苏谦
- 作品数:9 被引量:73H指数:5
- 供职机构:中国农业大学信息与电气工程学院更多>>
- 发文基金:国家教育部博士点基金国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:理学农业科学生物学更多>>
- 基于生物信息学的植物激素诱导基因分类方法研究
- 苏谦
- 关键词:生物信息学
- 一种鉴别作物种子品种的方法
- 本发明的目的是提供一种用近红外光谱和仿生模式识别快速鉴别作物种子品种的方法。该方法通过对作物种子品种的近红外光谱波长区域建立仿生模式识别模型并通过所述的仿生模式识别模型对作物种子品种样本进行识别。通过近红外光谱,可以得到...
- 安冬苏谦邬文锦
- 文献传递
- 植物激素的受体和诱导基因被引量:7
- 2008年
- 植物激素在植物生长发育的诸多方面发挥着重要作用。近年来,随着植物分子遗传学和分子生物学的发展,有关植物激素信号转导分子机制的研究取得了较大的进展。本文介绍了生长素、赤霉素、脱落酸和乙烯四种植物激素信号转导途径中的受体和诱导基因的研究进展,并展望了用生物信息学方法研究植物激素诱导基因的前景。
- 苏谦安冬王库
- 关键词:植物激素信号转导受体诱导基因生物信息学
- 一种基于间隙谱的生物序列分析方法
- 本发明提供了一种生物序列的分析方法,其包括如下步骤:(1)计算生物序列的间隙谱:计算生物序列中字符之间的距离,分别统计字符之间相同距离的出现频率,构成间隙谱;(2)计算不同生物序列间的相似度;(3)推导不同生物序列的同源...
- 安冬苏谦
- 文献传递
- 基于近红外光谱和仿生模式识别玉米品种快速鉴别方法被引量:26
- 2009年
- 文章提出了一种采用近红外光谱快速鉴别玉米品种的新方法,并对不同品种的玉米种子建立了相应的鉴别模型。对7个玉米品种共140个样本,通过近红外光谱仪扫描获得4000-12000cm^-1波段范围内的光谱数据。为了消除噪声、提高数据处理效率,对原始数据进行了归一化预处理,采用固定尺寸移动窗口渐进因子法(fix-sizedmovingwindowevolvingfactoranalysis)寻找特征波段,使用主成分分析(PCA)方法得到能反映玉米种子99.96%光谱信息的5个主成分,进而利用仿生模式识别(biomimeticpatternrecognition)方法建立玉米品种的鉴别模型。对于每个品种中的20个样本,随机挑选10个样本作为训练样本,其余10个样本作为第一测试集,其他品种共120个样本作为第二测试集。在对第二测试集平均正确拒识率达到99.1%的情况下,对第一测试集中的样本取得了94.3%的平均正确识别率。该方法具有较高的鉴别准确度,可以作为一种快速无损的玉米品种鉴别方法。
- 苏谦邬文锦王红武王库安冬
- 关键词:近红外光谱仿生模式识别玉米
- 基于近红外光谱的商品玉米品种快速鉴别方法被引量:20
- 2010年
- 现有的玉米种子品种鉴别方法检测时间长,费用高,不易大批量快速鉴别。提出了一种基于近红外光谱数据快速鉴别商品玉米品种的新方法。先使用傅里叶变换近红外光谱仪获得从4000到12000cm-1波段范围的37个商品玉米品种籽粒的漫反射光谱数据。对原始光谱进行矢量归一化预处理以消除噪声干扰,为了找到玉米品种籽粒的光谱特征波段,提出一种基于标准差的方法,进而对寻找到的玉米籽粒特征波段光谱做主成分分析(PCA),取能反映玉米品种99.98%光谱信息的前10个主成分。最后使用仿生模式识别(BPR)方法建立了37个玉米品种鉴别模型,对于每个品种的25个样本,随机挑选15个样本作为训练样本,其余10个样本作为第一测试集,其他品种共900个样本作为第二测试集。该鉴别模型对于37个玉米品种的平均正确识别率为94.3%。该方法的进一步研究有利于建立以近红外光谱为基础的物理指纹品种鉴别技术。
- 邬文锦王红武陈绍江郭婷婷王守觉苏谦孙明安冬
- 关键词:近红外光谱仿生模式识别
- 近红外玉米品种鉴别系统预处理和波长选择方法被引量:17
- 2009年
- 以7个品种玉米籽粒的鉴别系统为研究对象,对比研究了6种预处理方法和波长选择对模型鉴别能力的影响。结果表明,在被比较的6种预处理方法中,一阶导数方法能够使模型有更好的鉴别性能。使用一阶导数预处理和全光谱区的模型平均正确识别率和正确拒识率最高,分别为98.6%和98%,有5个品种的模型的正确识别率和正确拒识率都达到了100%。波长选择对一阶导数模型没有明显作用,但能使标准正态变量变换和矢量归一化模型鉴别准确度得到较大提高。
- 郭婷婷邬文锦苏谦王守觉安冬
- 关键词:近红外光谱玉米预处理波长选择
- 转座子在稻瘟菌基因组变异中作用的比较基因组学研究
- <正>稻瘟菌(Magnaporthe oryzae)具有丰富的遗传多样性和快速的致病型变异,说明其基因组存在着活跃的变异机制。由于目前还没有发现稻瘟菌在自然条件下的有性世代,因此推断, 有性繁殖以外的变异是导致稻瘟菌变异...
- 薛敏峰苏谦胡松年彭友良
- 文献传递
- 基于仿生模式识别和近红外光谱的转基因小麦快速鉴别方法被引量:19
- 2010年
- 提出了一种采用近红外光谱快速鉴别转基因小麦种子的方法,对不同品种的9个转基因小麦样品种子分别建立了鉴别模型。对9个小麦样品共225个样本,通过近红外光谱仪扫描获得从4000-12000cm^-1波段范围的光谱数据。为了消除噪声,对原始数据先进行了归一化预处理;然后使用主成分分析(PCA)方法得到能反映小麦种子97.28%光谱信息的前10个主成分,提高了数据处理效率;最后利用仿生模式识别(biomimetic pattern recognition,BPR)方法建立小麦品种的鉴别模型。对于每个样品中的25个样本,随机挑选15个样本作为训练样本,其余10个样本作为第一测试集,其他品种共200个样本作为第二测试集。在对第二测试集平均正确拒识率达到96.7%的情况下,对第一测试集中的样本取得了95.6%的平均正确识别率。实验结果表明,该方法具有较高的鉴别准确度,可以作为一种快速无损的转基因小麦种子鉴别方法。
- 翟亚锋苏谦邬文锦何震天张宗英安家爽董槿邓新韩成贵于嘉林李大伟陈秀兰安冬
- 关键词:近红外光谱仿生模式识别转基因小麦