韩翠芹
- 作品数:4 被引量:11H指数:2
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- 发文基金:转基因生物新品种培育专项更多>>
- 相关领域:生物学更多>>
- 人工神经网络预测蛋白质二级结构的编码技术综述被引量:7
- 2007年
- 人工神经网络方法是迄今为止在蛋白质二级结构中预测精度最高的一种方法,而网络输入编码的方式对预测精度影响较大。在简介人工神经网络预测蛋白质二级结构方法的基础上,综述了常用的正交编码,五位编码,基于氨基酸理化性质的编码,基于profile的编码,基于常见的分矩阵的编码,基于密码子的编码等几种编码方法,对其作了简要的评价,并展望了编码的发展前景。
- 王秦虎邓麟韩翠芹
- 关键词:蛋白质二级结构神经网络编码技术
- 双筛选标记打靶载体的构建及其功能鉴定被引量:4
- 2010年
- 利用DNA同源重组方法(基因打靶)对动物基因组进行修饰是转基因研究的重要手段之一。为了构建一个高效的通用型基因打靶载体,本研究以pBS246质粒为骨架,在两个LoxP序列之间插入正筛选标记新霉素磷酸转移酶(neo)基因和绿色荧光蛋白(EGFP)基因;在两个LoxP序列外侧分别插入两组携带"8碱基"酶切位点的多克隆位点序列(MCS-1和MCS-2)和负筛选标记单纯疱疹病毒胸苷激酶(HSV-tk)基因,构建成通用型基因打靶载体pGT-V1,并且在C2C12细胞中验证了载体中各个元件的功能。该载体具有如下特点:1)在载体中引入绿色荧光标记,可以实时监控载体的转染效率,而转染效率的提高为高效基因打靶提供了保证;2)在两个LoxP位点间插入绿色荧光标记,可以直观监测打靶后遗留的筛选标记的去除情况,并且可以通过流式细胞仪或免疫磁珠法,将最终去除了筛选标记的阳性细胞(即丢失绿色荧光的细胞)分选出来,降低筛选标记在中靶细胞中可能产生的负面影响;3)采用"8碱基"酶切位点的MCS序列,便于DNA大片段的连接和重组,极大提高了该载体的通用性。总之,该载体优化了基因打靶的技术手段,为有效开展基因打靶和转基因动物研究提供了新平台。
- 李军华韩翠芹邓捷王华岩
- 关键词:同源重组打靶载体CRE-LOXP
- 一种等位基因双敲除打靶载体系统及其构建方法
- 一种等位基因双敲除打靶载体系统及其构建方法,该系统由pGT-V1和pGT-V2两个互补载体组成,每个载体都包含两个同向的LoxP元件,其间分别含有正筛选标记基因Neo/GFP和Hyg/RFP,外侧含有一个负筛选标记基因T...
- 王华岩韩翠芹李军华
- 文献传递
- 通用型等位基因双敲除打靶载体系统构建及功能验证
- 采用同源重组原理进行基因敲除,需要构建有效的打靶载体,但是目前常用的基因打靶载体在一次打靶中只敲除目标基因的一个等位靶基因,如要敲除一对等位基因,其操作和筛选都较困难。为解决这一技术难点,本研究构建了一个通用型等位基因双...
- 韩翠芹
- 关键词:打靶载体同源重组等位基因MSTNLOXP
- 文献传递