马红武
- 作品数:84 被引量:217H指数:10
- 供职机构:中国科学院天津工业生物技术研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:生物学化学工程自动化与计算机技术轻工技术与工程更多>>
- 一种基于代谢网络分析最小化基因组的方法及其在大肠杆菌中的应用被引量:1
- 2013年
- 最小生命体的合成是合成生物学研究的重要方向。最小化基因组的同时而又不对细胞生长产生影响是代谢工程研究的一个重要目标。文中提出了一种从基因组尺度代谢网络模型出发,通过零通量反应删除及对非必需基因组合删除计算获得基因组最小化代谢网络模型的方法,利用该方法简化了大肠杆菌经典代谢网络模型iAF1260,由起始的1 260个基因简化得到了312个基因,而最优生物质生成速率保持不变。基因组最小化代谢网络模型预测了在细胞正常生长的前提下包含最少基因的代谢途径,为大肠杆菌获得最小基因组的湿实验设计提供了重要参考。
- 汤彬彩郝彤袁倩倩陈涛马红武
- 关键词:大肠杆菌
- 细胞代谢信息与次生产物表达的基础研究
- 元英进葛志强曾安平马红武李春未作军胡宗定
- 为提高植物细胞次生产物的产量,以培养的红豆杉细胞生产紫杉醇为例研究了细胞内外各种因素对细胞代谢信息的影响,确定了真菌和稀土两种诱导子作为信号分子在培养体系中的信号跨膜转导、信号级联放大与紫杉醇合成调控间的关系,确定了信号...
- 关键词:
- 关键词:植物细胞
- 利用丙酮酸合成β-丙氨酸的方法
- 本发明公开了一种丙酮酸合成β‑丙氨酸的新途径,所述方法包括在酶催化下L‑丙氨酸生成β‑丙氨酸的反应,所述的酶选自脱氢酶和氨基变位酶。本发明的途径步骤短、无碳损、无CO<Sub>2</Sub>释放再固定、无转氨反应参与,并...
- 马红武毛雨丰魏凡李金龙罗家豪刘岯袁倩倩
- 多约束代谢网络模型的研究进展被引量:3
- 2022年
- 基于约束的基因组尺度代谢网络模型(genome-scale metabolic models,GEMs)分析已被广泛应用于代谢表型的预测。而实际细胞中代谢速率除计量学约束外,还受到酶资源可用性和反应热力学可行性等其他因素影响,在GEMs中整合酶资源约束或者热力学约束构建多约束代谢网络模型可以进一步缩小优化解空间,提升细胞表型预测的准确性。文中主要对近年来多约束模型的研究进展进行了综述,介绍了不同多约束模型的构建方法,以及其在研究基因敲除影响、预测可行途径和提供代谢瓶颈信息等方面的应用。将多种约束条件进一步与代谢模型整合,可更准确地预测细胞代谢的瓶颈和关键调控改造靶点,从而为工业菌种代谢工程改造提供精确的设计指导。
- 杨雪杨雪毛志涛赵欣王若宇蔡敬一王智文王智文
- 关键词:关键酶
- 利用乙醇醛合成乙酰辅酶A及其衍生产品的新途径
- 本发明公开了一种利用乙醇醛合成乙酰辅酶A及其衍生产品的新途径,所述方法包括在酶催化下乙醇醛和3‑磷酸甘油醛反应生成5‑磷酸阿拉伯糖的反应,所述的酶选自醛缩酶、转醛醇酶、及其同工酶、突变酶。该方法的催化速率较高,反应路线的...
- 马红武杨雪袁倩倩江会锋
- 文献传递
- 改造thrL前导调控元件获取不同灵敏度苏氨酸感应器
- 2016年
- [目的]构建不同灵敏度的苏氨酸感应器,以报告基因的表达表征苏氨酸的变化。[方法]通过克隆苏氨酸操纵子thrL前导调控元件,并与红色荧光蛋白基因rfp偶联构建在高拷贝质粒p LX07上,转化进大肠杆菌DH5α;之后又通过设计引物进行PCR改变thrL前导调控元件上苏氨酸密码子的编码数量;最后进行荧光检测实验确定不同突变菌感应环境中苏氨酸特性的不同。[结果]得到了以红色荧光蛋白基因为报告基因而能感应苏氨酸的大肠杆菌以及分别编码4个和10个苏氨酸密码子的thrL突变菌。三种菌株单位OD下红色荧光蛋白的相对表达量均跨2个浓度梯度而负相关于苏氨酸浓度,同一浓度下正相关于苏氨酸密码子编码数量。[结论]通过构建感应苏氨酸大肠杆菌并改造其thrL前导调控元件获得了负相关于苏氨酸浓度且灵敏度不同的苏氨酸感应器。
- 刘仲祥郑阳阳陈涛马红武
- 关键词:苏氨酸密码子红色荧光蛋白灵敏度
- 应用代谢通量法分析黄原胶发酵实验数据被引量:13
- 1997年
- 首次采用代谢通量分析法对黄原胶发酵过程的实验数据进行了定量分析,根据黄单胞菌的胶合成及糖分解代谢机理求得了产胶期的内部代谢通量分布,得出了得率与呼吸商间的关系式;并根据一定维持机理求得了维持系数、P/O及理论得率等。
- 赵学明马红武唐寅杰
- 关键词:代谢通量分析黄原胶
- 来自Clostridioides difficile的L-谷氨酸-2,3-氨基变位酶在合成β-丙氨酸中的应用
- 本发明公开了一种丙酮酸合成β‑丙氨酸的新途径,所述方法包括在酶催化下L‑丙氨酸生成β‑丙氨酸的反应,所述的酶选自脱氢酶和氨基变位酶。本发明的途径步骤短、无碳损、无CO<Sub>2</Sub>释放再固定、无转氨反应参与,并...
- 马红武毛雨丰魏凡李金龙罗家豪刘岯袁倩倩
- 一种用于设计目标菌株平行构建最小化总基因操作数的方法
- 本发明涉及生物技术领域,具体涉及优化遗传操作排程,公开一种最小化总基因操作的菌株构建排程方法。通过本发明方法确定的不同目标菌株之间的共同基因操可为降低生物铸造厂菌株构建的成本和时间提供了可能性。在构建的初始轮次中增加中间...
- 蔡敬一马红武
- 二氧化碳人工生物转化被引量:5
- 2022年
- 二氧化碳(carbon dioxide,CO_(2))资源化利用是全球可持续发展面临的巨大挑战。自然界生物固碳绿色环保,但能效低、速度慢,难以满足工业生产需求;物理化学固碳效率高,但能耗高、产品单一,如何结合生物、物理与化学技术优势,以二氧化碳为原料进行生物转化利用是当前迫切需要解决的科技难题。本文结合中国科学院天津工业生物技术研究所建所10年来的发展,综述了人工固碳元件、途径与系统的设计与构建等前沿基础领域取得的重要进展,特别是首次实现二氧化碳人工合成淀粉,并对建立二氧化碳人工生物转化技术体系进行了展望。相关进展与展望为助力实现“碳达峰、碳中和”目标提供了新思路。
- 蔡韬刘玉万刘玉万苏浩王钰王国坤张玲玲王国坤盛翔毕昌昊马红武田朝光毕昌昊吴洽庆马红武江会锋田朝光
- 关键词:二氧化碳资源化生物转化