楚亚男
- 作品数：13 被引量：1H指数：1
- 供职机构：中国科学院北京基因组研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国科学院科研装备研制项目国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学自动化与计算机技术更多>>
- 用于类风湿关节炎炎症状态评估及预后评价的肠道微生物菌群
- 本发明提供用于类风湿关节炎炎症状态评估及预后评价的肠道微生物菌群，所述肠道微生物菌群包括肠道产丁酸菌和肠道非发酵菌两类肠道菌；其中，所述肠道产丁酸菌包括12个产丁酸菌菌属的微生物，所述肠道非发酵菌包括33个非发酵菌菌属的...
- 楚亚男康禹孟庆仁于军石兴邵长君王建陈婧
- 文献传递
- 一种痰液微生物的快速提纯试剂及其应用
- 本发明提出一种痰液微生物的快速提纯试剂，包括液化液、细胞裂解液、核酸外切酶缓冲液；所述细胞裂解液含有胍盐和表面活性剂，所述胍盐在细胞裂解液中的浓度为1～3mol/L。本发明还提出所述痰液微生物的快速提纯试剂的应用。本发明...
- 邵长君康禹石兴于军林强王建楚亚男付荣荣
- 文献传递
- 类SCC样甲氧西林敏感性金黄色葡萄球菌的基因组学分析
- 2013年
- 金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,S.aureus),作为一种常见的致病菌常可导致严重感染性疾病.金黄色葡萄球菌的主要特点是易产生耐药性.临床上运用多重PCR方法对S.aureus耐药菌株进行分型.SCC作为一种mecA基因的转运载体,介导金黄色葡萄球菌产生耐药性.本研究报道了一株新甲氧西林敏感性金黄色葡萄球菌的全基因组序列信息,即类SCC样MSSA463菌株,经多重PCR方法,该菌株被误鉴定为耐甲氧西林金黄色葡萄球菌,结果与药敏结果相冲突.为此,运用焦磷酸测序方法完成了该菌株的全基因组测序,并与已知金黄色葡萄球菌的基因组序列信息不同,发现可读框(CZ049;AB037671)存在于attL,attR反向重复序列的临近下游.这些结果提示,在金黄色葡萄球菌与其他微生物之间可能存在一种水平基因转移,并改变了金黄色葡萄球菌对药物的敏感性,推测attL,attR反向重复序列可能作为外源性基因的插入部位而存在.
- 李德志楚亚男任鲁风李欣刚袁丽娜康禹张伟杨宇王绪敏Baillie J.Kenneth于军高占成
- 关键词：金黄色葡萄球菌基因组学焦磷酸测序
- 肺炎克雷伯菌临床分离株泛基因组学研究
- 目的收集足够的DNA序列信息并且对其遗传特征进行系统分析,从而探索不同临床表现下潜伏的基因组特征及致病机制。方法共收集24株肺炎克雷伯菌(KPN)。运用第二代测序平台进行全基因组测序。SOAPdenovo初步拼接序列;G...
- 张奕杰康禹任鲁风陈愉生袁丽娜安树昌楚亚男张伟胡成平杜娟万欢英魏立平王思勤杨敬平于军高占成
- 用于体液细菌与细胞分离的芯片、制作方法及其使用方法
- 本发明涉及生命科学技术领域，尤其涉及一种用于体液细菌与细胞分离的芯片、制作方法及其使用方法；芯片包括：上板、下板以及微孔膜，下板、微孔膜以及上板由下至上依次叠放，下板设有进液通道，上板设有收集通道，进液通道与收集通道通过...
- 邵长君康禹石兴楚亚男王建孟庆仁于军
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- 与自闭症相关的肠道菌群生物标志物及其应用
- 本发明涉及微生物组学和医学分子生物学技术领域，具体涉及与自闭症相关的肠道菌群生物标志物及其应用。本发明首次发现肠道菌群可以辅助肠道毒物的降解，减少线粒体因毒物积累带来的损伤以及由此诱发的ASD的发生。本发明提供的与ASD...
- 楚亚男康禹孟庆仁石兴于军邵长君王建陈婧
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- 痰液样品中病原菌的快速提纯装置及快速提纯方法
- 本发明提出一种痰液样品中病原菌的快速提纯装置，包括病原菌收集通道和由串联的分离单元构成的主通道，多个串联的分离单元形成串状结构，所述串状结构与病原菌收集通道平行；每个分离单元包括至少有部分凸起朝向所述病原菌收集通道的弧形...
- 康禹罗春雄邵长君吴天于军林强王建楚亚男付荣荣
- 文献传递
- 一种痰液液化试剂、含有其的试剂盒及其应用
- 本发明提出一种痰液液化试剂，包括固定剂、液化液、玻璃珠、核酸外切酶缓冲液；所述固定剂中含有溶剂和聚合物，所述聚合物为聚天冬氨酸钠或聚‑L‑谷氨酸，所述液化液中含有还原剂和pH值为7.0～8.5的缓冲溶液。本发明还提出含有...
- 邵长君康禹于军林强王建楚亚男付荣荣
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- 应用BIGIS-4测序系统完成Glaciecola mesophila sp.nov.的全基因组测序和组装被引量：1
- 2011年
- BIGIS-4是中国新一代基于焦磷酸测序技术的测序仪.本实验利用BIGIS-4完成了对Glacielola mesophila sp.nov.(Gmn)的全基因组测序.Gmn是一株从海洋无脊椎动物体内分离到的革兰氏阴性菌.BIGIS-4测序得到152043个高质量的测序片段,平均读长406bp.测序片段由BIGIS-4系统后处理模块组装.除单核苷酸同聚体引起的测序错误外,测序结果中没有检测到其他低质量错误.Gmn基因组全长5144318bp,共注释得到4303个基因,其中有大量的代谢基因,与菌种在海洋表面非脊椎动物的生长环境相关.Gmn的冷适应和信号转导相关基因为其对海洋低温环境的适应提供了依据.
- 袁丽娜任鲁风李运涛韩伟静俞勇楚亚男刘贵明于丹滕明静王亮王绪敏周晓光俞育德于军
- 关键词：SP.NOV
- 一种痰液微生物的快速提纯试剂及其应用
- 本发明提出一种痰液微生物的快速提纯试剂，包括液化液、细胞裂解液、核酸外切酶缓冲液；所述细胞裂解液含有胍盐和表面活性剂，所述胍盐在细胞裂解液中的浓度为1～3mol/L。本发明还提出所述痰液微生物的快速提纯试剂的应用。本发明...
- 邵长君康禹石兴于军林强王建楚亚男付荣荣
