方法选取小鼠一号染色体上11个CNVs位点,及7、9和X染色体上各1个内对照位点,分别构建克隆质粒为竞争性粒模板,应用cPCR技术,建立荧光通用引物多重cPCR检测方法。结果多重cPCR方案适用于小鼠一号染色体上11个CNV位点的拷贝数检测,且能准确检测X染色体的拷贝数。结论实现小鼠快速、高通量的CNVs检测,可准确检测小鼠1号染色体中11个CNV位点的拷贝数变异。 晁天柱 李鹏翔 徐福意 李凯 周宇荀 肖君华关键词:拷贝数变异 CPCR 小鼠 染色体替换系的方案构建及评价 2015年 目的为缩短复杂性状相关基因精细定位时间,构建染色体替换系(CSSs),并对构建方案进行评价。方法以供体小鼠作为母本、受体C57BL/6小鼠作为父本进行杂交,获得N1代小鼠。将N1代雄性小鼠与C57BL/6雌性小鼠杂交,获得N2代小鼠。选择N2代1号染色体非重组的雄性小鼠与C57BL/6雌性小鼠回交,获得N3代回交小鼠;通过短串联重复序列(STR)与单核苷酸多态性(SNP)对每代一定数量的子代进行遗传分析,依次回交10代,选择N10代l号染色体未重组的样本,雌雄交配,挑选1号染色体为纯合且来自供体品系的子代小鼠,用于繁殖纯合后代。通过基因芯片扫描鉴定替换系的纯合度,并与期望值比较。结果根据构建的CSSs方案,得到2个不同的CSSs,通过基因芯片扫描得到的替换系纯合度与期望值接近。结论构建的CSSs方案可完成(部分)近交系小鼠品系目标染色体替换,供体品系背景基因组中99.59%以上已被受体C57BL/6小鼠替换,证明构建的CSSs方案可行。 赵莹 赵丽亚 晁天柱 张蓉 邢正弘 陈国强 肖君华miR-505慢病毒表达载体的构建 2014年 目的:构建携带增强绿色荧光蛋白(enhanced green fluorescent protein,EGFP)和miR-505基因的慢病毒载体。方法:采用PCR方法从pcDNATM6.2-GW/EmGFP-miR-505表达载体质粒扩增出miR-505 shRNA基因编码区173bp、175、171bp片段,通过限制性酶切、T4DNA连接酶连接,分别将miR-505 shRNA基因插入慢病毒表达载体FUGW与L26Fsy(1.1)GW中,构建成重组载体FUGW-miR-505-3p/5p/nc与Fsy-miR-505-3p/5p/nc。脂质体介导下将慢病毒重组载体转染至HEK 293T细胞,通过EGFP观察转染效率,RT-PCR方法检测miR-505的表达量。结果:荧光显微镜下观测到HEK 293T细胞转染后有较强绿色荧光;RT-PCR显示转染FUGW-miR-505-3p/5p与Fsy-miR-505-3p/5p的HEK 293T细胞中对应miR-505-3p/5p明显升高。结论:成功构建带有EGFP和miR-505-3p/5p/nc shRNA基因的慢病毒表达载体。 马骁骁 杨侃 晁天柱 薛慧慧 邓倩云 常雪莹 周宇荀关键词:慢病毒载体 瞬时转染 RT-PCR 分离培养适用于染色体分选的新生小鼠皮肤成纤维细胞 被引量:1 2016年 采用酶消化法分离培养新生小鼠皮肤成纤维细胞(mouse skin fibroblasts,MSFs).通过噻唑蓝(MTT)比色法和流式细胞术(flow cytometry,FCM),深入探讨不同培养基和血清浓度对MSFs增殖率和同步化效率的影响.结果表明:酶消化法能快速获取大量健康、高活力的MSFs;在杜氏培养液(DMEM)传代培养条件下,P2代MSFs具有高增殖率和有丝分裂指数;地美可辛工作浓度为0.05μg/mL时,阻断同步化获取M期MSFs的效率最佳.研究结果为流式细胞术分选染色体提供实验材料和研究基础. 晁天柱 徐福意 徐伟 李凯 周宇荀 肖君华关键词:成纤维细胞 细胞同步化 流式细胞术 中国野生小家鼠来源1号染色体替换系群体的构建及基因组信息和表型的评估 小型啮齿类动物小鼠(musculus),在地球上分布广泛,种类繁多,并广泛应用于生物相关领域的研究。从第一个近交系小鼠品系(DBA)培育至今,并伴随着各类小鼠资源的不断发展和积累,小鼠已成为最重要的模式动物,小鼠遗传学也... 