林政炯 作品数:47 被引量:76 H指数:5 供职机构: 中国科学院生物物理研究所 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 中国科学院科学基金 国家新药研究基金 更多>> 相关领域: 生物学 医药卫生 理学 机械工程 更多>>
甘油醛-3-磷酸脱氢酶结构的保守性 被引量:12 1998年 对中国南海龙虾等五种种属的甘油醛-3-磷酸脱氢酶晶体结构进行了比较,结果显示该酶三维结构的高度保守性。结构类似性包括酶活性中心、与辅酶结合部位、二级结构、结构域组织、亚基排列以及许多有序水结构。位于分子中心的S-loop区存在两种略有差别的构象,分别对应于耐热酶与不耐热酶。对其它细小的结构差别也进行了分析与讨论。 宋时英 郭剑 李军 林政炯关键词:晶体结构 GAPDH 龙虾D-甘油醛-3-磷酸脱氢酶与辅酶类似物结合的晶体学 2000年 与辅酶不同,辅酶类似物ADP-ribose和SNAD与D-甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)的结合不表现协同性.用共晶方法和座滴汽相扩散技术培养出中国南海龙虾(Palinurus versicolor)GAPDH与ADP-ribose和SNAD复合物的晶体.X射线衍射数据分析表明它们的空间群均为C2,并具有类似晶胞参数,分别为 α= 15.280 nm, b= 10.035 nm, c= 12.831 nm, β=110.28°和α=15.341 nm,b=10.051 nm,c=12.844nm,β=110.48°.估算不对称单位合1个分子即4个亚基.与GAPDH全酶和酶蛋白晶体比较,属于不同晶型.这个结果提示着辅酶类似物的结合产生了比较大的酶构象变化,而且这个构象变化不同于辅酶结合引起的构象变化.旋转函数计算结果表明,这两种辅酶类似物复合物的四聚体也具有明显的222分子对称性.它们的结构分析并与全酶和酶蛋白比较将为了解酶的协同性机理提供一些有益的线索. 沈月全 王兆捷 宋时英 周筠梅 林政炯关键词:磷酸脱氢酶 龙虾 GAPDH 晶体学 正交晶型江浙蝮蛇毒碱性磷脂酶A2初步结晶学研究 被引量:2 1996年 The basic phospholipase A2 from the venom of Agkistrodon halys pallas possesses the ability to cause hemolysis in contrast to the other two phospholipase A2 from the same venom. A new form of crystals of this enzyme was grown. The crystals belong to space group of P212121 with unit cell parameters of a=9. 175nm, b=10.080nm , c=2.287nm.The crystals diffract to high resolution, and are suitable for detailed structural studies. The data were collected up to 0.25nm resolutiorl using synchrotron radiation-imaging plate-Weissenberg camera system. Preliminary analysis reveals the presence of two molecules in the asymmetric uint and the molecule may pack with the smallest dimension approximately parallel to the c axis. The new crystal form is more attractive than the monoclinic one previously reported for crystallographic structure determination as it contains fewermolecules in the asymmetric unit. 孟五一 牛秀田 桂璐璐 林政炯 朱洪 周元聪 李根培关键词:江浙蝮蛇毒 溶血作用 结晶学 猪肾氨基酰化酶Ⅰ的初步晶体学研究 被引量:2 1997年 氨基酰化酶Ⅰ(aminoacylase I,ACY-1)(3.5.1.14)主要存在于哺乳动物的肾脏和微生物中,是生物体进行氨基酸代谢时一个重要的水解酶,它可逆地催化酰化L-氨基酸的水解反应.