刘璐
- 作品数:25 被引量:76H指数:5
- 供职机构:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所更多>>
- 发文基金:江苏省科技支撑计划项目国家自然科学基金常州市科技攻关项目更多>>
- 相关领域:农业科学医药卫生更多>>
- 鸡不同生精细胞中Piwil1基因启动子区DNA甲基化差异研究被引量:3
- 2014年
- 旨在通过检测不同类型生精细胞中Piwil1基因的转录水平和启动子区甲基化状态,为深入探讨该基因在鸡精子发生过程中的转录调控机制奠定基础。通过荧光定量PCR技术检测Piwil1基因在不同生精细胞的mRNA表达水平,同时采用Bisulfite sequencing PCR法对启动子区进行甲基化修饰、转化和克隆测序,分析甲基化状态。结果发现,鸡Piwil1基因在精子中几乎不表达,在精原细胞的表达量显著高于PGCs、SSCs和四倍体(P<0.01)。鸡Piwil1基因启动子区-233^+298bp存在1个CpG岛,该岛有56个CpG位点。第1~10个CpG位点(-233^-129bp区域),精子细胞、四倍体细胞、PGCs、SSCs中处于未甲基化状态,而精原细胞中甲基化比例高达0.600;第39~55个CpG位点(+105^+252bp区域),不同细胞中的甲基化水平差异显著,精原细胞中仅为0.212。PGCs、SSCs中DNA高甲基化在一定程度上抑制了Piwil1基因的表达。研究表明:在+105^+252bp非编码区域甲基化可能对Piwil1基因转录调控有一定影响,但还存在其他转录调控机制。
- 陈静翟飞夏明秀陈蓉徐琪常国斌李建超马腾王洪志徐璐刘璐陈国宏
- 关键词:甲基化精子发生
- 鸡Piwill基因启动子区转录调控元件的初步分析
- 1引言Argounaute蛋白是一类高度保守的蛋白家族,含有保守的结构域PIWI和PAZ。根据氨基酸序列的不同,可以分为两个不同的亚家族:Ago和Piwi亚家族。前者与siRNAs和miRNAs相结合,在基因调控中起着重...
- 夏明秀常国斌陈蓉翟飞戴爱琴马腾王洪志徐璐陈静刘璐陈国宏
- 关键词:转录调控
- 文献传递
- 鸡血糖性状的全基因组关联分析被引量:5
- 2020年
- 旨在挖掘影响鸡血糖性状的有效SNP位点及功能基因,为优质肉鸡分子育种工作提供有效的理论支撑。本试验选取407只京星黄母鸡于98日龄屠宰,酚仿法提取血液DNA,进行深度为10×的全基因组重测序;葡萄糖氧化酶法测定血清中血糖水平,基于全基因组重测序和血糖表型数据进行全基因组关联分析(GWAS)。结果,GWAS共筛选到6个血糖相关的SNPs位点(关联阈值P<1.43×10^-6)。基因注释发现,rs734134177在UBE3D基因第8内含子上,其编码蛋白为泛素蛋白连接酶。该位点携带野生型(AA)个体的血糖水平极显著高于突变型(GG)个体(P<0.01);rs794554022位于ACAD9基因下游D 93.5 kb处。ACAD9蛋白为酰基辅酶A脱氢酶家族的成员之一,是细胞线粒体中脂肪酰基辅酶A进行β-氧化过程中的限速酶。rs794554022位点携带野生型(AA)个体的血糖水平极显著低于携带突变型(CC)个体的(P<0.01)。以上位点可能是调控血糖水平的相关候选SNPs位点,这两个位点所在基因可能参与了肉鸡血糖代谢的调控过程,这些结果将为调控肉鸡血糖代谢进而改善肉品质的育种工作提供候选的分子标记,为肉鸡血糖代谢的调控提供了新的思路。
- 刘晓静刘璐王杰王杰崔焕先文杰
- 关键词:血糖SNP分子标记
- 基于时序表达谱芯片挖掘鸡脂肪酸代谢关键调控基因被引量:1
- 2013年
- 不同脂肪酸的代谢产物决定了鸡肉风味的差异,找出影响鸡肌肉组织中脂肪酸代谢的关键调控基因对提高肉品质以及对优质肉鸡新品系选育具有重要意义。本研究对KEGG和Wikipathway数据库中脂肪酸代谢网络进行整合分析,挖掘鸡脂肪酸代谢的关键基因,通过Gene Spring筛选出不同周龄的肌肉组织中表达谱芯片与关键基因共表达的差异基因(Pearson相关系数≥0.9),然后导入Cytoscape进行共表达网络分析,最后进行跨物种检索关键调控基因功能,得到鸡肌肉组织中脂肪酸代谢的节点基因和相关通路。结果表明,Ep300、Traf2和Pak1等基因是影响鸡肌肉中脂肪酸代谢的节点基因,MAPK通路、ErbB通路和Herpes simplex infection通路可能是肌肉中脂肪酸代谢调控的关键通路,该结果为研究家禽肌肉中脂肪酸代谢的分子机制和进一步筛选优质肉质基因提供了基础资料。
- 王洪志常国斌马腾翟飞夏明秀刘璐陈静徐璐陈国宏
- 关键词:脂肪酸表达谱芯片调控通路
- 大白猪TLR4基因外显子1遗传变异及其与细胞因子水平的关系被引量:1
- 2013年
