赵建
- 作品数:104 被引量:292H指数:10
- 供职机构:中国水产科学研究院珠江水产研究所更多>>
- 发文基金:中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家现代农业产业技术体系建设项目公益性行业(农业)科研专项更多>>
- 相关领域:农业科学生物学医药卫生轻工技术与工程更多>>
- 鲮Myf5基因克隆及其SNPs分析被引量:18
- 2010年
- 提取新鲜鲮(Cirrhinus molitorella)肌肉总RNA,采用RT-PCR技术分段克隆鲮Myf5基因核心序列,获得1104bp的目的片段,其中开放阅读框为723bp,编码240个氨基酸。分析表明,鲮Myf5蛋白具有MRF家族基因的典型性碱性bHLH螺旋-环-螺旋(Basic helix-loop-helix,bHLH)结构。设计特异性引物扩增获得2个内含子,大小分别为1311bp和90bp。用单链构向多态性SSCP的方法分析了Myf5基因在珠江水系3个不同江段鲮中的遗传变异,分布及群体杂合性等群体遗传信息。发现其编码区非常保守,仅在外显子412位点处发生突变C→T。对该位点进行基因型分析,结果表明:珠江北江段鲮中该位点符合Hardy-Weinberg平衡,而东江和西江段种群不符合Hardy-Weinberg平衡,3个江段种群总体上符合Hardy-Weinberg平衡,并存在较大基因流。以Myf5基因该位点的多态性分析表明,3个种群未出现明显分化;通过该位点的遗传结构分析表明:3个江段种群杂合度都较高,中度信息含量(PIC)及多态信息指数,即该位点有较好的变异性及遗传多态性。3个江段种群总体上该位点在不符合Hardy-Weinberg的情况下AA>BB,并由该位点群体杂合性及中性分析表明该位点突变群体具体良好的多态性且不遵循中性选择模式,说明BB型个体受到自然选择。本研究结果表明,鲮Myf5基因的C412T与个体生长有相关性,可作为候选基因标记,用于鲮生长相关分子标记辅助育种研究。
- 钟茂春郑光明赵建朱新平马丽莎潘德博陈昆慈谢文平史燕
- 关键词:鲮鱼SSCP
- 用于斑鳢性别鉴定的SNP位点及其检测方法
- 本发明公开了一种用于斑鳢性别鉴定的SNP位点及其检测方法,旨在提供一种简单快速且准确率较高的对斑鳢进行遗传性别鉴定的分子鉴别的位点及其方法。所述的碱基序列为:SEQIDNO:1或SEQIDNO:2;所述的SNP位点为SE...
- 赵建陈昆慈朱新平罗青王亚坤
- 文献传递
- 鳢饲料、制备方法、喂养方法及应用
- 本申请涉及鳢的养殖技术领域,具体涉及鳢饲料、制备方法、喂养方法及应用。该鳢饲料以常规基础饲料为基础,添加了少量的四种氨基酸,得到了一种特殊的鳢饲料。该鳢饲料、喂养方法及应用既能促进鱼的生长而又获得较高的饲料利用率,且还能...
- 费树站赵建欧密张新铖刘海洋罗青陈昆慈
- 中华鳖转铁蛋白基因序列特征及表达研究
- 本文分离克隆了中华鳖转铁蛋白基因c DNA和g DNA全序列,对其序列特征、组织表达及原核表达进行了分析研究。结果显示,中华鳖转铁蛋白对应全长c DNA的基因组DNA全长为19100 bp,由17个外显子和16个内含子组...
