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张德礼: 作品数：24 被引量：124H指数：6; 供职机构：清华大学信息科学技术学院自动化系更多>>; 发文基金：国家火炬计划国家自然科学基金中国博士后科学基金更多>>; 相关领域：生物学农业科学医药卫生自动化与计算机技术更多>>

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优劣环境交替性生物循环选育的理论与技术体系和应用被引量：1: 2003年; 张德礼李衍达黄高升朱关福方福德; 关键词：病毒疫苗恶性横纹肌样瘤水貂细小病毒

人类新基因的电子克隆、实验确认与功能分析: 该研究旨在采用电子克隆法发现具有自主知识产权和重要功能的人类新基因并经实验初步证实,为国内采用生物信息学方法克隆新基因开辟道路,并力求为国际同行提供成功的新经验、新思路.在人类疾病或功能基因组学方面,从PubMed公布基...; 张德礼; 关键词：人类基因组表达序列标签电子克隆生物信息学

类固醇5-α还原酶样基因Srd5α2l2的克隆及表达分析: 2003年; 采用表达序列标签 (EST)介导的基因克隆和表达谱分析 ,从小鼠心脏克隆了一个cDNA为 2 3 4 8bp ,主要在心脏表达的新基因Srd5α2l2 (GenBankAccNo .AF5483 65) .该基因由 12个外显子组成 ,3′非翻译区富含ATTTA序列 ,最大开放阅读框编码一个由 3 61个氨基酸组成的假定蛋白 ,该蛋白质C端含有类固醇 5 α还原酶的保守结构域 (3 oxo 5 alpha steroid 4 dehydrogenase ,STEROID_DH ) .生物信息学分析表明 ,人cDNA克隆DKFZp3 13D0 82 9(AL83 3 10 8)是Srd5α2l2的人同源基因 .经同源性检索 ,支持Srd5α2l2的全部 41条EST中 2 5条来自小鼠心脏组织 .RT PCR检测初步证实 ,该基因主要在心脏中表达 ,而在其他组织中不表达或弱表达 .综合考虑Srd5α2l2的序列特征和表达谱。; 陈祥贵李勇张德礼成君朱文丽刀京晶; 关键词：基因克隆

人类SR蛋白超家族新成员——SFRS12(SRrp508)的基因克隆和特性分析被引量：57: 2002年; 采用生物信息学方法克隆出全长 3811bp的人类RC5 0 8cDNA片段 ,经核酸和蛋白质分析为人类新基因 (Gen Bank登记号 :AF4 5 90 94 ) ,利用RT PCR方法从人类胰脏组织中扩增出包含编码 5 0 8个氨基酸残基最大开放读码框架 (ORF)的 16 80bpcDNA片段 ,经核酸测序证明与电子克隆结果完全一致。该基因具有启动子和TATA box,ORF前同一相位有多个终子码 ,后有加尾信号 ,显示为客观存在基因。该基因含有 12个外显子 (96～ 2 0 93bp)和 11个内含子 (14 0～ 5 15 3bp) ,定位于人类 5号染色体 5q11.2～q12 .1,无任何连锁基因存在。该基因ORF 342～ 186 8(15 2 7)横跨10个外显子 ,所编码 5 0 8氨基酸蛋白的全长序列与大鼠丝氨酸精氨酸二肽富含性 (SR)剪切调控蛋白 86 (SRrp86 )高度同源 ,在核酸和蛋白水平的同源性分别为 84 %和 86 % ,与其他已知蛋白无论在核酸水平还是在氨基酸水平几乎均无整体的同源性。结果表明 ,所克隆的 5 0 8氨基酸蛋白才是大鼠SRrp86的人类同源物 ,从而修正了Barnard(2 0 0 0 )所指出的人类同源物为人类精氨酸富含性核蛋白 5 4 (p5 4 )这一论断 ,并提示它是日益增长的SR蛋白超家族的又一个新成员。该基因组织表达谱广泛 ,有可能具有转录因子活性 ,暂命名为SR相关剪切调控蛋白 5 0 8(SRrp5 0; 张德礼孙晓静凌伦奖陈润生马大龙; 关键词：基因克隆特性分析

