卢欣华
- 作品数：13 被引量：37H指数：4
- 供职机构：吉林大学计算机科学与技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金吉林省科技发展计划基金国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术生物学天文地球农业科学更多>>
- Analog-Cell:一种新的电子细胞图形模型被引量：8
- 2007年
- 本文提出了一种新的模拟基因表达过程的电子细胞图形模型Analog-Cell,给出了实现该模型设计的主要算法和模拟结果.与其它电子细胞模型相比,Analog-Cell特点在于含有丰富的图像信息,并在分子水平上模拟了基因突变.
- 卢欣华孙吉贵
- 关键词：生物信息学电子细胞人工生命
- 电子细胞中的基因表达调控研究
- 2008年
- 基因表达调控决定了基因组中遗传信息表达为影响细胞生命活动的蛋白质组的数量、成分和功能,现有的电子细胞模型对基因表达调控模拟得较少。提出Analog-Cell电子细胞模型,通过定义反应过程中的调节因子和酶以及制定合理的反应规则,有效地模拟了基因表达中主要的调控机制,真实地再现了细胞内基因表达这一生命活动,并得到了比较理想的模拟结果。
- 卢欣华孙吉贵
- 关键词：电子细胞人工生命基因表达调控生物信息学
- 模拟细胞生命活动的电子细胞
- ＜正＞1 引言电子细胞（E-Cell,Electronic Cell）亦称虚拟细胞（Virtual Cell）、人工细胞,是人工生命的重要研究内容之一。它在计算机上构建一个虚拟的细胞体系,模拟真实细胞的结构、物质组成、生...
- 卢欣华孙吉贵
- 文献传递
- 电子细胞中前体mRNA加工过程的模拟与研究
- 2012年
- 前体mRNA的加工是基因表达过程中必需的一个步骤,是调节基因表达和产生具有生化活性的蛋白质的重要机制,现有的电子细胞模型对前体mRNA的加工过程模拟得较少。自主开发设计的Analog-Cell电子细胞模型定义了反应过程中的反应规则,提出了模拟前体mRNA加工过程的多个算法,真实地再现了基因表达这一细胞内重要的生命活动,并得到了比较理想的模拟结果。
- 王玉贤卢欣华
- 关键词：电子细胞MRNA生物信息学
- 人工生命：计算机与生物学交叉的前沿学科被引量：4
- 2008年
- 人工生命是具有生命特征的人工系统,是探索生命复杂性的一门新兴交叉性前沿学科。它试图在计算机或其他人工媒介上,以综合的方法研究具有生命本质特征的复杂系统的动态发展过程。本文详细介绍了人工生命的概念、产生过程、发展历史、基本思想以及目前主要的研究方向,指出人工生命为人们揭示自然生命的最本质特征和演化的最基本规律提供了新思路和新方法。
- 卢欣华孙吉贵韩霄松行荣
- 关键词：人工生命细胞自动机生命科学突现
- COM组件模型及其应用实例研究
- 该论文进行的研究是实际应用项目'JIT DSl.0 ' (JIT DSl.0 吉大正元桌面安全套件第一版,以下简称DS,DesktOpSecurity)的主要内容.这个应用软件系统运行于Windows系列操作系统平台(即...
- 卢欣华
- 关键词：EXPLORER加密软件系统COM技术
- 文献传递
- Analog-Cell电子细胞模型中基于并发约束的随机模型构架被引量：1
- 2008年
- 提出了一种在电子细胞模型中基于并发约束的随机模型架构方法,应用该架构建立了模拟基因表达过程的电子细胞模型Analog-Cell。模拟结果表明Analog-Cell这种基于并发约束的随机模型构架能更准确地反映出生物系统的真实性,相比其他电子细胞模型含有更丰富的图像信息,能更清晰地观察细胞内基因表达的全过程,具有良好的应用前景。
- 卢欣华孙吉贵行荣韩霄松
- 关键词：电子细胞生物信息学
- 电子细胞模型Analog-Cell中基因表达调控的模拟实现
- 2011年
- 电子细胞模型的研究是人工生命的重要研究领域之一,Analog-Cell是国内第1个电子细胞图形模型,用于在分子水平上图形化的模拟真核细胞的基因表达过程.扩展的Analog-Cell添加了在基因表达过程中起重要作用的酶和调控因子,利用状态控制机制,设计并实现了转录、mRNA的加工和翻译3个阶段中基因表达调控的主要反应的算法,并结合模拟示例展示了这些算法的运行结果.模拟实验结果表明,设计的算法符合生物学原理,使Analog-Cell具备了一定的图形化模拟基因表达调控反应的能力.最后,指出了上述工作给Analog-Cell带来的新优势,并对下一步工作进行了展望.
- 韩霄松裴志利卢欣华纪兆华梁艳春
- 关键词：生物信息学人工生命电子细胞基因表达基因表达调控
- 真核生物启动子的预测技术被引量：11
- 2009年
- 启动子是基因表达过程中非常重要的调控序列,是影响基因能否转录的重要功能单位之一,真核生物的启动子预测已经成为生物信息学研究的热点。将结合人工神经网络、支持向量机、二次判别分析和位置权值矩阵技术,对国内外真核生物启动子的预测研究进行介绍,并在最后采用合适的技术应用到模拟真核生物基因表达过程的电子细胞模型Analog-Cell中。
- 孙吉贵韩霄松卢欣华行荣仲洋
- 关键词：启动子人工神经网络支持向量机生物信息学
- 电子细胞Analog-Cell的并发机制被引量：1
- 2009年
- 结合并发约束理论提出了并发Analog-Cell模型框架;基于扩展的并发约束理论,提出了并发Analog-Cell中定量的随机控制机制以及模拟细胞中RNA聚合酶介导转录起始过程的算法模型,可有效地避免系统中随机错误的发生并提高运行效率;最后,提出了并发Analog-Cell模型中DNA转录过程的模拟算法.
- 孙吉贵行荣卢欣华韩霄松
- 关键词：电子细胞