- 李伟史燕赵建洪孝友朱新平
- 关键词:中华鳖转铁蛋白原核表达
- 文献传递
- 基于RNA-Seq技术的鲮转录组分析被引量:4
- 2014年
- 为满足标记辅助育种的要求,通过454测序平台首次开展了鲮Cirrhina molitorella全鱼转录组深度测序,并用Newbler等软件进行数据精细分析。结果表明:共获得了1 297 479条reads,总碱基数为486 586 191 bp,组装后得到19 962条contigs,平均长度为1269 bp,N50为1509 bp。基因功能注释研究共获取了10 577个特异蛋白,根据特异蛋白注释结果进行GO分析,有7314条contigs有GO注释,包含5381个特异蛋白;采用GO功能分类工具可将已注释转录物序列划分为分子功能、生物途径和细胞成分3类,为下一步开展生长等性状相关基因功能验证研究提供丰富的序列资源;共鉴定出5931个具有完整的ORF的全长c DNA序列,并且鉴定出2438个微卫星和5014个SNP位点。本研究中,还建立了鲮转录组数据库和网站,方便同行随时调取数据,这为深入开展鲮分子标记辅助的遗传育种、种群遗传学和资源评估等研究提供了丰富的标记资源。
- 许建赵建徐礼鸣崔军李强朱新平徐鹏
- 关键词:转录组
- 一种全雄乌斑杂交鳢的培育方法
- 本发明属于鱼类育种技术领域,公开了一种全雄乌斑杂交鳢的培育方法,进行选育系斑鳢性逆转;伪雌鱼鉴定;伪雌鱼繁殖;超雄鱼鉴定及超雄鱼扩繁。利用本发明提供的方法步骤,可以培育全雄性乌斑杂交鳢,雄性率93%以上;全雄品种在养殖过...
- 赵建陈昆慈罗青刘海洋欧密陈柏湘尹建雄江谢武
- 文献传递
- 鲮微卫星DNA分子标记的筛选与遗传多样性分析被引量:1
- 2012年
- 采用磁珠富集法对已建立的生长较快的西江段野生浅色鲮群体的极大、极小群体各31尾基因组DNA进行了微卫星序列的筛选,128个阳性克隆成功测序93个,其中80个为的微卫星序列,微卫星序列完美型占85%,非完美型占6.25%,混合型占8.75%。利用微卫星序列合成了23对微卫星引物,扩增结果表明,等位基因数为1~10个,扩增片段大小为92~283bp,其中14对引物扩增条带清晰,为中度或高度多态位点,极大、极小群体的平均有效等位基因数和平均多态信息含量分别为3.0784、3.2079和0.5675、0.5974,反映出2个群体遗传多样性均较丰富;高度多态性引物4的位点b,片段大小为119bp,在极大群体中出现频率为61.3%,在极小群体占22.6%,出现频率极大群体高于极小群体近3倍,初步可作为候选差异性分子标记。
- 刘佳瑶赵建郑光明朱新平
- 关键词:微卫星磁珠富集法
- 一种基于EST-SSR标记的罗氏沼虾分类方法
- 本发明公开了一种基于EST‑SSR标记的罗氏沼虾分类方法,旨在筛选到12个罗氏沼虾EST—SSR分子标记位点,并建立一种准确、有效地利用分子标记检测不同来源罗氏沼虾遗传结构和遗传背景的方法,以鉴定出不同来源罗氏沼虾的遗传...
- 于凌云朱新平陈昆慈赵建陈辰李伟洪孝友徐红艳刘晓莉
- 中华鳖3个养殖群体形态性状对体质量的影响被引量:14
- 2014年
- 运用通径分析和多元回归分析的方法,采用体质量和6个形态性状为指标对中华鳖3个养殖群体(黄河,洞庭,绿卡)进行了比较,分析了各个群体形态性状与体质量的关系并建立回归方程。结果显示:影响3个群体体质量的主要形态性状不同,其中黄河群体的主要形态性状为背甲长和体高,洞庭群体的主要形态性状为背甲长、背甲宽和体高,而绿卡群体的主要形态性状为腹甲长和腹甲宽。3个群体的回归方程分别为:黄河y=-801.208+75.656x1+84.630x5,洞庭y=-504.672+57.146x1+44.990x2-35.820x5,绿卡y=-591.999+53.211x3+48.537x4。相关指数均大于0.85,说明影响3个群体体质量的主要形态性状已经找出,且方程拟合度良好。研究表明,影响3个群体体质量的主要形态性状不同,因此针对不同群体的选择相应的性状才能达到更理想的选育效果。
- 肖凤芳李伟李伟朱新平赵建洪孝友朱阿莉史燕
- 关键词:中华鳖养殖群体通径分析
- 黄喉拟水龟种群分化与种质资源研究
- 黄喉拟水龟是在亚洲曾广泛分布的龟类动物,而目前处于濒危状态。由于其较高的食用、药用和观赏价值,黄喉拟水龟养殖业发展迅速。然而对其种质资源的研究薄弱,其主要种群的遗传多样性和遗传结构不清晰,且其与近缘种安南龟的分类关系一直...
- 赵建
- 关键词:黄喉拟水龟种群分化线粒体DNARAD转录组
- 文献传递