该酶由772个氨基酸组成,分子量为85.500ku,是一个寡聚酶,由两个相同亚基组成,每个亚基含有一个锌离子.猪肾ACY-1与人的ACY-1的核酸序列有88.3%的同源性,氨基酸序列的同源性为87.7%.将猪肾ACY-1的氨基酸序列放在PROSITE数据库中检索,除了几个潜在的蛋白激酶磷酸化的位点和2个可能的N-糖基化位点外,没有其他明显的特征.把猪肾ACY-1的核酸序列和氨基酸序列与EMBL/GenBank和SwissProt Database中的序列进行比较,除了由E.coli表达的酰氨酶(amidase,succinyl-diaminopimelate desuccinylase),没有发现它与其他蛋白质有同源性,Wilbur-Lipman Algorithm统计分析表明,酰氨酶与猪肾ACY-1序列在400个氨基酸长度内有24%的等同性、这些结果提示,ACY-1是一类新的含锌金属蛋白.张艳等人用CD和FTIR谱对它的二级结构进行了研究. 赵海燕 孟五一 林政炯 周海梦关键词:晶体生长 晶体学 水解酶 堆积模型及其应用 Ⅰ.三氯化镧尿素配合物[LaCl_2(urea)_6]·Cl分子结构的推测与测定 1989年 镧系元素具有形成高配位数的特点,但由简单配位形成的多面体,最高配位数只能达到九,例如,[Ln(H_2O)_9]^(+[2])。有些从化学式来看符合九配位的化合物,如LnCl_3(H_2O)_6实际结构是八配位[LnCl_2(H_2O)_6]^(+[3])或六配位[LnCl_3(H_2O)_3]·3H_2O~[4])。这种情况促使我们对另一系列化合物LnCl_3(urea)_6~[5]产生兴趣。我们根据堆积模型推测LaCl_3(urea)_6的实际结构应当是[LaCl_2(urea)_6]^+Cl^-(见图1、2)。培养了这一化合物的单晶,进行了结构测定。本文报道有关结果。 朱占洋 张大川 林政炯 李朴 钟爱珍 王令今 张承曾 魏毅 徐英庭 沈天骥 郭敖凌 李醒夫关键词:镧配合物 尿素 分子结构 中华眼镜蛇细胞毒素晶体生长的研究 1981年 为了用X射线衍射方法测定细胞毒素的三维结构,我们尝试了生长适合于X射线工作的单晶体,用气相扩散方法得到了中华眼镜蛇细胞毒素的两种成分的四种晶型。 林政炯 桂璐璐 梁丽 董北 滕脉坤 龚海韵 杜雨苍 吴文玉 吴翠蓉关键词:晶体生长 细胞毒素 单晶体 模拟萃合物二(二甲基甲酰胺)氯化醋酸铀酰UO_2(OAc)Cl(DMF)_2的结构测定 1989年 根据堆积模型可以推测新的萃取体系,最近,我们发现:不仅在两种萃取剂之间,而且在两种简单的萃取介质之间也可以产生协同效应,并且用实验证实了在醋酸盐与氯化物的混合介质中可以协同萃取铀酰。 张大川 朱占洋 林政炯 于志辉 郭敖凌 冯锡璋 李醒夫关键词:铀酰 眼镜蛇细胞毒素的喇曼光谱研究 中华眼镜蛇细胞毒素有五个组分,它们都由60个氨基酸残基组成,系列结构相近。以SP-Sephadex C-25柱层析法分离而得的CT和CT,为材料,测量了在水和重水溶液中的喇曼光谱,两种毒素的图谱十分相似。酰胺Ⅰ带主峰在1... 孙永泰 桂璐璐 林政炯文献传递 蛋白质晶体学与药物设计 1989年 蛋白质晶体学的发展,产生了根据药物靶分子三维结构知识开展药物设计的新研究方向。本文通过一些有代表性的研究工作,介绍目前了解到的药物分子与靶分子相互作用的结构基础以及以这些结构知识为依据开展药物设计的初步尝试。 林政炯关键词:蛋白 晶体学 药物设计 全文增补中 龙虾D-甘油醛-3-磷酸脱氢酶四方晶型结构 被引量:1 2000年 用座滴汽相扩散法培养出龙虾 (Palinurusversicolor)D 甘油醛 3 磷酸脱氢酶(holo GAPDH)的四方型晶体 ,空间群为P42 12 ,晶胞参数为a =1 5 .49nm ,c =8 0 3nm ,不对称单位含两个亚基 .应用分子置换法测定了 0 .34nm分辨率晶体结构 .最后的晶体学Rfree和R因子分别为 0 2 74和 0 2 6 2 ,与标准键长和键角的均方根偏差分别为 0 0 0 2nm和 2 33°.不对称单位的两个亚基不仅三维结构相似而且平均温度因子也接近 ,这一结果说明以前报道的C2晶型中亚基平均温度因子的显著差别很可能是由于两个亚基处于不同的晶体学环境引起的 ,进一步支持了holo GAPDH分子具有良好的 2 2 2对称性 . 沈月全 宋时英 林政炯关键词:磷酸脱氢酶 龙虾 晶体结构 GAPDH