陈永迪
- 作品数：16 被引量：86H指数：6
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- 东莞市2011年手足口病肠道病毒型别分析被引量：1
- 2014年
- 目的了解引起东莞市2011年手足口病疫情的肠道病毒型别。方法采用荧光RT-PCR方法对标本中总肠道病毒、肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A组16型(CVA16)进行特异性核酸检测。对非EV71非CVA16的其它肠道病毒采用VP4基因测序进行型别鉴定。结果 2011年共检测608份手足口病病例标本,537份为阳性,其中198份为EV71阳性(占36.87%),128份为CVA16阳性(占23.84%),211份为非EV71、非CVA16的其它肠道病毒阳性(占39.29%)。对其它肠道病毒进行VP4基因测序分型,共获得50个可用序列,通过BLAST在线比对确定型别,1例CVA1,43例CVA6,4例CVA10,1例CVA12,1例CVB1。结论 2011年引起手足口病的非EV71非CVA16肠道病毒构成比已超过EV71和CVA16,成为东莞引起手足口病主要病原体之一,其中CVA6构成比较大,值得进一步研究。
- 黄勇周建孟杨华可袁达康李艳芬黎景全陈永迪
- 关键词：手足口病VP4基因基因测序
- 东莞市1例星状病毒核酸检测及分析被引量：1
- 2012年
- 目的对星状病毒进行核酸快速诊断并对其部分核酸序列进行测序分析。方法采用RT-PCR、基因测序技术对标本中的核酸进行检测分析。结果 RT-PCR结果表明标本为星状病毒阳性,对PCR扩增产物测序得到了409bp长度的ORF2部分基因序列,经Blast比对发现其为Ⅰ型血清型,与北京分离的一株星状病毒序列(GenBank号FJ755403.1)最为相似,仅有一个C→T的核苷酸变异。但编码的氨基酸并无改变,均为甘氨酸(Gly)。结论应用PCR技术扩增星状病毒特定片段可用于病毒的快速检测,同时对扩增产物测序还可对病毒进行分型,并了解其基因变异情况。
- 黄勇黎景全李艳芬李宇政陈永迪
- 关键词：星状病毒逆转录-多聚酶链反应基因测序
- 东莞市2008年-2009年H1N1流感病毒血凝素HA1基因分析
- 2012年
- 目的:了解2008年-2009年东莞市H1N1流感病毒血凝素HA1基因的特征及变化。方法:采用RT-PCR、基因测序等技术得到标本HA1基因的核酸序列,利用生物信息软件对核酸及氨基酸的特征及变化情况进行分析。结果:两年间有16个氨基酸位点发生变异,6个发生在抗原决定簇,Ca区2个,Sb区4个。受体结合位点有4个变异,130环1个,190螺旋3个。潜在糖基化位点及二硫键比较稳定,2年间没有发生变化。结论:2008年-2009年两年间H1N1流感病毒血凝素HA1基因氨基酸替换速率较高。
- 杨华可袁达康黄勇黎景全李艳芬陈永迪李宇政
- 关键词：流感病毒血凝素基因基因分析
- 东莞市病毒性腹泻病原学分析被引量：9
- 2013年
- 目的了解东莞市病毒性腹泻的病原学分布情况。方法收集2010年7月至2012年9月东莞市东华医院感染性腹泻患者的粪便样品,采用ELISA方法检测轮状病毒,采用Realtime RT-PCR方法检测诺如病毒,采用RT-PCR方法检测星状病毒,采用Realtime PCR方法检测腺病毒。结果检测粪便样品共224份,诺如病毒、轮状病毒、腺病毒、星状病毒检测阳性率分别为17.9%、11.6%、4.5%,0.4%,总检测阳性率为31.3%。对其中22份轮状病毒阳性样品进行血清分型,结果G血清型中,G1型10株,G2型1株,G3型8株,G9型3株。P血清型中,P6型1株,P8型12株,9株未能分型。40株诺如病毒全部为GⅡ型。1株星状病毒经测序分析为1型。结论东莞市腹泻病毒主要感染3岁以下的婴幼儿,诺如病毒和轮状病毒为主要病原体,轮状病毒的分布呈多样性,以G1型为主。
