陈军
- 作品数：43 被引量：36H指数：5
- 供职机构：厦门大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金福建省农科院青年科技人才创新基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学自动化与计算机技术医药卫生农业科学更多>>
- 大规模GO注释的生物信息学流程被引量：9
- 2012年
- 随着新一代测序技术的不断发展,海量的序列数据将为生物学研究者挖掘基因信息提供巨大的资源.信息挖掘的一项重要工作是对序列进行功能注释,其中最重要的功能注释方式是基因本体论(Gene Ontology,GO)的注释.利用生物信息学方法和软件工具集成了针对EST序列的大规模GO注释流程(large-scale GO annotation pipeline,LSGAP).该流程集合了BLAST、B2g4pipe以及Wego等软件和Swissprot、Nr或Interpro等常用蛋白数据库.用户可以将EST序列通过此流程最终获得可视化的GO分类统计图表,直观地显示基因在不同过程中的参与情况.为了验证LSGAP的准确性,对2007年发表的美洲牡蛎(Crassostrea Virginica)的EST序列进行了LSGAP分析,结果表明GO分析非常准确有效.通过与Blast2go和GoBlast等GO注释软件进行比较,LSGAP流程具有可以本地化运行BLAST、对硬件要求低和运行时间短等诸多优势,因此LSGAP流程是科研人员进行基因功能挖掘的有效工具.
- 黄子夏柯才焕陈军
- 关键词：基因功能生物信息学
- 浑身是宝的海绵动物
- 2020年
- 同学们,你还记得动画片《海绵宝宝》里那个方方正正、笑料不断的"麻烦精"海绵宝宝吗?说起来,现实中的海绵动物并不长那样,海绵宝宝的原型更贴近平时生活中妈妈们用来洗碗的人造化工海绵,但它们只是模拟了海绵动物的骨架。今天我们就来了解一下这个鲜为人知却浑身是宝的海绵动物。
- 欧徽龙陈军
- 关键词：海绵动物宝宝动画片
- 利用流式细胞仪技术研究杂色鲍血细胞的吞噬率被引量：5
- 2010年
- 利用流式细胞仪(FCM)技术检测了杂色鲍血细胞在体内和体外对不同含量荧光微球悬液的吞噬率.其结果表明体内注射法测定吞噬率的方法不可行.在体外吞噬中,当荧光微球含量为血细胞含量的68.2倍时吞噬率达98.43%±1.27%,随着荧光微球含量的降低血细胞吞噬率也随着降低.当荧光微球含量为血细胞含量的6.82倍时吞噬率为63.45%±6.05%,以这一含量进行血细胞吞噬率的测定比较恰当.利用这一含量测定了正常鲍与经过低盐(S=18)海水胁迫24 h后鲍的血细胞吞噬率的变化,正常鲍的吞噬率为68.71%±10.05%,经低盐海水胁迫后鲍的吞噬率为49.49%±10.18%,吞噬率出现了显著的下降(p<0.05).实验结果表明利用流式细胞仪技术相比传统的显微镜镜检记数法检测杂色鲍血细胞吞噬率更为方便可靠.
- 李进寿陈军唐艳霞柯才焕
- 关键词：海洋生物学杂色鲍
- 一种基因Hdiv-SARP19-I1及其重组蛋白的抗菌应用
- 一种基因Hdiv‑SARP19‑I1及其重组蛋白的抗菌应用，涉及基因工程。一种Hdiv‑SARP19‑I1基因的蛋白编码区，其核酸序列如序列表SEQ ID No.1所示；Hdiv‑SARP19‑I1基因的序列，其核酸序列...
- 陈军柯才焕林泽丁少雄
- 文献传递
- 一种海绵动物水溶性肽类的制备方法
- 一种海绵动物水溶性肽类的制备方法，涉及一种肽类制备方法。将海绵动物破碎，用提取缓冲液浸泡，超声，离心后获得可溶解蛋白/肽类水溶液，过滤后进行吸附/解吸附，获得脱盐后的肽类第一级粗提物；将肽类第一级粗提物经旋转蒸发浓缩后进...
- 陈军丁少雄王德祥贺腾飞罗联忠赵晶
- 文献传递
- 流式细胞术检测杂色鲍血细胞的吞噬活力
- 运用流式细胞仪技术(FCM)检测了杂色鲍血细胞在体内和体外对不同浓度荧光微球悬液的吞噬率(%)。证明体内注射法测定吞噬率的方法不可行。体外吞噬中,荧光微球为血细胞密度的68.2倍时吞噬率达98.43±1.27,随着荧光微...
- 李进寿陈军柯才焕
- 关键词：流式细胞术杂色鲍血细胞胁迫
- 文献传递
- 一种海绵稚体原位培育的方法
- 本发明公开了一种海绵稚体原位培育的方法，首先原位使用网兜裹住成熟海绵母体收集海绵幼体，将幼体置于培养皿中进行自然附着；然后室内倒扣培育14～15天，得到生长出完整出水管的海绵幼体；接着以60～80目的网兜将塑料网片、载体...
- 陈军欧徽龙王德祥丁少雄
- 文献传递
- 一种浴海绵止血材料及其制备方法和应用
- 本发明公开了一种浴海绵止血材料及其制备方法和应用。体外凝血实验和家兔颈动脉破裂止血实验证明本发明的海绵质粉末F‑agent具有显著的体外凝血效果和优异的在体止血效果。从不同来源和不同储存时间的浴海绵制备获得的F‑agen...
- 陈军欧徽龙王青华闫国良陈铭
- 文献传递
- 一种海绵稚体的室内培养方法
- 本发明公开了一种海绵稚体的室内培养方法，包括如下步骤：1)收集自然排放的海绵幼体，海水清洗后，放入室内培养装置内，所述培养装置内具有海水以及浸泡于海水中的60目‑100目筛绢；2)；水温调节至24‑26℃，盐度调节为31...
- 陈军李准飞陈铭
- 叶片山海绵水溶性活性产物的大孔吸附树脂分离及其抗肿瘤活性
- 2016年
- 海绵拥有丰富的生物活性产物,以叶片山海绵(Mycale phyllophila)为材料,建立了以DA201-C大孔吸附树脂为核心的从水提液中提取活性产物的方法.以Lowry法跟踪得率,此方法对小分子肽类的回收率约为57%;粗提物的主要成分为肽类,约占89%.细胞活性检测表明粗提物对C6神经胶质瘤细胞、A2780-CP卵巢癌顺铂耐药细胞和HepG2肝癌细胞具有明显的抑制作用.本工作为深入研究叶片山海绵水溶性活性产物中的抗肿瘤组分奠定了基础.
- 贺腾飞罗联忠陈军王德祥丁少雄
- 关键词：海绵大孔吸附树脂肽类抗肿瘤活性
