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杨俊萍: 作品数：14 被引量：65H指数：5; 供职机构：厦门出入境检验检疫局更多>>; 发文基金：福建省自然科学基金福建省重点科技计划项目国家质检总局科技计划项目更多>>; 相关领域：医药卫生农业科学轻工技术与工程生物学更多>>

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奥尔森派琴虫和北海派琴虫ITS基因测序及同源性分析: 2014年; 通过设计能扩增奥尔森派琴虫和北海派琴虫ITS序列的特异性引物,对我国东南沿海8个地区养殖牡蛎中常见的两种派琴虫相应基因进行扩增、克隆和测序,并进行同源性分析。国内不同地区奥尔森派琴虫ITS序列的同源性超过99.3%,与国外分离株的同源性也在98.8%以上;种间同源性分析发现,奥尔森派琴虫与海水派琴虫和P.honshuensis的同源性较高,分别为94.2%和95.0%,与P.qugwadi的同源性最低,仅62.9%。深圳和三亚分离的北海派琴虫ITS序列有18个碱基存在差异,其中ITS-1有3个碱基差异,ITS-2有15个碱基差异,而5.8S高度保守,没有碱基差异;北海派琴虫与其他种类之间的差异主要表现在ITS-1和ITS-2区域;同源性比较发现,北海派琴虫的同源性在100%-97.9%之间,其中深圳北海派琴虫的同源性较低,为97.9%。种间同源性分析表明,北海派琴虫与奥尔森派琴虫的同源性较高,为89.4%,其次为海水派琴虫和P.honshuensis,与P.qugwadi同源性最低,仅71.9%。; 郭书林陈垚陈信忠龚艳清杨俊萍; 关键词：ITS基因同源性分析

16S rRNA和COI基因条形码在12种观赏鱼种类鉴定中的应用被引量：6: 2016年; 应用通用引物测定观赏鱼市场上价值较高的红尾金龙鱼、黄尾龙鱼、青龙鱼、珍珠龙鱼、银龙鱼、神仙鱼、非洲珠宝鱼、接吻鱼、珍珠毛足鲈、蓝钻石孔雀、孔雀鱼、锦鲤等12种观赏鱼的16SrRNA基因和COI基因部分序列。应用DNA序列分析软件,对这些基因进行同源性比较和系统发育分析。通过GenBank中的核酸BLAST和BOLD SYSTEMS数据库对这些基因序列进行比对,结果表明16SrRNA基因和COI基因可以在物种水平作为基因条码对亚洲龙鱼、珍珠龙鱼、银龙鱼和神仙鱼等观赏鱼进行准确的鉴别,而且应用COI基因构建的系统发育树比16SrRNA基因更加接近现有的鱼类分类体系。但对形态十分相似的慈鲷等观赏鱼,以及红尾金龙鱼、黄尾龙鱼、青龙鱼等同一个物种不同品系的观赏鱼依靠16SrRNA基因或COI基因都无法准确鉴定,需要研究进化速度更快的DNA基因条码。; 陈信忠郭书林龚艳清袁芳许奕宸杨俊萍; 关键词：观赏鱼物种鉴定 RRNA COI

多房棘球蚴线粒体ND1基因分析及PCR检测方法: 根据多房棘球绦虫线粒体DNA全序列,设计引物扩增ND1基因并进行测序,得到多房棘球蚴ND1基因全序列。对该序列与其它常见棘球绦虫的ND1基因序列进行同源性分析。该序列与国外报告的多房棘球绦虫的同源性达到98.8%,与细粒...; 杨俊萍龚艳清陈信忠; 关键词：多房棘球蚴 PCR; 文献传递

七彩神仙鱼和神仙鱼的DNA条形码研究被引量：3: 2016年; 应用通用引物测定了观赏鱼市场上具有较高价值的7个品系七彩神仙鱼和3个品系神仙鱼的16S r RNA基因和CO I基因部分序列,并应用DNA序列分析软件,对这些基因进行了同源性比较和系统发育分析。通过Gen Bank中的核酸BLAST和BOLD SYSTEMS数据库对这些基因序列进行比对,结果表明16S r RNA基因和CO I基因可以在物种水平对神仙鱼进行准确鉴定,但对七彩神仙鱼只能进行有限度的鉴别。由于不同品系的七彩神仙鱼或神仙鱼,尽管其体色和斑纹具有明显差异,但16S r RNA基因和CO I基因序列高度相似。因此,对这些观赏鱼依靠16S r RNA基因或CO I基因都无法准确鉴定,需要研究进化速度更快的DNA基因条码。; 陈信忠袁芳许奕宸郭书林龚艳清杨俊萍; 关键词：七彩神仙鱼神仙鱼物种鉴定 RNA CO