犬肾细胞系的染色体组型分析与致癌/致瘤性的实验研究被引量：3: 2002年; 以人类子宫颈癌细胞系Hela为阳性对照 ,以连传 3代的犬、猫肾原代细胞 (CKC、FKC)为阴性对照 ,对来自国内外不同单位收集的 4株MDCK传代细胞系培养 2 5～ 4 5代的完整活细胞或冻融裂解细胞进行裸鼠致癌 /致瘤实验观察 ,筛选出致癌性极低、符合细胞遗传学要求、无传染因子污染的几株MDCK细胞系用于制苗 ,并建立了相应的细胞种子库和工作库 ,供科研和生产使用 ,4年运转很好。不同代次MDCK细胞系染色体众数所占比率的相差率一般不超过 5 %～ 15 % ,结构畸变率一般为 0～ 3%。研究表明 ,MDCK细胞染色体遗传特征决定致瘤性质 ,并具有种属特异性 ,MDCK细胞不论核型如何 ,始终具有致癌性 ,但其致癌 /致瘤性差 ,只有超二倍体以上细胞才具有高的致癌 /致瘤率 (如YA株的为 2 8/ 5 8) ,亚二倍体细胞的致癌 /致瘤率很低 (其它 3株MDCK细胞的致癌 /致瘤率为 5 / 5 4 ) ,且一般致上皮源性恶性肿瘤 ,多为高中分化腺癌。冻融裂解癌细胞系 (X株Hela、JA株Vero、M株BHK 2 1、YA株MD CK)的致癌 /致瘤性相应降低 ,极低致癌 /致瘤性细胞系 (M株或JC株MDCK)不会因冻融裂解而增加致癌 /致瘤性。证明MDCK细胞系冻融裂解物不致癌 ,降低制苗毒液中细胞系基因含量 ,完全可以将MDCK细胞系 (M ,JB ,JC株 )用于犬五联苗生产。MDCK细胞?; 张德礼李六金夏耕田何旭玉高步先白晓鸿黄高升刘尚高阎隆飞方福德; 关键词：疫苗生产染色体组型致癌致瘤性

横纹肌样瘤的起源研究——高变异率BHK-21细胞致裸鼠产生恶性横纹肌样瘤的实验研究被引量：2: 1999年; 横纹肌样瘤（ＲＴ）的起源迄今仍是世界上悬而未决的重大难题。第一例ＲＴ发现于肾脏。但迄今发现的ＲＴ均难以复制成功。在纯化３代的肿瘤阴性对照猫肾和犬肾原代细胞皮下接种裸鼠的致癌／致瘤率为０％（０／３２），肿瘤阳性对照Ｈｅｌａ细胞皮下接种裸鼠产生进行性生长恶性肿瘤的比率为１００％（４０／４０）的前提下，ＢＨＫ－２１细胞皮下接种裸鼠均产生进行性生长的恶性肿瘤（６５／６５），其中染色体众数为４０±２（比率５８％～６８％）的ＫＡ株致ＲＴ比率为５２．３８％（１１／２１），具有两个染色体众数４０±２（比率４１％～５３．５）和７２±２（比率３１％～３５％）的ＹＡ株致ＲＴ的比率为８３．３３％（１０／１２），染色体众数为７３±３（比率４２％～５０％）的成瘤细胞体外再培养ＮＭ２８／ＹＡ株致ＲＴ的比率为７１．４３％（１５／２１），染色体众数为４２（比率２８％～３０％）的Ｍ株致ＲＴ的比率为０％（０／１０），致形态类似于分化比较好的平滑肌肉瘤的恶性肿瘤的比率为１００％（１０／１０），可见ＢＨＫ－２１细胞不能用作病毒活疫苗培养基质，可替代Ｈｅｌａ细胞用作恶性肿瘤阳性对照细胞。高变异率ＢＨＫ－２１细胞株皮下接种无胸腺裸鼠大多产生恶性ＲＴ（２?; 张德礼李六金白晓鸿白晓鸿何旭玉高步先黄高升; 关键词：横纹肌样瘤 BHK-21细胞 HELA细胞