晁天柱关键词:表型 文献传递 qPCR array检测高糖对胆固醇合成基因表达的影响 被引量:3 2014年 目的:高血糖易引起胆固醇在体内积聚,增加糖尿病合并动脉粥样硬化性心血管疾病的患病风险。本文通过建立稳定的实时定量PCR芯片(Real-time quantitative polymerasechain reaction array,qPCR array)检测方案,研究高糖对小鼠肝癌细胞Hepa1-6胆固醇合成基因表达的影响,探讨胆固醇合成基因在糖尿病大血管并发症发展中的作用机制。方法:以不同浓度葡萄糖(5、15、30mmo/L)和不同时间(0、6、12、18、24 h),刺激肝癌细胞Hepa1-6,利用qPCR array检测其胆固醇合成基因的表达差异。结果:与5mmol/L相比,高糖组(15、30 mmo/L)处理细胞18 h后,胆固醇合成基因CYP51、EBP、NSDHL、SQLE、FDFT1和PMVK的表达上调(P<0.05),呈现剂量依赖性。与0 h相比,15 mmol/L高糖处理细胞12 h,CYP51、EBP和SQLE mRNA表达量上调(P<0.01)。至24 h,CYP51、EBP降至0 h水平,而SQLE的表达量继续增加;NSDHL在12 h表达无差异,至18 h表达量发生上调(P<0.05)。结论:该qPCR array检测方案能特异性检测胆固醇合成基因的表达量。高糖能够促进胆固醇合成基因的表达,使细胞内胆固醇积聚,这可能是糖尿病患者容易发生动脉粥样硬化的原因。这提示我们将胆固醇合成基因作为药物靶点可能延缓糖尿病动脉粥样硬化进展。 朱长保 徐福意 晁天柱 薛慧慧 肖君华 李凯关键词:高糖 胆固醇合成 STR和SNP对3个小鼠1号染色体替换系筛选结果的比较 被引量:1 2012年 目的比较STR和SNP对3个1号染色体替换系的分型结果,并为每个替换系选择合适的基因分型方法。方法采用20个SNP和10个STR位点分别对3个1号染色体替换系N2代各40个样本进行分型。结果采用20个SNP位点,从C3H/He替换系中筛选到6个样本,从FVB/N替换系中筛选到9个样本,从AKR替换系中筛选到4个样本。采用10个STR位点,从C3H/He替换系中筛选到6个样本,从FVB/N替换系中筛选到10个样本,从AKR替换系中筛选到6个样本。结论根据每个品系基因组背景不同,可选择三组多重STR方案作为C3H/He替换系的基因分型方法,三组多重SNP方案作为FVB/N和AKR替换系的基因分型方法。 赵丽亚 赵莹 晁天柱 刘磊 邢正弘 陈国强 肖君华关键词:STR SNP 基于荧光通用引物竞争性PCR分析候选基因的表达 2013年 目的:建立用于小家鼠X染色体性发育相关候选基因筛选的一种基于荧光通用引物竞争性聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)定量技术。方法:在小家鼠X染色体上与性发育启动相关的数量性状基因座(quantitative traitlocus,QTL)区段内选择10个候选基因,应用竞争性PCR技术,建立基于荧光通用引物竞争性PCR方案。结果10个候选基因在近交系品系C57BL/6J(B6)和C3H/HeJ(C3)的下丘脑中无表达量差异。结论:本研究,通过实时荧光定量PCR(Real-time quantitative PCR,RT-PCR)技术验证竞争性PCR方案的检测结果准确、可靠。明确10个候选基因与近交系品系B6和C3的性发育启动差异无关。 王丹 徐福义 晁天柱关键词:QTL 性发育 一种基于ZZ2小家鼠来源的1号染色体替换B6-Chr1<Sup>ZZ2</Sup>/Xiao小鼠模型的构建方法 本发明涉及一种基于ZZ2小家鼠来源的1号染色体替换B6-Chr1<Sup>ZZ2</Sup>/Xiao小鼠模型的构建方法,包括:将ZZ2小鼠与小鼠C57BL/6J杂交,获得F1代,取F1代小鼠与C57BL/6J回交,获得... 李凯 高遄 晁天柱 徐福意 周宇荀 肖君华文献传递