- 黎景全黄勇袁达康杨华可李艳芬陈永迪周建孟
- 关键词：病毒性腹泻轮状病毒腺病毒诺如病毒星状病毒
- 东莞市2012年病毒性腹泻监测结果分析被引量：3
- 2014年
- 目的分析东莞市病毒性腹泻中轮状病毒和诺如病毒的感染情况。方法收集2012年1月至2012年12月东莞市人民医院、高埗医院、寮步医院腹泻门诊病人粪便标本,采用ELISA法检测轮状病毒,采用Realtime RT-PCR方法检测诺如病毒。结果检测粪便样品共831份,轮状病毒和诺如病毒的检出率分别为15.64%和17.57%。轮状病毒感染有明显的季节特征,秋冬季为发病高峰;诺如病毒感染则无特殊的季节特征,阳性样品以GⅡ型为主。0~3岁年龄组患者的感染率显著高于3岁以上年龄组患者。结论病毒性腹泻全年均可发生,冬季的感染率较高。各年龄组男女性人群都可感染。应加强对病毒性腹泻,尤其是婴幼儿病毒性腹泻的监测。
- 李艳芬黎景全袁达康黄勇陈永迪杨华可
- 关键词：病毒性腹泻轮状病毒诺如病毒
- 2010—2012年东莞市手足口病病原学监测结果分析被引量：18
- 2014年
- 目的分析东莞市2010—2012年手足口病病原学特征和流行病学特征,为适时调整手足口病的防治方案提供参考资料。方法收集2010—2012年东莞市手足口病病原学监测标本、重症病例和聚集性疫情作为研究对象,用Realtime RT-PCR法对患者标本进行肠道病毒通用型、肠道病毒71型(EV 71)和柯萨奇病毒A组16型(Cox A16)的特异性核酸检测。结果共检测手足口病病例各类标本2 282份,肠道病毒通用型核酸阳性2 026份,检出率88.78%(2 026/2 282),其中,EV 71、Cox A16、EV 71和Cox A16混合感染、未分型类(即其他肠道病毒)的阳性病例分别占肠道病毒感染阳性的46.25%(937/2 026)、18.36%(372/2 026)、0.10%(2/2 026)和35.29%(715/2 026)。2010年东莞市HFMD病原以EV 71为主,构成比为60.63%(516/851),而2011和2012年HFMD病原主体是其他肠道病毒,其构成比为39.29%(211/537)和44.67%(285/638)。东莞市HFMD全年均有发病,高峰期主要为每年的4—6月(41.24%,941/2 282);男性发病例数(1 483例)多于女性(799例);病例以5岁以下儿童为主(92.73%,2 116/2 282)。分析2 026例肠道病毒阳性病例,其中轻、重症病例分别占所有病例的70.53%(1 429/2 026)、28.97%(587/2 026),死亡病例10例。重症病例以EV 71为主,其构成比为81.43%(478/587),死亡病例均为EV 71核酸阳性。结论2010年东莞市手足口病病原体以EV 71为主,2011年和2012年其他肠道病毒已经成为东莞市手足口病最主要的病原体。EV 71仍然是引起手足口重症和死亡病例的优势流行型别。
- 李艳芬杨华可袁达康黄勇陈永迪黎景全周建孟
- 关键词：手足口病病原学肠道病毒EVCOX
- 2010-2011年广东省东莞市甲型H1N1流行性感冒病毒血凝素基因变异特征研究被引量：3
- 2012年
- 目的了解2010-2011年广东省东莞市甲型H1N1流行性感冒(流感)病毒血凝素(HA)基因的特征及变化。方法反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)、基因扩增、测序得到标本HA基因的核酸序列,利用生物信息软件对序列的特征及变化情况进行分析。结果通过测序得到各标本HA基因1701 bp长度的核苷酸序列,566个氨基酸。2年间有24个氨基酸位点发生变异,但其中有12个位点的改变只出现在单个毒株上。发生明显变化趋势的位点只有145、202、391、468,其中202位点属于Sb抗原决定簇区。受体结合位点、潜在糖基化位点及二硫键比较稳定,2年间没有发生变化。结论主要功能区域比较保守,无变化。序列中发生明显变化趋势的位点只有4个,其中1个位于抗原决定簇区,属于流感病毒抗原漂移过程中突变的累积。
