单秋甫
- 作品数：4 被引量：4H指数：1
- 供职机构：云南民族大学电气信息工程学院更多>>
- 发文基金：云南省应用基础研究基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 两种模式生物核小体定位比较研究
- 2014年
- 在对两种模式生物酵母与果蝇胚胎期核小体定位进行研究时,发现不同物种间以及同一物种中不同表达模式基因上的核小体分布呈现出差显著异性。在总体上,转录起始位点附近的酵母核小体NFR区域比果蝇的NFR短。经基因中心对齐后,酵母与果蝇胚胎期沉默型基因的核小体缺失区域的两个边界中间处共同呈现了一个明确有着均匀间隔的核小体数n,且随着基因长度L的变长其周期性特性逐渐变模糊,但果蝇的图谱表现的更为复杂。结果表明,从单细胞酵母生物到多细胞果蝇生物间基因组的进化过程中,核小体组织的演化既有变异性,也具有保守性。
- 卢英丰继华单秋甫陈攀峰单增辉
- 关键词：核小体定位
- 基于核小体位置预测的酵母进化印迹研究被引量：3
- 2013年
- 在利用核小体定位实验数据训练支持向量机(SVM)对任意酵母DNA序列的核小体形成能力进行预测的过程中,发现染色质结构对基因组DNA分子进化过程有着显著影响。我们观察到核小体DNA比连接DNA的平均预测准确率低15%,这种普遍存在的局部预测准确率差异性代表了酵母核小体定位的进化印迹(Evolutionary footprint),它揭示了核小体组织在基因组的整个进化过程中所具有的保守性。
- 肖建平丰继华卢英单秋甫
- 关键词：核小体转录起始位点
- 酵母和果蝇胚胎期核小体定位模式比较研究
- 2014年
- 在进行酵母与果蝇胚胎期核小体定位研究时,发现不同物种或同一物种中不同表达模式基因与全体基因的排列比较中,核小体分布呈现出差异性。我们观察到酵母全体基因中核小体排列对核小体缺失区域(NFR)的基因3’端比基因5’端的影响小,而果蝇中对两者的影响却是一样的。且酵母与果蝇胚胎期沉默型基因中NFR的两个边界之间的核小体排列都出现了相同规律。它揭示了核小体组织在基因组的整个进化过程中具有的前进性,同时也具有保守性。
- 卢英丰继华单秋甫
- 关键词：酵母核小体定位
- 果蝇胚胎期不同表达模式基因转录起始位点上游核小体的定位被引量：1
- 2014年
- 在研究果蝇胚胎期核小体定位时,发现不同表达模式基因上的核小体定位特征有着很大的差异。与以往研究结果不同的是,在果蝇胚胎期限制性表达基因的转录起始位点上游-1核小体位置上存在着H2A.Z核小体。有趣的是,与单细胞酵母基因上的核小体定位相比较发现,果蝇胚胎期限制性表达基因上的核小体排列与酵母极其相似。
- 单秋甫丰继华卢英单增辉陈攀峰
- 关键词：核小体转录起始位点
