徐国市
- 作品数:5 被引量:16H指数:2
- 供职机构:北京大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家科技基础条件平台建设计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:自动化与计算机技术更多>>
- 一种面向生物基因组可变剪接问题的网络并行求解方案被引量:1
- 2007年
- 生物基因的可变剪接是调节基因表达和产生蛋白质组多样性的重要机制,具有重要的生物学意义.随着生物数据的快速增长,单机计算环境难以满足可变剪接研究所需要的超大计算能力.为了解决这一问题,提出了一种面向生物基因组可变剪接问题的网络并行求解方案.它充分考虑了可变剪接问题的挑战,设计了面向服务的网络资源虚拟化方案,提供了对网络资源一致的选择、访问、监控接口.通过一组API提供了面向用户的应用层支持,屏蔽了访问网络资源的细节,支持用户快速有效的开发应用程序.
- 徐国市鲁发凯许卓群余华山丁文魁
- 关键词:并行计算网络计算可变剪接
- 一种面向用户的Web服务设计策略被引量:8
- 2006年
- 提出了一个适用于计算网格资源包装的Web服务模型,采用工厂/实例模式、以用户为单位管理资源,把局域计算系统的全部资源作为一个整体,按照其为应用领域提供的功能,抽象成若干个符合WSDM规范的可管理资源.它们分别以一个工厂服务的形式,为远程用户管理、访问局域计算系统提供一致的Web界面.工厂动态创建的每个实例分别是应某个用户的要求而配置的专用执行环境,用一个符合WSRF规范的WS资源表示,可以执行任意数量的任务.该Web服务模型在计算网格协同平台Harmonia中被采用,以支持需要循环调用遗留程序的任务流.
- 余华山鲁发凯徐国市王莉春
- 关键词:计算网格WEB
- 网格计算环境下的I/O支持机制的分析、改进与实现被引量:2
- 2004年
- 在广域的网格计算环境下,计算所在站点常常远离相关的数据站点和用户控制台。因而网格计算环境下启动管理远处计算应用就要不可避免地考虑为其提供I/O支持(包括传入输入文件、传出输出文件,标准输入、标准输出和标准出错等3个特殊文件的处理)。网格计算环境的系统,如Condor,Legion和Globus等,都给出了各自的I/O解决方案。这些解决方案满足了启动远程计算对I/O机制的大多数的需要,已获得广泛的使用。但这些解决方案在设计时没有考虑到两个实际中的I/O需要——用户在计算过程中实时的标准输入和中间结果文件的实时传走,因而不能解决这两个实际需要。所以,本文提出了在网格计算环境下远程计算的I/O支持系统的改进的设计方案,并在GlobusToolkit的I/O解决方案基础之上给出了实现的参考方案。改进后的文件I/O机制能够更好地满足了广域的网格计算环境下计算应用的需要。
- 王彬徐国市罗引许卓群丁文魁
- 关键词:I/O网格计算远程计算
- 网格计算的应用支持平台和运行环境分析被引量:5
- 2004年
- 从软件技术的角度,采用多种分类方法,介绍支持科学计算在网格环境运行的主要难点和技术策略,并通过几个相对成熟的网格科学计算应用支持平台和运行环境研究项目探讨现阶段支持网格科学计算的可行方案和计划。
- 陈萍王彬徐国市许卓群
- 关键词:网格技术
- 科学计算网格中远程资源访问和作业级API的关键技术研究
- 随着计算机科学与网络技术的飞速发展,众多科学研究活动越来越依赖计算机强大的计算和存储能力。科学计算成为继理论和实验之后的第三种科学研究手段。许多科学研究领域的计算问题需要协同多个计算资源共同求解。网格技术的发展为科学计算...
- 徐国市
- 关键词:物理资源JAVA