张新 作品数:75 被引量:684 H指数:14 供职机构: 北京市疾病预防控制中心 更多>> 发文基金: 国家科技重大专项 北京市科技新星计划 艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项 更多>> 相关领域: 医药卫生 农业科学 理学 更多>>
临床分离沙门菌的耐药性及超广谱β-内酰胺酶类耐药基因 被引量:11 2018年 目的研究北京地区2012—2015年沙门菌临床分离株的血清型分布、耐药状况及超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)耐药基因特征。方法采用最小抑菌浓度法测定北京市肠道门诊分离的677株沙门菌株对16种抗菌药物的耐药情况,采用聚合酶链反应(PCR)方法对244株β-内酰胺酶类耐药菌株进行耐药基因检测。结果677株沙门菌分为68种血清型,其中肠炎沙门菌、鼠伤寒沙门菌和山夫登堡沙门菌位居前3位。沙门菌对氨苄西林和阿莫西林/克拉维酸的耐药率分别为42.54%、40.77%,至少耐3种以上抗菌药物的菌株占57.16%。244株对氨苄西林和阿莫西林/克拉维酸耐药的沙门菌,携带至少一种ESBLs基因的菌株174株(71.31%),146株bla_(TEM-1)型,30株bla_(OXA-1)型,18株bla_(CTX-M)型(其中7株bla_(CTX-M-15),6株bla_(CTX-M-55)和5株bla_(CTX-M-14));20株同时携带2种耐药基因。结论该地区沙门菌携带ESBLs耐药基因水平较高,以bla_(TEM-1)为主,同时伴有bla_(OXA-1)和3种bla_(CTX-M)基因亚型,呈现基因多样性。 曲梅 黄瑛 张新 吕冰 钱海坤 王全意关键词:沙门菌 血清型 超广谱Β-内酰胺酶 耐药基因 耐药性 世界卫生组织和世界动物卫生组织禽流感检测流程的比较 2012年 目的了解世界卫生组织(World Health Organization,WHO)和世界动物卫生组织(Office International DesEpizooties,OIE)的禽流感检测流程的差异,旨在相互借鉴,以建立更加完善的检测流程。方法重点比较WHO和OIE推荐的禽流感RT-PCR检测流程中对于初步阳性、可疑和阴性的样本处理程序,以及发出报告的确证程序,来探讨和完善科学的检测模式。结果 WHO的禽流感检测流程中为防止假阴性结果,还需要进行人流感病毒的进一步检测,为防止假阳性,需要进行测序确证;OIE的禽流感检测流程中为防止假阴性结果,还需要再次采样进行确证,为防止假阳性,还需要与病毒分离培养结果综合定论。结论 WHO和OIE的检测流程都能有效的防止假阴性和假阳性的结果产生,但仍需要补充和完善禽流感其他亚型检测流程。 崔淑娟 张新 石伟先 黄芳 王全意关键词:禽流感 WHO OIE 2015年北京一起鼠伤寒沙门菌暴发流行的病原学检测分析 被引量:3 2016年 2015年5月北京一家大型企业发生聚集性腹泻疫情,流行病学调查后收集现场样本,经过实验室检测确认该次疫情为鼠伤寒沙门菌暴发流行。分离到的18株鼠伤寒沙门菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)图谱带型一致,在北京市沙门菌PFGE数据库中未发现相同带型。药物敏感试验结果显示有一株菌株对12种抗生素耐药。这种耐药模式的出现提示需加强耐药监测。 吕冰 贾蕾 张新 曲梅 张海艳 严寒秋 黄瑛 李洁 林长缨 高志勇 梁志超 王全意关键词:鼠伤寒沙门菌 脉冲场凝胶电泳 耐药 北京地区2009年5-12月急性上呼吸道感染病毒病原学调查 被引量:34 2010年 目的:了解2009年5月-12月间北京地区人群急性上呼吸道感染非甲型流感病毒感染的病毒病原学情况,探讨常见急性上呼吸道感染病毒性病原谱的构成,为北京地区急性呼吸道传染病预防策略的制定提供依据。方法:采用多重RT-PCR方法,对626份甲型流感病毒检测阴性的咽拭子样本同时检测人偏肺病毒、腺病毒、人冠状病毒229E/NL63、副流感1、2、3亚型,乙型流感、人冠状病毒OC43/HUK1,鼻病毒A/B、呼吸道合胞病毒A、B亚型等11种常见呼吸道病毒。结果:626份甲型流感阴性样本中检出其他病毒的阳性样本有115份,阳性率为18.37%,其中有2种以上病毒混合感染14份,占阳性样本的12.17%。5、6、7月份以副流感病毒检出率最高,其中15岁以下患者以1型副流感病毒检出阳性率最高,15岁以上患者中以3型副流感病毒检出阳性率最高;8、9、12月份以鼻病毒检出率为最高。