简单异尖线虫环介导等温扩增（LAMP）鉴定方法的建立和应用被引量：9: 2010年; 目的建立快速鉴定简单异尖线虫的环介导等温扩增方法（LAMP）. 方法根据简单异尖线虫ITS保守区域的基因序列设计特异性引物进行LAMP扩增,对反应体系中dNTPs、Mg^2＋、Betaine和2对引物的浓度,以及反应温度、反应时间等进行优化;在优化后的体系下,将10倍比稀释的简单异尖线虫ITS序列重组质粒进行灵敏性试验;用典型异尖线虫、对盲囊线虫、针蛔线虫对该方法进行特异性试验;并用7份简单异尖线虫样品进行验证. 结果 LAMP的最佳反应体系为0.8 mmoL/L dNTPs、10 mmol/L Mg^2＋、0.8 mmoL/L Betaine、0.2μmol/L外引物、1.6μmoL/L内引物、8 U Bst DNA聚合酶大片段以及适量的模板,反应温度为62℃,反应时间为60 min;检测简单异尖线虫的灵敏度达到10拷贝/μl,且对典型异尖线虫、对盲囊线虫、针蛔线虫无交叉反应;7份简单异尖线虫样品经LAMP验证均为阳性.结论 LAMP方法灵敏性高、特异性强,并且操作简便、成本低,是鉴定简单异尖线虫的有效手段.; 郑洋妹陈信忠龚艳清杨俊萍; 关键词：简单异尖线虫环介导等温扩增技术

基质辅助激光解析电离飞行时间质谱在动物病原菌检测中的应用被引量：7: 2012年; 应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)技术,对厦门口岸进口的1000多份动物及其产品的样品进行致病菌的检测和鉴定,共检出20多种致病菌,并对这些菌株同时用传统生化鉴定方法进行确认。结果表明MALDI-TOF-MS对未知细菌进行鉴定,较传统方法更加快速、准确,而且可以进行高通量检测,可以广泛应用于口岸动物检疫以及微生物检验实验室的日常检验。此外,将国内分离鉴定的各种参考菌株建立的常见致病菌MALDI-TOF-MS数据库与布鲁克公司的MALDI Biotyper数据库进行病原菌鉴定的比较,结果表明,实验室自建的MALDI-TOF-MS数据库可以取得更加准确地结果。; 龚艳清郭书林陈信忠杨俊萍马群飞叶妍妍; 关键词：基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱

多房棘球蚴线粒体ND1基因分析及PCR检测方法: 多房棘球绦虫线粒体DNA全序列，设计引物扩增ND1基因并进行测序，得到多房棘球蚴ND1基因全序列。对该序列与其它常见棘球绦虫的ND1基因序列进行同源性分析.该序列与国外报告的多房棘球绦虫的同源性达到98.8％,与细粒棘球...; 杨俊萍龚艳清陈信忠; 文献传递

PCR-RFLP方法检测和鉴别五种李斯特菌被引量：4: 2013年; 目的建立快速检测和鉴别单增李斯特菌、绵羊李斯特菌、英诺克李斯特菌、威尔李斯特菌和格氏李斯特菌等5种常见李斯特菌的方法。方法采用PCR-RFLP技术,首先通过引物"Lis1A-Lis1B"对李斯特菌属iap基因进行扩增,扩增产物大小约1.4kb,然后用限制性内切酶DdeⅠ对PCR产物进行酶切,电泳观察具有种间特异性的酶切谱带进行鉴别。结果上述5种李斯特菌的PCR扩增产物经内切酶DdeⅠ消化后,得到片段大小不同、具有种间差异的特异性酶切图谱。结论本实验建立的PCR-RFLP方法可以用于上述5种常见李斯特菌的快速检测和鉴定。; 郭书林陈信忠龚艳清杨俊萍叶妍妍孔繁德; 关键词：李斯特菌

MALDI-TOF-MS方法检测、鉴定副溶血性弧菌被引量：11: 2013年; 目的建立快速检测和鉴定副溶血性弧菌的基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)分析方法。方法采用副溶血性弧菌标准菌株,在不同的培养基或不同的培养时间下进行MALDI-TOF-MS检测,同时对长时间冷冻保存的菌株进行检测,以验证该方法的稳定性和重复性。对不同来源的菌株进行检测,以确认方法的准确性。结果用PW、TCBS琼脂和弧菌显色培养基等3种培养基,分别培养18、42、72h时,对该菌的蛋白质谱图影响很小;保存2年的菌株,其MALDI-TOF-MS鉴定分值保持稳定;对来自不同国家和地区的菌株都可以得到同样准确的结果。结论 MALDI-TOF-MS方法可以快速、准确地鉴定副溶血性弧菌。因其具有很好的稳定性和重复性,可用于副溶血性弧菌的日常检测。; 龚艳清陈信忠郭书林杨俊萍叶妍妍; 关键词：MALDI-TOF-MS 副溶血性弧菌

多房棘球蚴线粒体NADH脱氢酶1基因分析及PCR检测方法被引量：5: 2012年; 目的扩增多房棘球蚴线粒体NADH脱氢酶亚基1（NADH dehydrogenase suhunit1，ND1）基因全序列，测序并进行同源性比较。建立检测多房棘球蚴感染的PCR方法，应用于人和动物感染多房棘球蚴的快速检测和鉴定。方法根据多房棘球绦虫线粒体DNA全序列，设计引物扩增ND1基因并进行测序，获得多房棘球蚴ND1基因全序列。对该序列与其它常见棘球绦虫的NDI基因序列进行同源性分析。结果多房棘球蚴线粒体ND1基因序列与国外报告的多房棘球绦虫的同源性达到98．8％，与细粒棘球绦虫的同源性为86．2％，与少节棘球绦虫的同源性为84．6％，与伏氏棘球绦虫的同源性为87．0％。结论多房棘球蚴线粒体ND1基因与其他棘球绦虫相应基因存在显著差异。PCR方法可以用于多房棘球蚴感染的快速检测和鉴定。; 杨俊萍郭书林陈信忠龚艳清; 关键词：多房棘球蚴 PCR检测

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