武晓璐
- 作品数:6 被引量:9H指数:2
- 供职机构:西南林业大学园林学院更多>>
- 发文基金:云南省应用基础研究计划面上项目云南省应用基础研究基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学环境科学与工程更多>>
- 拟南芥成花调控LFY基因的选择性剪接(英文)
- 2012年
- 为研究拟南芥成花调控基因LFY,我们采用RT-PCR方法分离克隆了三种选择性剪接的片段,分别命名为LFY1239,LFY1263和LFY1275。序列分析表明LFY1263包含一个大小为1 263bp的开放阅读框,与之前报道的LFY基因片段大小相同,而LFY1239在第一外显子的3′端缺失了36bp,LFY1275在第一内含子的3′末端插入了12bp。对几种片段表达部位的分析显示,LFY1239只能在营养生长期的莲座叶中表达,而LFY1263和LFY1275在营养生长期和花期的花器官和莲座叶中都可以检测到,并且,LFY1263呈现出主导地位,LFY1275与LFY1263表达的比例表现为花器官高于莲座叶,该比例的变化可能预示着与成花调控有关。
- 于丽霞姚有林武晓璐汤晓倩鄢波
- 关键词:选择性剪接
- 茭白lea3基因全长cDNA的分离克隆及序列分析被引量:2
- 2010年
- 第3组胚胎晚期丰富蛋白(LEA3)是一组在胚胎发育后期丰富表达的蛋白,同时它还受水分胁迫和ABA的诱导,与植物抗旱性密切相关。本研究以经过干旱处理的茭白幼苗的mRNA为模板,根据禾本科lea3基因的保守序列设计简并引物进行RT-PCR,得到lea3基因的部分序列,然后结合RACE方法获得全基因两端的序列,经拼接得出茭白lea3基因的全长cDNA,序列分析结果表明该基因的开放阅读框为666bp,编码221个氨基酸,包含2个LEA3基元序列。通过与已报道的LEA3蛋白序列比较,与禾本科中水稻、大麦、小麦、雀麦、玉米的同源性分别为51.2%、41.0%、41.1%、42.0%和40.5%。最终得出结论,茭白lea3基因具有已知物种lea3基因的特征,可以为该基因的功能研究提供参考。目前,该基因已在GenBank中登录,编号为GQ494017。
- 于丽霞汤晓倩武晓璐鄢波
- 关键词:茭白克隆
- 一种新的用于提高lea3基因扩增特异性和产量的增强剂(英文)被引量:2
- 2010年
- 在对目的DNA序列尤其是高GC含量的片段进行PCR扩增的时候,经常需要对一些试验条件进行优化。在一定条件下,二甲基亚砜、甲酰胺、甘油、NP-40和Tween20等可以在某种程度上提高PCR的特异性和效率。我们在对禾本科lea3基因进行分离克隆时发现了一种新的可以提高PCR产量和特异性的物质——极高热稳定单链结合蛋白(ETSSB),研究发现在每50μlPCR反应体系中加入200ng的ETSSB,可以有效地抑制DNA片段的非特异性条带的产生,并可以提高目的片段的产量。
- 于丽霞武晓璐汤晓倩鄢波
- 关键词:高GC含量聚合酶链式反应
- 禾本科植物LEA3基因克隆-q结构特征的研究
- A3基因是与高等植物抵御干旱胁迫密切相关的一类基因。根据GenBank中已登录的禾本科12个LEA3同源基因保守区设计一对简并引物,并比较了不同浓度的6种添加剂对反应结果的影响,确定8%DMSO为最优的反应体系。建立了禾...
- 汤晓倩武晓璐于丽霞鄢波
- 关键词:禾本科
- 第三组胚胎晚期丰富蛋白lea3基因研究概述被引量:6
- 2010年
- 晚期胚胎富集蛋白(late embryogenesis abundant protein,LEA蛋白)是在高等植物胚胎发育晚期大量积累的一类蛋白,根据其结构特点LEA蛋白一般分为6组,其中第3组LEA蛋白(LEA3)含有11个氨基酸串联重复的基元序列,可以形成α-螺旋结构,能在干旱胁迫的环境中保护生物大分子,减轻水份胁迫对植物造成的伤害,与植物抗逆性密切相关。该文就lea3基因及其蛋白的结构、功能、基因表达和应用等进行简要的综述,并对lea3基因及其蛋白今后的研究方向和应用前景进行了展望。
- 汤晓倩于丽霞武晓璐鄢波
- 关键词:逆境胁迫
- 拟南芥SDIR1基因转录的选择性剪接
- 2010年
- 采用PCR及RT-PCR法分别克隆了拟南芥SDIR1基因的DNA和cDNA序列。根据序列比对分析结果,发现了3种不同的转录本,提示SDIR1基因的转录中存在选择性剪接。3种转录本的长度分别为822bp、691bp和666bp,依次命名为:SDIR1-822、SDIR1-691、SDIR1-666。与SDIR1基因的DNA序列及已报道的SDIR1cDNA序列比较,除转录本SDIR1-822包含了完整的编码序列外,其余2种转录本的编码序列都存在不同长度的缺失。其中,SDIR1-691缺失了131bp的片段:第2外显子3′端缺失33bp,第3外显子53bp全部缺失,第4外显子5′端缺失45bp;转录本SDIR1-666缺失了156bp的片段:第3外显子3′端缺失18bp,第4外显子5′端缺失138bp。进而随机挑取101个克隆子对三种转录本的表达比例进行初步分析,结果表明3种分子的比值为SDIR1-822:SDIR1-691:SDIR1-666=26.00:1.33:1.00,反映出SDIR1基因不同转录本在拟南芥中的相对表达量。
- 武晓璐汤晓倩于丽霞姚有林鄢波
- 关键词:选择性剪接拟南芥