结论:副流感病毒与鼻病毒为2009年5-12月间北京地区人群急性上呼吸道感染的非甲型流感的主要病毒性致病原。 吕燕宁 黄芳 高志勇 张新 崔淑娟 郭靖 张代涛 李伟红 曲梅 严寒秋 卢桂兰 王全意关键词:甲型H1N1流感病毒 多重PCR法 病毒病原学 滤膜驱动分离培养法在一起空肠弯曲菌腹泻疫情中的应用 被引量:7 2019年 目的应用滤膜驱动分离培养法对一起腹泻疫情的系列样本进行空肠弯曲菌的检测和培养,并对该方法及其增菌效果进行评价。方法收集一起腹泻疫情的18份粪便标本,采用实时荧光PCR方法为疫情定性为空肠弯曲菌感染,应用滤膜驱动分离培养法对粪便标本进行空肠弯曲菌增菌和分离培养,并对增菌效果进行比较分析。结果采用荧光PCR方法检测到18份标本中有11份空肠弯曲菌核酸阳性,阳性率为61.11%(11/18);应用滤膜驱动分离培养法,对18份标本进行空肠弯曲菌的分离和鉴定,共分到8株菌,分离率为44.44%(8/18);其中3份核酸阳性标本,由于菌液含量低,无法用培养方法检出。11份核酸阳性粪便标本经增菌培养后,Ct平均值由原来的27.44变为23.50,增菌效果显著(P<0.05)。结论采用滤膜驱动分离培养法对粪便标本尤其是冻融粪便进行空肠弯曲菌的增菌和分离培养,能有效提高菌株的分离率,避免资源浪费,可做为常规监测或大规模样本筛检的可行性检测方法。 张新 曲梅 梁志超 林长缨 贾蕾 王全意关键词:空肠弯曲菌 实时荧光PCR 腹泻 北京市348例手足口病临床诊断病例的临床症状与实验室检测分析 被引量:8 2012年 目的:通过对北京市2010年348例手足口病临床诊断病例进行病原学监测,为手足口病预防和控制工作提供实验依据。方法:收集2010年1月-2010年12月间348例手足口病临床诊断病例患者咽拭子标本,进行Realtime-PCR检测,并统计分析。结果:在348例患者的咽拭子标本中,285例检测结果为阳性,其中98例为EV71阳性(34.39%);112例为CoxAl6阳性(39.30%);4例为EV71和CoxA16两种病毒核酸阳性(1.40%);71例为其他肠道病毒阳性(24.91%)。流病学资料中发病季节主要集中于3月-6月份,阳性标本中男女性别比为(1.52∶1),发病年龄主要集中在1岁~6岁儿童(92.98%)。结论:2010年手足口病发病主要集中在3月-6月份,以1-6岁儿童为主,病原为EV71和CoxA16交替流行,以CoxA16略占优势,而EV71感染更易表现为重症。 张新 曲梅 李洁 黄瑛 李爽 李锡太 黎新宇 黄芳 王全意关键词:手足口病 EV71 COXA16 病原学监测 北京地区宋内志贺菌分子流行病学特征分析 被引量:5 2013年 目的了解北京地区宋内志贺菌毒力基因分布及分子流行病学特征。方法采用实时荧光PCR方法检测毒力基因、脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型,多位点序列分型(MLST)及多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)等方法对北京地区2001~2009年50株志贺菌菌株进行分子流行病学特征分析。结果 50株菌中,ipaH、set1、sen三种毒力基因的携带率分别为98%,18%和78%。选取19株流行病学和遗传背景无关的菌株,进行MLST、MLVA与PFGE分型方法的比较,MLST为1个序列型ST152 complex:adk(11)、fumC(63)、gyrB(7)、icd(1)、mdh(14)、purA(7)、recA(7);MLVA被分成15个型别,D值为0.9708;PFGE分成12个型别,D值为0.9532。MLVA初筛得到的8个可变数目串联重复(VNTR)位点用于扩大菌株分析,发现50株志贺菌被分为21个MLVA的型别,TS002和TS001为主要型别。结论北京地区近年来流行的宋内志贺菌存在毒力基因的丢失,MLVA分子型别复杂,存在多克隆来源,提示需要进行连续系统的分子流行病学监测。 刘桂荣 曲梅 张新 吴晓娜 李锡太 贾蕾 严寒秋 梁志超 王全意关键词:宋内志贺菌 分子分型 多位点序列分型 北京市2007-2014年O1群霍乱弧菌病原学特征分析 被引量:10 2016年 目的分析北京市2007-2014年分离到的O1群霍乱弧菌的病原学特征。