白昌明
- 作品数：38 被引量：26H指数：4
- 供职机构：中国水产科学研究院黄海水产研究所更多>>
- 发文基金：国家现代农业产业技术体系建设项目国家自然科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域：农业科学轻工技术与工程医药卫生政治法律更多>>
- 检测鲍疱疹病毒的引物组及其在构建病毒检测方法和试剂盒中的应用
- 本发明公开了检测鲍疱疹病毒的引物组及其在构建病毒检测方法和试剂盒中的应用，属于生物检测技术领域。本发明所述检测鲍疱疹病毒的引物组是根据SEQ ID No:1所示的核酸序列设计的，在此基础上，可将本发明所述的引物组应用在原...
- 白昌明谷莉辛鲁生王崇明
- 文献传递
- 一种快速检测牡蛎疱疹病毒OsHV-1的胶体金试纸条及其应用
- 本发明属于生物检测技术领域，具体涉及一种快速检测牡蛎疱疹病毒(Ostreidherpesvirus1,OsHV‑1)的胶体金试纸条方法及其应用。该胶体金试纸条以OsHV‑1膜分子蛋白p21，如SEQ ID NO.1所示和...
- 辛鲁生于江南白昌明王崇明
- 基于原位LAMP技术的牡蛎疱疹病毒(OsHV-1)易感宿主调查被引量：2
- 2023年
- 牡蛎疱疹病毒(Ostreidherpesvirus1,Os HV-1)给世界双壳贝类养殖业造成了严重的经济损失。10余种双壳贝类陆续被认定为易感宿主,仍有其他几种贝类仅有PCR核酸阳性数据,因确诊证据不足导致其易感性未得到充分评估。原位环介导等温核酸扩增(LAMP)检测技术相对传统原位杂交技术具有灵敏度高、方便快捷、可作为病原微生物感染证据的优点。为了在Os HV-1流行病学调查过程中实现病毒感染的快速检测和确诊,根据已报道的Os HV-1特异性LAMP检测引物,设计内引物,优化反应条件,建立了Os HV-1的原位LAMP检测方法。基于该方法对2019年以来采集的长牡蛎(Crassostreagigas)、福建牡蛎(Crassostrea angulata)、栉孔扇贝(Chlamysfarreri)、虾夷扇贝(Mizuhopecten yessoensis)、毛蚶(Scapharca subcrenata)和菲律宾蛤仔(Ruditapes philippinarum)样本进行检测。结果显示,毛蚶样本的Os HV-1原位LAMP检测结果呈阳性;其他几种贝类部分样本的实时定量PCR (qPCR)检测呈阳性,但原位LAMP检测呈阴性。对毛蚶样本的原位LAMP检测结果分析发现,病毒杂交信号主要分布在外套膜和肝胰腺等器官的结缔组织,推测感染的细胞为成纤维细胞和血淋巴细胞;在闭壳肌和斧足肌肉组织的肌细胞细胞核中也发现较多杂交信号。鳃丝内和周边偶现阳性信号,推测来自渗出的血淋巴细胞。基于原位LAMP技术的Os HV-1检测结果显示,毛蚶是Os HV-1的一种易感宿主,毛蚶结缔组织、肌肉组织和血淋巴细胞对该病毒有强亲嗜性。
- 张翔谷莉郑玉东李晨白昌明辛鲁生王崇明刘金兰
- 关键词：易感性
- 牡蛎小胞虫病诊断规程 显微镜检查组织法
- 本文件适用于牡蛎感染马可尼小胞虫的普查和初步诊断;以及牡蛎感染马可尼小胞虫的流行病学调查和诊断;其他贝类可参照执行。
- 白昌明杨冰 王崇明 黄倢 李清 万晓媛 辛鲁生 李晨 余卫忠
- 牡蛎马尔太虫病诊断规程 显微镜检查组织法
- 本文件规定了牡蛎马尔太虫病诊断规程中普遍适用的显微镜检查组织法的要求，针对主要病原折光马尔太虫（Marteilia refringens），给出了组织印片检测法和组织病理检测法所需试剂或材料、仪器设备、样品、试验步骤和结...
- 白昌明杨冰 王崇明 黄倢 李清 万晓媛 李晨 辛鲁生 余卫忠
- 基于牡蛎疱疹病毒DNA聚合酶基因的巢式PCR检测方法的建立及应用
- 牡蛎疱疹病毒(Ostreid herpesvirus 1,Os HV-1)近年来引起我国及世界多个国家和地区,多种养殖双壳贝类大规模死亡。分子流行病学研究和监测结果表明,Os HV-1近年来发生了较强的株系分化,导致目前...
