张洛欣
- 作品数：2 被引量：31H指数：2
- 供职机构：新加坡国立大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金河南省医学科技创新人才工程项目博士科研启动基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 寒证基因芯片数据库的纵横分合聚类方法研究被引量：24
- 2002年
- 基因芯片技术是当代生命科学中具有革命性意义的重要研究方法。但是如何应用数理统计方法系统准确地解读该技术惠与我们的大批量整体性基因表达信息 ,乃当今基因芯片研究的一个关键性问题。我们以完成的寒证基因芯片数据库分析为基础 ,前瞻性地提出如下四类相互关联的分析方法 :1 纵向发展的聚类分析 (个体用药前后的连续追踪 ,进而研究家系寒证 ) ;2 横向互比的聚类分析 (应用树状分层图、多维标度和平滑聚类等分析方法 ,考虑横向聚类分析我们已经收集的 10万个证候调查数据 ) ;3 分证候的聚类分析 (如肢冷单个证候疗效的分析 ,藉此可将 39个寒证分证候聚类为六大类并做进一步分析 ) ;4 合寒证聚类分析 (综合因素分析、聚类分析等方法研究寒证主效基因组及其组合模式对基因表达谱的决定性影响 ,寒证证候变量主导因素及其与主效基因组的相互关系等 ,进而“合之病能”)。
- 王米渠张敬远丁维俊李珉王刚张洛欣梁发明张卫吴斌冯韧
- 关键词：基因芯片聚类分析寒证统计分析
- 用特征功能模块法挖掘一个虚寒证家系的基因表达谱被引量：7
- 2010年
- 目的:利用基因表达谱与基因功能知识识别虚寒证相关的差异基因与功能模块,从功能模块水平研究虚寒证发生的分子机制。方法:用Array Tools筛选差异表达基因,并检验分类效果,再利用Gene Ontology(基因本体,GO)工具,将特征基因进行功能注释,选择显著聚集差异表达基因的功能模块;识别其中能够有效分类疾病样本的特征功能模块,并分析它们与虚寒证的关联。结果:用25个差异基因分类样本准确率在93%,用11个功能模块分类样本准确率在87%-100%之间。结论:这些特征功能模块与虚寒证的发生有一定的关联性。基于特征功能模块法研究基因表达谱更有利于对疾病的阐释。
- 杨丽萍黄睿张洛欣王米渠吴伟
- 关键词：基因表达谱基因本体功能模块特征基因