方法对霍乱感染者、水产品和外环境来源的O1群霍乱弧菌,采用血清分型、荧光定量PCR检测霍乱毒素基因ctxAB、K-B法8种药物(多西环素、环丙沙星、诺氟沙星、复方新诺明、丁胺卡那霉素、庆大霉素、头孢曲松和呋喃妥因)进行敏感性试验和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型方法,研究不同来源菌株在各方面的异同。结果北京市2007-2014年共分离得到不同来源O1群霍乱弧菌125株(感染者75株,水产品37株,外环境涂抹13株),小川型96株,稻叶型29株。其中16株菌ctxAB基因阳性(感染者5株,水产品9株,外环境涂抹2株),其他ctxAB基因阴性(感染者70株,水产品28株,外环境涂抹11株);小川型ctxAB基因阴性霍乱弧菌占70.40%(88/125);125株菌对庆大霉素、头孢曲松和呋喃妥因完全敏感,其中25株菌(感染者10株,水产品11株,外环境4株)对5种抗菌药物出现7种耐药型别,有6株来自感染者和水产品的菌株产生双重或三重耐药,而4株外环境的耐药菌株均为单一耐药。PFGE分子分型结果显示,125株菌株经NotⅠ酶切后可分为91种型别,7起聚集性疫情中分离到的37株菌全部为小川型,可分为6个聚类,29株稻叶型菌株可分为3个聚类。结论北京市2007-2014年O1群霍乱弧菌病原学特征复杂多样,在产毒株引起霍乱弧菌疫情减少的情况下,应关注非产毒霍乱弧菌导致的疫情。 黄瑛 赵剑虹 严寒秋 曲梅 张新 吕冰 梁志超 阚飙 陈丽娟 王全意关键词:霍乱弧菌 药物敏感试验 毒力基因 脉冲场凝胶电泳 2008-2018年北京市伤寒、副伤寒沙门菌病原学特征 被引量:11 2019年 目的了解北京市伤寒、副伤寒沙门菌流行特征、耐药及分子分型特点,为伤寒、副伤寒防制工作提供依据。方法通过对2008-2018年北京市肠道门诊监测系统收集到的65株伤寒、副伤寒沙门菌,采用最小抑菌浓度(minimal inhibition concentration,MIC)法进行16种抗生素药敏试验;采用脉冲场凝胶电泳PFGE方法进行分子分型研究。结果 65株菌包含4种血清型:伤寒沙门菌24株,占36.9%,甲型副伤寒沙门菌7株,占10.8%,乙型副伤寒沙门菌20株,占30.8%,丙型副伤寒沙门菌14株,占21.5%。随着年代的推移,会出现血清型的交替变迁,2013年以后,以伤寒和乙型副伤寒沙门菌为主。高发年龄组为0~10岁组和31~40岁年龄组。65株菌对阿莫西林-克拉维酸、强力霉素、阿奇霉素和亚胺培南4种抗生素全部敏感,对其他12种抗生素有不同程度的耐药。对磺胺异噁唑、萘啶酸、链霉素和氨苄西林等经典抗生素的耐药性有上升趋势,对头孢菌素和三代氟喹诺酮类环丙沙星不同血清型间耐药性存在差异,多重耐药率为10.8%(7/65)。58株伤寒、副伤寒沙门菌分成34种PFGE型别,带型分散。除2018年一起输入性伤寒暴发识别出9株菌为同一带型,其余每种带型菌株数1~3株不等,相似度为32.2%~100.0%。结论 2008-2018年,北京市伤寒、副伤寒沙门菌维持在较低水平,血清型正逐步转变成以伤寒和乙型副伤寒为主。不同血清型间抗生素耐药程度不同,临床应合理用药。PFGE型别多样,未出现优势克隆群。 曲梅 黄瑛 张新 吕冰 贾蕾 田祎 王全意关键词:伤寒 副伤寒 脉冲场凝胶电泳 分子分型 北京地区腹泻病患者致泻性大肠埃希菌感染类型及其流行特征 被引量:62 2014年 目的:了解北京地区腹泻人群中致泻性大肠埃希菌(DEC)毒力基因的分布及流行特征。方法对2012-2013年监测医院的腹泻患者粪便样本进行分离培养,再采用实时荧光PCR检测毒力基因。结果6370份粪便标本有253份阳性,共分离到DEC 262株,阳性检出率为4.0%(253/6370),9份标本发现两种不同型别的DEC混合感染。肠致病性大肠埃希菌(EPEC)为42.8%,其中非典型EPEC占42.0%,典型EPEC占0.8%;肠产毒性大肠埃希菌(ETEC)为38.9%,其中耐热肠毒素基因st阳性占24.8%,不耐热型肠毒素基因lt阳性占9.9%,st和lt均阳性占4.2%;肠聚集性大肠埃希菌(EAEC)为15.3%;肠侵袭性大肠埃希菌(EIEC)为2.7%;检出1株产志贺毒素大肠埃希菌(STEC),血清型为O26∶K60。ETEC感染具有明显的年龄分布特征;各型DEC全年均有检出,且呈季节性变化。结论北京地区腹泻病患者DEC感染类型以EPEC和ETEC为主,且EPEC分离株多为非典型,并存在混合感染,不同型别DEC感染具有年龄和季节性分布特征。 曲梅 张新 钱海坤 吕冰 黄瑛 严寒秋 梁志超 贾蕾 王全意关键词:致泻性大肠埃希菌 毒力基因 实时荧光PCR