许鹏
- 作品数：5 被引量：2H指数：1
- 供职机构：温州大学更多>>
- 发文基金：浙江省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术理学生物学更多>>
- 一种量化miRNA对相关疾病基因影响程度的方法
- 本发明公开了一种量化miRNA对相关疾病基因影响程度的方法，包括如下步骤：①确定miRNA‑mRNA调控关系表；②基因差异表达分析，确定显著差异变化的基因；③计算miRNA表达变化矩阵(ΔE<Sub>miR</Sub>)...
- 刘文斌许鹏吴倩昝乡镇
- 文献传递
- 布尔网络的长程相关性及可控性研究
- 复杂生物系统一个重要特性是可以产生具有长程相关性的波动信号。布尔网络是基因调控网络的一种重要模拟仿真模型，已经成功应用于仿真模拟许多真实生物网络系统。在本文中，我们基于布尔网络研究网络的动态行为，结果发现在小噪声环境下，...
- 许鹏
- 关键词：基因调控生物系统
- 文献传递
- 一种扩展的Post类函数及其对基因调控机制的影响
- 2016年
- 已有的理论分析表明,有序函数对网络的运行及其动态行为具有重要的影响.Post类函数是目前发现的数量最大的一种有序函数,其缺点是它仅反映了基因之间的正调控机制.本文在Post类函数的基础上,将其扩展为一种同时具有正负调控机制的函数类.仿真结果表明:扩展的Post类函数在维持网络的有序性及长程相关性方面,和原有的Post类函数以及渠化函数类似.同时与已有的Post类和渠化函数相比,新扩展的Post类函数量最多.从进化的角度,新扩展的函数更有可能成为自然进化选择的调控方式.通过对八种真实生物系统布尔网络模型函数分布的研究,也部分的支持这一结论.
- 许鹏欧阳宏嘉沈良忠刘文斌
- 关键词：基因调控网络
- 布尔网络动态行为研究被引量：2
- 2012年
- 布尔网络动态特性的研究已经成为国内外基因调控网络研究的重要课题.介绍了布尔网络动态行为的相关概念和最新进展,并采用计算机模拟布尔网络的动态演化过程,用消除趋势波动分析(DFA)方法分析了布尔网络的长程相关性动态特性.结果发现:绝大多数布尔网络呈现1/f波动;长程相关性值α与网络的连通度k有关,并随着灵敏度数值S的增加而减小.
- 王向红王欣刘莉莉许鹏刘文斌
- 关键词：基因调控网络
- 用C++面向对象技术实现复杂生物网络集存储
- 2011年
- 高通量生物技术的发展涌现出了海量的生物网络数据。如何有效的从复杂的生物网络集中挖掘出保守的频繁模式是当代系统生物学研究的热点问题之一。由于生物数据规模大、维数高等的原因,开发出从复杂生物网络集中挖掘出保守频繁模式的应用软件往往面临着一个存储表示的难题。本文用C++面向对象的相关技术,研究了生物网络集的存储表示,并在文中最后讨论了该方法在频繁模式挖掘中的应用。
- 昝乡镇肖碧玉许鹏刘文斌
