杨勇
- 作品数：12 被引量：19H指数：2
- 供职机构：中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所合成生物学重点实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划中国科学院知识创新工程更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 独特生境来源的放线菌线型质粒的研究
- 本论文分三部分，针对不同来源的放线菌线型质粒进行了研究。
以代玉梅博士从极端环境土壤样品中分离到的28株含有线型质粒的链霉菌为研究对象，尝试克隆线型质粒新的端粒并了解其特点。本研究对克隆端粒的方法做了改进，包括...
- 杨勇
- 关键词：药用植物放线菌线型质粒克隆抑菌
- 文献传递
- 小葱植物内生链霉菌线型质粒pYY8L的端粒与复制区的克隆和鉴定
- 2010年
- 从小葱植物中分离到一株编号为36R-2-1B的链霉菌菌株,该菌株含有一个约为280kb的线型质粒pYY8L。【目的】克隆、测序和分析pYY8L新的端粒和复制区。【方法】采用改良的"在凝胶中进行DNA碱处理与酶切"的方法来克隆大的线型质粒pYY8L的端粒,通过构建基因组柯斯文库和次级克隆的方法来缩小和鉴定pYY8L的复制区。【结果】在小葱植物内生链霉菌36R-2-1B中检测到约为280kb的线型质粒pYY8L,克隆了pYY8L的端粒。其末端的152bp包含6个小的回文序列,可以形成复杂的二级结构。利用柯斯文库构建、次级克隆和测序获得了4891bp的pYY8L的复制区。该复制区含有6个基因,其中2个与天蓝色链霉菌线型质粒SCP1的复制基因非常相似,但是邻近的重复序列不同。【结论】采用新的改良的方法克隆和鉴定了pYY8L新的端粒和复制区。本文首次报道了植物内生链霉菌线型质粒的端粒和复制基因。
- 杨勇钟莉田新莉成秋香陈振华覃重军
- 关键词：链霉菌线型质粒端粒
- 五个链霉菌线型质粒端粒的克隆和分析被引量：1
- 2010年
- 本室从西藏采集的土壤样品中分离到了一批链霉菌,利用脉冲电泳确定了其中5株链霉菌含有较小的线型质粒。【目的】克隆、测序和分析5个线型质粒的端粒。【方法】采用改良的"在凝胶中进行DNA碱处理和限制性内切酶酶切"的方法来克隆线型质粒的端粒DNA。【结果】克隆和测序了5个线型质粒的端粒DNA。通过与链霉菌典型端粒进行比较,发现这5个新的线型质粒的端粒序列同样含有多个回文序列。但是有的端粒保守的回文序列I不一定能够"折返"与内部序列配对形成"超级发卡"结构,回文序列的"突出环"不一定都为3nt。【结论】采用改良的方法克隆和鉴定了5个线型质粒新的端粒序列,这些新端粒的特征暗示:回文序列I的"折返"和3nt的回文序列的"突出环"不是端粒复制必需的。
- 杨勇代玉梅陈振华覃重军
- 关键词：链霉菌线型质粒端粒
- 一步两酶法制造7－氨基头孢烷酸
- 本发明是一种一步两酶法从头孢菌素C制造7-氨基头孢烷酸的方法。即在一个反应器的水相系统中加入D-氨基酸氧化酶、GL-7ACA酰化酶、双氧水，控制pH7.0-8.5和20-45℃时，在短时间内高生成率地将原料转化为产物。也...
- 魏中荻杨蕴刘金志坤杨勇毛迎辉彭惠林李维泉焦瑞身
- 文献传递
- 重组SARS冠状病毒S蛋白的表达和分离纯化
- 本发明提供了重组SARS冠状病毒S蛋白的表达和分离纯化。SARS病毒S蛋白基因被分段和完整地克隆到不同的细菌表达载体进行了表达。S蛋白基因751－1925bp、2005－3410bp、1－1925bp、32－3659bp...