- 本实验运用PCR-SSCP技术对大白猪TLR4基因外显子1遗传变异进行分析,同时利用ELISA方法对外周血重要细胞因子(IL-2、IL-4、IL-6、IFN-Beta、IL-10、IL-12)的水平进行测定,旨在分析大白猪TLR4基因外显子1多态性及其与重要细胞因子水平间的关系,探讨将其作为抗F18大肠杆菌病遗传标记的可行性。结果表明:大白猪TLR4基因外显子1存在G93C同义突变位点,共检测到3种基因型,分别定义为BB、BC和CC;关联分析结果表明,大白猪TLR4外显子1变异位点对机体重要细胞因子水平没有显著影响(P>0.05),表明基于该位点的分子选育不会对机体免疫应答和一般抗病力产生不利影响。结果提示,有必要将TLR4基因外显子1的变异位点作为抗大肠杆菌病的重要遗传标记进行深入研究。
- 苏先敏王靖赵乔辉刘璐吴圣龙包文斌
- 关键词:多态性细胞因子大白猪
- 苏太猪不同胎次繁殖性能的比较分析被引量:16
- 2011年
- 本试验对苏太母猪核心群不同胎次的繁殖性能进行比较,并对后备猪的初生重、35日龄断奶重、4月龄重和6月龄重等早期生产性能与后期繁殖性能之间的关系进行分析,旨在进一步了解苏太猪的繁殖性能,为苏太后备母猪的选种提供指导。结果表明,第1胎产仔数最少,成活率最低,第4胎成活率最高,至第3胎达较高水平并一直稳定保持至第6胎,第3胎的繁殖性能可以作为淘汰母猪的重要依据。后备猪35日龄断奶重与4月龄重、6月龄重都呈极显著正相关,4月龄重和6月龄重间也具有极显著正相关关系,苏太后备母猪早期生产性能与后期繁殖性能没有显著相关,选择35日龄断奶重小的母猪留种更加经济。
- 孙寿永訾臣刘璐蔡家嘉朱璟黄雪根华金第吴圣龙
- 关键词:苏太猪繁殖性能选种胎次
- 鸡Piwil1基因启动子区转录调控元件的初步分析
- 夏明秀刘璐陈国宏常国斌陈蓉翟飞戴爱琴马腾王洪志徐璐陈静
- 关键词:核心启动子定点突变NF-Y
- 鸡生殖干细胞中Piwi基因的干涉效率
- 2016年
- 【目的】针对禽类干细胞研究中,存在转染效率与干涉效率低下的问题,通过比较不同干涉方式对鸡原始生殖细胞(primordial germ cells,PGCs)中Piwi基因的干涉效果,探讨提高禽类生殖干细胞干涉效率的有效方法。为进一步研究Piwi基因参与干细胞自我更新、RNA沉默以及转录后调控过程等生物学功能研究奠定基础。【方法】根据已建立的原代细胞分离技术,分别从健康鸡群的10日龄和4日龄鸡胚中分离成纤维细胞(chicken embryo fibroblast,CEF)与生殖脊,其中CEF作为PGCs细胞的饲养层,生殖脊经Trypsin-EDTA室温下消化获得PGCs细胞,并通过形态学、化学方法(PAS糖原染色、AKP活性检测)和免疫学方法(TERT抗体、SSEA-1抗体)对其进行鉴定。根据Genbank公布的鸡Piwi基因的m RNA序列(NM_001098852),利用在线软件分别靶向不同位点设计合成得到3个小片段的stealth si RNAs,并将通用无义序列BLOCK-i T^(TM) Alexa Fluor®Red Fluorescent Oligo作为荧光素标记的阴性对照si RNA。同时,在线设计三条干扰序列和一条非特异性阴性对照序列,将其插入线性化空载体p RNA-U6.1,构建不同的sh RNA干涉载体。分别采用不同类型的转染试剂将构建好的si RNA和sh RNA转染PGCs细胞。首先利用通用无义si RNA以及仅带有GFP荧光标记基因的sh RNA载体作为阴性对照,检测si RNA和sh RNA转染效率,确定最佳转染条件。其次,将试验组si RNA和sh RNA在优化条件下转染PGCs细胞,分别收集转染了24、48、72和144 h这4个时间点的细胞,提取各个时间段的总RNA,采用实时荧光定量PCR技术检测Piwi基因m RNA表达水平,并用SPSS软件分析不同处理组的差异。【结果】在对原代分离的PGCs细胞进行了形态学、化学以及免疫学方法鉴定后,确认其所获得的细胞为PGCs细胞且状态良好。根据不同的转染试剂量与si RNA或sh RNA载体量的配比,得出si RNA转染最优条件为si RNA﹕Lipofectamine TM 2
- 李志腾常国斌徐璐马腾陈静陈蓉王洪志刘璐徐琪陈国宏
- 关键词:SHRNAPGCSRNAI
- PPARs在肉鸡不同脂肪组织中差异表达规律
- 1引言高肌内脂肪、低腹脂的体脂分布是肉鸡选育的理想目标.但脂肪在动物机体内的差异分布和调控机理是一直都是尚未解决的科学难题.对于家禽来说,其体脂的增加取决于脂肪细胞的增殖和分化,而脂肪细胞的分化与前体脂肪细胞特异性功能基...
- 刘璐崔焕先赵桂苹郑麦青刘冉冉李庆贺文杰
- 关键词:肉鸡脂肪组织体脂分布PPARS
- 鸡Piwil1基因启动子区转录调控元件的初步分析
- 狼山鸡PiwiLl基因的-1377-268bp区域在COS-7和GC-1细胞中都有不同程度的启动活性,-221+1bp启动子活性几乎完全丧失,在-268--22bp区域有转录因子NF-Y结合位点,认为转录因子NF-Y对启...
- 夏明秀刘璐陈国宏常国斌陈蓉翟飞戴爱琴马腾王洪志徐璐陈静
- 关键词:狼山鸡遗传育种转录调控
- 文献传递