人类新基因的计算机识别、实验验证与功能基因组研究: 本研究旨在采用计算机识别法发现具有自主知识产权和重要功能的人类新基因并经实验初步证实。采用的具体技术路线如下： 1)在公共数据库选择感兴趣的EST或cDNA;2)全自动化运行SiClone软件进行EST装配;3...; 张德礼季梁马大龙李衍达; 关键词：表达序列标签计算机克隆基因识别; 文献传递

从系统生物学角度看人类新基因的电子克隆、实验确认与功能研究: 本研究旨在采用电子克隆法发现具有自主知识产权和重要功能的人类新基因并经实验初步证实，为国内采用生物信息学方法克隆新基因开辟道路，并力求为国际同行提供成功的新经验、新思路。; 张德礼; 关键词：生物信息技术功能基因组学; 文献传递

人类新基因电子克隆的自动化软件系统建立和实验验证与功能研究: 2002年; 2002年4月14日至17日在上海国际会议中心举行的第七届国际人类基因组大会(HUGO SEVENTHINTERNATION HUMAN GENOME MEETING,HGM2002)上,有5篇Poster论文获奖,包括英国、美国、俄国、中国台湾和中国大陆各一篇,中国大陆获奖的论文是北京大学人类疾病基因研究中心博士后张德礼、博士生丁培国、国家人类基因组北方研究中心研究生孙晓静、中国科学院生物物理研究所凌伦奖副研究员与陈润生研究员及本中心主任马大龙教授合作完成的研究论文《In Silico Cloning of Novel HumanGenes and Their Experimental Verification》(人类新基因的电子克隆和实验确认)(第71号Poster)。国际人类基因组大会由国际人类基因组组织(Human Genome Organization,HUGO)主办,前六届均在发达国家召开。第七届国际人类基因组大会是HUGO首次在发展中国家举行,来自世界各地的2000多名正式代表参加了会议。会议口头发言分大会报告、专题报告和小组报告三种形式,我国只有陈竺和于军教授分别作了题为《Acute promyelocytic leukemia-a model of functional genomics study of leukemia》和《Moreto do,and more to learn》的大会报告,我国没有人作专题和小组报告,可见资金投入和研究水平亟待提高。; 张德礼马大龙钱敏平; 关键词：电子克隆自动化软件人类基因

Vero-2和MA-104细胞系染色体组型分析与致癌─致瘤性研究——在犬五联疫苗制备中替代BHK-21细胞系细胞株的筛选和检定被引量：1: 1999年; 在用纯化３代的猫肾原代细胞（ＦＫＣ）和犬肾原代细胞（ＣＫＣ）皮下接种裸鼠无致癌致瘤性，以人类子宫颈癌细胞系（Ｈｅｌａ）超二倍体ＫＢ株、Ｘ株及超二倍体和亚四倍体ＮＭ２０／Ｘ株皮下接种裸鼠产生进行性恶性肿瘤比率分别为１０／１０，２５／２５和５／５的前提下，非洲绿猴肾细胞系亚二倍体（Ｖｅｒｏ２）ＪＣ株５～１９代和超二倍体ＹＡ株１２～１８代分别皮下接种２０和１０只裸鼠，均未产生肿瘤，恒河猴肾细胞系亚四倍体（ＭＡ１０４）ＪＣ株４代皮下接种５只裸鼠亦未产生肿瘤。不同株的Ｈｅｌａ和地鼠肾细胞系（ＢＨＫ２１）在３．３ｇ／Ｌ琼脂中均具有抛锚独立生长特性，并在终浓度３．１２５～２００ｍｇ／ｍＬ植物凝集素（ＰＨＡ）作用下出现凝集现象，而ＦＫＣ、ＣＫＣ及Ｖｅｒｏ２细胞系ＪＣ株、ＹＡ株既不具有抛锚独立生长特性，在不同浓度ＰＨＡ作用下也不发生凝集，符合非肿瘤源性细胞的特性。因此，Ｖｅｒｏ２细胞系ＪＣ株可用作病毒疫苗毒株的传代培养，而Ｖｅｒｏ２细胞系ＹＡ株和ＭＡ１０４细胞系ＪＣ株则不适宜。; 张德礼李六金白晓鸿白晓鸿刘尚高高步先; 关键词：染色体组型

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