- 姜卫红杨晟俞浩谢幼华汪垣杨勇张伟郑华宝
- 文献传递
- 链霉菌线型质粒端粒折返序列及其复制基因的多样性
- 链霉菌线型质粒常常含有保守的端粒序列,由tap基因和tpg基因编码的两个蛋白Tap和Tpg与之结合。同时,链霉菌线型质粒的复制区域通常包含一段非编码的重复序列(iterons)和一个邻近的rep基因,在去掉线型质粒的端粒...
- 张冉杨勇覃重军
- 文献传递
- 一步两酶法制造7-氨基头孢烷酸
- 本发明是一种一步两酶法从头孢菌素C制造7-氨基头孢烷酸的方法。即在一个反应器的水相系统中加入D-氨基酸氧化酶、GL-7ACA酰化酶、双氧水，控制pH7.0—8.5和20—45℃时，在短时间内高生成率地将原料转化为产物。也...
- 魏中荻杨蕴刘金志坤杨勇毛迎辉彭惠林李维泉焦瑞身
- 文献传递
- 微生物遗传学链霉菌线型质粒端粒折返序列及其复制基因的多样性
- 链霉菌线型质粒常常含有保守的端粒序列,由 tap 基因和 tpg 基因编码的两个蛋白 Tap 和 Tpg 与之结合。同时,链霉菌线型质粒的复制区域通常包含一段非编码的重复序列(iterons) 和一个邻近的 rep 基因...
- 张冉杨勇覃重军
- 关键词：链霉菌端粒线型质粒
- 文献传递
- 西藏土壤中分离的链霉菌含有丰富的线型和环型质粒
- 2012年
- 【目的】研究极端自然环境对链霉菌线型和环型质粒分布的影响。【方法】从西藏高原采集了20份土壤样品,分离和初步鉴定链霉菌,提取和检测质粒DNA。【结果】从中分离到46株链霉菌,其中有23株菌含有1 4个线型质粒,大小在19 650 kb之间,8个菌株含有1 4个环型质粒,大小在4 80 kb之间。【结论】西藏土壤来源的链霉菌含有大量的、多样的线型质粒和环型质粒,暗示极端环境中诸如强紫外辐射等可能会引发DNA损伤和修复,进而造成质粒的多样性。
- 代玉梅杨勇范云周敏沈美娟钟莉蔡晓布覃重军
- 关键词：链霉菌线型质粒
- 游动双孢菌线型质粒pPR2的全序列测定及分析被引量：2
- 2008年
- 【目的】获得游动双孢菌线型质粒pPR2的全序列,并揭示新型的端粒复制蛋白和可能的中间复制位点。【方法】用分段克隆的方法和序列拼接获得pPR2的全序列,利用软件分析端粒DNA的二级结构和可能的端粒复制蛋白,利用链霉菌原生质体转化的方法检测可能的中间复制的位点。【结果】pPR2全长为15520bp,(G+C)含量为68.1%。其端粒末端反向重复序列的长度为329bp,不能像多数链霉菌的线型质粒那样能形成保守的"折返"的二级结构。pPR2虽然没有参与链霉菌端粒复制的保守的tap/tpg基因,但是pPR2.3c基因编码了一个双结构域蛋白,分别同链霉菌的端粒复制相关蛋白Tap和嗜血杆菌的解旋酶具有相似性。pPR2缺少典型的链霉菌重复序列-复制基因(iteron-rep)区段,将几乎覆盖全长pPR2的两段DNA进行克隆后,不能转化变铅青链霉菌。此外,pPR2基因还编码可能参与线型DNA复制的调控的单链结合蛋白(SSB)和与放线菌质粒接合转移相关的主要蛋白(Tra)。【结论】pPR2是链霉菌之外的放线菌中最小的线型质粒,其序列在游动双孢菌属的线型质粒中是首次报道。pPR2可能具有新型的端粒复制的机制,其中pPR2.2c和pPR2.3c编码可能的端粒复制蛋白。
- 杨勇覃重军
- 关键词：线型质粒全序列端粒