- 黄勇杨华可袁达康黎景全李艳芬周建孟李宇政陈永迪
- 关键词：流感病毒血凝素基因
- 2011年东莞市登革热与基孔肯雅热监测结果分析
- 2012年
- 目的:尽早发现登革热与基孔肯雅热病例,及时采取有效防控措施。方法:对2011年6月20日-2011年8月31日东莞市应急监测病例及疫情监测病例血清样品,采用荧光PCR检测登革热与基孔肯雅热病毒核酸,登革热核酸检测阴性者,再用ELISA法检测登革热病毒IgM抗体。结果:共收集及检测248份合格血清样品。其中,应急监测病例血清234份,检测结果均为阴性;疫情监测病例血清14份,检出2份为登革热IgM抗体阳性,1份为登革热核酸阳性,为IV型;确诊2例为登革热输入性病例。结论:通过实验室应急监测,发现了登革热病例,及时控制了疫情的传播扩散。
- 周建孟袁达康黄勇陈平华杨华可黎景全李艳芬陈永迪李宇政
- 关键词：登革热基孔肯雅热IGM抗体
- 东莞市2015—2016年柯萨奇病毒A6型流行情况及特征分析被引量：5
- 2018年
- 目的研究东莞市2015—2016年手足口病(HFMD)病例中柯萨奇病毒A6型(CVA6)的流行情况及基因特征。方法采用RT-PCR方法对HFMD疑似病例标本进行检测,CVA6阳性标本上送广东省疾病预防控制中心,进行病毒分离及鉴定,扩增并测定VP1基因序列。从GenBank中选取其他CVA6代表株进行参考比对,利用DNASTAR软件进行核苷酸、氨基酸序列分析和同源性比较,并用Mega4.0.2软件构建亲缘性进化树。结果在1 145份标本中检出CVA6阳性标本580份,阳性率为50.66%(580/1 145)。序列比对显示,20株CVA6分离株VP1基因之间核苷酸同源性为93.6%~100.0%,氨基酸同源性为97.7%~100.0%。东莞市CVA6分离株VP1与近年来全球各地流行株核苷酸和氨基酸的同源性分别为93.4%~98.5%和97.0%~99.7%,与CVA6原型株Gdula以及我国山东省1996年分离株核苷酸和氨基酸相似性仅为82.5%~85.8%和94.1%~96.4%。系统进化树分析显示,2015—2016年东莞地区CVA6与近年来流行于世界各地的CVA6分离株同源性较高,而与原型株进化距离较远。结论 2015—2016年东莞市HFMD病原以CVA6为主,流行株为近年来流行于全国各地的CVA6新变种。
- 李艳芬黄勇张莉萍陈永迪曾汉日
- 关键词：手足口病进化分析
- 东莞市2010—2016年病毒性腹泻监测及分析被引量：19
- 2018年
- 目的了解东莞市病毒性腹泻的病原体谱构成及流行情况,为东莞市病毒性腹泻防治提供资料依据。方法 2010年7月开始,每周从监测点医院采集感染性腹泻患者的粪便样品,采用ELISA方法检测轮状病毒抗原,荧光PCR方法检测诺如病毒、腺病毒、星状病毒核酸。结果 2010—2016年共检测粪便样品5 026份,全部检测轮状病毒和诺如病毒,其中600份检测腺病毒和星状病毒。4种病原体的阳性率分别为15.96%(802/5 026)、14.56%(732/5 026)、5%(30/600),1.33%(8/600),总检测阳性率为30.18%。轮状病毒、诺如GⅡ型病毒、腺病毒、星状病毒发病集中在2岁以下低龄儿童,各病原体2岁以下儿童感染比例分别为69.10%、62.26%、82.14%、71.43%。轮状病毒每年有1个流行高峰,每年12月份至次年1月达高峰。诺如GⅡ型病毒每年有2个流行高峰,3月和8月达高峰。结论监测的4种病原体中,轮状病毒和诺如病毒为病毒性腹泻的主要病原体,两者的阳性率相近。诺如病毒以GⅡ型为主。轮状病毒、诺如GⅡ型病毒、腺病毒和星状病毒主要感染2岁以下的婴幼儿,轮状病毒和诺如GⅡ型病毒感染有较强的季节性。
- 黄勇陈永迪李艳芬黎景全
- 关键词：病毒性腹泻轮状病毒诺如病毒腺病毒星状病毒