- 高文辉白昌明蔡生力王崇明
- 关键词：巢式PCR分子变异特异性
- 文献传递
- 一种牡蛎疱疹病毒的间接原位杂交PCR检测方法
- 本发明是一种牡蛎疱疹病毒的间接原位杂交PCR检测方法，属于基因工程技术领域，包括如下步骤：首先将待检测样品固定，脱水，包埋制备成组织切片，并配制液相PCR反应体系、通过PCR反应程序，对组织切片中原位固定的靶DNA进行扩...
- 白昌明李亚楠辛鲁生王崇明
- 基于长片段PCR扩增的牡蛎疱疹病毒基因组高通量测序被引量：1
- 2018年
- 为获取2001年低温冻存栉孔扇贝感染牡蛎疱疹病毒(Os HV-1)变异株(ZK2001)基因组序列,并分析ZK2001与其他Os HV-1变异株的序列差异和系统发育关系,利用基于长片段PCR的基因组DNA的扩增和富集技术,获取2001年栉孔扇贝感染Os HV-1变异株的基因组DNA;再使用Illumina Hiseq 2500 PE250高通量测序平台对其测序。最后分析ZK2001与Os HV-1其他变异株基因组的序列差异和系统发育关系。测序数据组装后获得8个Scaffold。基因组变异分析结果显示,ZK2001与参考基因组相比存在328个SNP位点,SNP和序列插入/缺失变异是导致Os HV-1基因组序列变异的主要变异类型。系统发育分析结果显示,ZK2001变异株与分离自我国的Os HV-1变异株亲缘关系最近,与分离自欧洲的Os HV-1μvar及其相关变异株的亲缘关系最远,说明中国和欧洲分布Os HV-1间存在因地理隔离导致的遗传分化。研究表明,基于长片段PCR的DNA富集技术,可以有效地扩增和富集冷冻样本中Os HV-1基因组DNA,并应用于高通量测序。Os HV-1不同变异株基因组序列数据的获取和积累,将为其基因组尺度的基因变异、株系演化和系统发育关系等研究提供重要基础。
- 史杰史杰白昌明李晨蔡生力
- 关键词：栉孔扇贝高通量测序
- 双壳贝类感染疱疹病毒OsHV-1的通用型RPA核酸等温扩增引物、试剂盒及其应用
- 本发明属于海洋生物技术领域，具体涉及一种双壳贝类感染疱疹病毒OsHV‑1的通用型RPA核酸等温扩增引物、试剂盒及其应用。所述引物为成套扩增引物，由上下游引物和探针引物组成；上游引物如SEQ ID NO.1所示；下游引物如...
- 辛鲁生于江南白昌明王崇明
- 文献传递
- 高通量测序揭示高、低温季节下长牡蛎菌群变化
- 2022年
- 为解析高、低温季节对养殖长牡蛎(Crassostrea gigas)微生物群落组成,及微生物群落变化对长牡蛎品质和食品安全的潜在影响,利用16s扩增子高通量测序技术,对高温季节和低温季节采集自青岛鳌山湾的长牡蛎软体组织微生物群落结构进行分析。高通量测序结果表明,高温季节长牡蛎样本软体组织中的细菌群落主要由变形菌门(Proteobacteria,40.35%)、厚壁菌门(Firmicutes,19.87%)、放线菌门(Actinobacteria,12.23%)和拟杆菌门(Bacteroidetes,10.39%)组成;在属水平上优势菌为双歧杆菌属(Bifidobacterium,5.11%)、栖水菌属(Enhydrobacter,5.03%)、内源性单胞菌属(Endozoicomonas,4.81%)和甲基杆菌属(Methylobacterium,3.04%)。低温季节长牡蛎样本软体组织中细菌群落发生变化,放线菌门占比大幅降低至4.14%,蓝细菌门(Cyanobacteria,9.05%)占比由2.61%上升至9.05%;在属水平上鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas,21.13%)、蓝细菌(Cyanobacteria,7.70%)和支原体属(Mycoplasma,5.08%)占比上升,成为优势菌,而双歧杆菌属(0.58%)、栖水菌属(0.05%)占比大幅降低;弧菌属(Vibrio)在外套膜组织中占比最高,整体占比由高温季节的1.25%降低至0.10%,与传统培养结果一致。从高温季节到低温季节,长牡蛎样品中微生物群落丰富度略有增加,而多样性有所下降。该研究可为评估不同季节长牡蛎品质与安全的影响提供参考。
- 徐皓月张翔谷莉白昌明辛鲁生王文彬王崇明
- 关键词：长牡蛎高温季节微生物高通量测序
