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李园园
作品数:
34
被引量:27
H指数:3
供职机构:
上海生物信息技术研究中心
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发文基金:
国家自然科学基金
上海市科委重大科技攻关项目
国家高技术研究发展计划
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相关领域:
医药卫生
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农业科学
生物学
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合作作者
陆长德
上海生物信息技术研究中心
李亦学
同济大学生命科学与技术学院
刘伟
上海生物信息技术研究中心
李雪玲
上海生物信息技术研究中心
韦朝春
上海生物信息技术研究中心
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预混合
机构
34篇
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同济大学
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中国科学院大...
作者
34篇
李园园
26篇
陆长德
23篇
李亦学
22篇
刘伟
20篇
韦朝春
20篇
李雪玲
18篇
贾犇
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陆晓婷
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1篇
生物信息学
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6篇
2017
5篇
2015
2篇
2014
1篇
2012
1篇
2011
2篇
2009
1篇
2007
2篇
2006
共
34
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被引量排序
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同时快速恒温检测创伤弧菌和霍乱弧菌的方法、引物及试剂盒
本发明公开了一种同时快速恒温检测创伤弧菌和霍乱弧菌的方法、引物组及试剂盒。所述方法为:从待测样品中提取基因组DNA;以所述基因组DNA为模板,以能扩增创伤弧菌和霍乱弧菌共有特异性序列的引物组为引物,在酶反应体系下进行恒温...
李雪玲
李园园
韦朝春
刘伟
贾犇
陆长德
李亦学
文献传递
基于Bootstrap方法的基因表达谱数据互信息估计研究
2009年
基因调控网络模型为深入理解生命本质提供了一个新的研究框架和平台。作为基因调控网络模型的其中一种,互信息关联网络模型使用熵和互信息描述基因和基因之间的关联。本文描述了用互信息度量基因表达相似性的方法,提出基于Bootstrap的互信息估计算法,并对产生的偏离现象提出了改进策略。实验结果表明,改进的互信息估计方法可以有效提高基因表达相似性估计的精确度。
徐宏强
王新伟
李园园
罗若愚
关键词:
互信息
BOOTSTRAP
生物信息学
沙门氏菌的快速恒温检测方法、引物组及应用
本发明公开了一种针对沙门氏菌的快速恒温检测方法、引物组及试剂盒。所述方法为:从待测样品中提取基因组DNA;以所述基因组DNA为模板,以能扩增沙门氏菌特异性序列的引物组为引物,在酶反应体系下进行恒温扩增反应;通过判断反应结...
李园园
李雪玲
刘伟
韦朝春
贾犇
陆长德
李亦学
文献传递
创伤弧菌的快速恒温检测方法、引物组及试剂盒
本发明公开了一种针对创伤弧菌的快速恒温检测方法、引物组及试剂盒。所述方法为:从待测样品中提取基因组DNA;以所述基因组DNA为模板,以能扩增创伤弧菌特异性序列的引物组为引物,在酶反应体系下进行恒温扩增反应;通过判断反应结...
李园园
李雪玲
刘伟
韦朝春
贾犇
陆长德
李亦学
文献传递
RNA和DNA双外参以及DNA内参实时定量荧光PCR检测方法
本发明公开了一种RNA和DNA双外参以及DNA内参实时定量荧光PCR检测方法,包括步骤:选定外参基因和内参基因;制备外参基因mRNA与DNA的预混合液;收集样品及预混合液的总mRNA和DNA;实时定量荧光PCR,检测外参...
李园园
陆长德
蒋昊韡
文献传递
基于RNA和DNA双外参实时定量PCR的表达校准值的检测方法
本发明公开了一种基于RNA和DNA双外参实时定量荧光PCR策略的基因表达校准值的检测方法,包括:选定外参基因;配制外参基因的RNA与DNA的预混合液;样品中加入预混合液,收集样品RNA和DNA;实时定量荧光PCR,检测待...
陆长德
李园园
文献传递
图形聚类算法的代谢网络模块化分析
被引量:7
2006年
代谢网络的研究是当今生物学研究中的新热点,使用图形聚类算法对代谢网络进行分析研究是一个有力的手段.文中提出了用图形聚类方法挖掘复杂代谢网络中蕴含的功能信息并进行模块相似性分析的方法,从系统生物学角度揭示光合作用的进化.介绍了马尔可夫聚类算法和模拟退火聚类算法两种图形聚类方法;给出了两种方法对叶绿体和蓝细菌的代谢网络进行聚类的结果;定义了模块相似度评价指标,挖掘叶绿体和蓝细菌间保守的功能模块,并对其网络结构进行了比较分析.
侯静
宋安平
王卓
张武
李园园
李亦学
关键词:
代谢网络
RNA和DNA双外参实时定量荧光PCR检测方法及其应用
本发明涉及生物信息学领域,具体涉及一种RNA和DNA双外参实时定量荧光PCR检测方法及其应用,包括如下步骤:选定外参基因;制备外参基因的mRNA与DNA,配制外参基因的mRNA与DNA的预混合液;在抽提样品时加入预混合液...
陆长德
李园园
文献传递
小肠结肠炎耶尔森氏菌的快速恒温检测方法、引物组及试剂盒
本发明公开了一种针对小肠结肠炎耶尔森氏菌的快速恒温检测方法、引物组及试剂盒。所述方法为:从待测样品中提取基因组DNA;以所述基因组DNA为模板,以能扩增小肠结肠炎耶尔森氏菌特异性序列的引物组为引物,在酶反应体系下进行恒温...
陆晓婷
刘伟
李园园
李雪玲
李亦学
韦朝春
贾犇
陆长德
文献传递
快速恒温检测金黄色葡萄球菌的方法、引物及试剂盒
本发明公开了一种快速恒温检测金黄色葡萄球菌的方法、引物组及试剂盒。所述方法为:从待测样品中提取基因组DNA;以所述基因组DNA为模板,以能扩增金黄色葡萄球菌特异性序列的引物组为引物,在酶反应体系下进行恒温扩增反应;通过判...
贾犇
刘伟
李雪玲
李园园
韦朝春
陆长德
李亦学
曹永梅
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