李春
- 作品数：48 被引量：72H指数：5
- 供职机构：河南省农业科学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家芝麻产业技术体系建设项目国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学理学生物学医药卫生更多>>
- 一种芝麻染色体荧光原位杂交方法
- 本发明属于生物技术领域，具体涉及一种芝麻染色体荧光原位杂交方法，其采用涂片技术制作芝麻中期染色体标本，染色体分散效果好，制片效率高；在此基础上，采用荧光素标记BAC探针，建立了芝麻BAC的染色体原位杂交技术。探针杂交染色...
- 张海洋苗红梅赵瑞红李春马琴魏利斌段迎辉
- 文献传递
- 芝麻全长cDNA文库的构建及序列分析被引量：1
- 2013年
- 本研究采用Gateway建库技术构建了中国芝麻主栽品种豫芝11号的植株生长发育过程中不同组织的全长cDNA文库（SiFcDNA）。该全长cDNA文库容为5．6×10^6，文库滴度为1．12×10^6cfu／mL。部分克隆检测显示，文库cDNA片段长度集中于1．0～3．0kb，重组率为96．88％，全长cDNA比例为88％。随机挑取1152个单克隆进行5′端EST测序，共获高质量有效EST序列1088条，拼接得到单一基因序列867条，其中46条单一基因在NCBI数据库中没有查到相应的同源序列，可能为芝麻生长发育过程特有的新基因；所获单一基因序列被划分为26个GO功能亚类。此外，从获得的Unigene序列中挖掘出了173个SSR，分布频率为4．78kb／SSR；AG／CT类型SSR出现次数最多，占总SSR的19．08％。高质量全长SiFcDNA文库的构建为深入开展芝麻功能基因组学研究奠定基础。
- 魏利斌苗红梅张体德李春张海洋
- 关键词：芝麻全长CDNA文库生物信息学EST-SSR
- 芝麻SNP和InDel标记遗传多样性、群体结构及连锁不平衡分析被引量：16
- 2017年
- 为了利用关联分析发掘芝麻种质资源中所携带的优异等位基因,并了解其对目标性状的贡献值。本研究利用随机分布于芝麻基因组中的206对多态性分子标记(167对SNP标记和39对In Del标记),对101份来自国内外的芝麻材料进行遗传多样性、亲缘关系、群体结构及连锁不平衡分析。206对标记共检测到413个等位基因;标记位点的基因多样性范围在0.01~0.53,平均为0.35;多态性信息含量(PIC)变幅为0.01~0.46,平均为0.28。供试芝麻材料间的遗传距离变幅为0.08~0.88,平均为0.43。聚类结果显示101份芝麻材料被划分为两大亚群:中国绝大部分(93.42%)芝麻材料被划分为第一大亚群,国外绝大部分(80.0%)芝麻材料被划分为第二大亚群。中国北方区(NR)与美洲区(AMR)的材料遗传距离最远(0.36);中国北方区(NR)与中部区(CR)的遗传距离最近(0.04)。群体结构分析显示供试芝麻群体由2个亚群组成,该结果与聚类分析以及主坐标分析结果一致。另外,绝大多数芝麻材料(>84%)间的亲缘关系较远(亲缘关系值<0.2)。连锁不平衡分析显示不同位点组合间存在一定程度的LD。利用SNP和InDel标记成功分析了101份芝麻品种的遗传多样性、亲缘关系、群体结构和连锁不平衡程度,本研究结果为后期芝麻杂交组合的配置以及利用关联分析准确挖掘芝麻有利基因提供了依据。
- 魏利斌苗红梅李春段迎辉徐芳芳张海洋
- 关键词：芝麻SNPINDEL
- 白及Aux/IAA基因的鉴定及分析被引量：1
- 2020年
- 基于白及〔Bletilla striata(Thunb.ex A.Murray)Rchb.f.〕的全转录组数据,采用生物信息学方法对白及Aux/IAA基因进行鉴定和序列分析,对白及Aux/IAA蛋白的一级和二级结构、基序、保守结构域、GO功能分类和KEGG富集结果进行分析,并对其与拟南芥〔Arabidopsis thaliana(Linn.)Heynh.〕和铁皮石斛(Dendrobium officinale Kimura et Migo)的Aux/IAA蛋白进行系统发育分析。结果表明:在白及的全转录组中共筛选出5个Aux/IAA基因,分别命名为BsAux/IAA1至BsAux/IAA5,开放阅读框(ORF)长度为492~2739 bp。5个BsAux/IAA蛋白的氨基酸残基数为163~912,理论相对分子质量为18172.97~101442.89,理论等电点为pI 4.40至pI 11.51,亚细胞定位于细胞核中,二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。5个BsAux/IAA蛋白共有DomainⅠ、DomainⅡ、DomainⅢ和DomainⅣ4个完整的保守结构域,依次对应保守基序motif9、motif3、motif2和motif1。5个BsAux/IAA蛋白的功能均包括细胞组分、生物学过程和分子功能3个大类,并参与植物激素信号转导通路。系统发育分析结果表明:5个BsAux/IAA蛋白均属于GroupⅠ亚家族,并进一步分成a和b 2个亚群,其中,BsAux/IAA3、BsAux/IAA4和BsAux/IAA5属于a亚群,BsAux/IAA1和BsAux/IAA2属于b亚群;并且,BsAux/IAA1、BsAux/IAA2、BsAux/IAA4和BsAux/IAA5与铁皮石斛Aux/IAA的亲缘关系较近。研究结果显示:白及Aux/IAA蛋白具有一定的保守性,可能在细胞核中发挥作用,并具有组织特异性、发育依赖性和非生物胁迫应答性。
- 刘厚伯李春李林上官艳妮黄恻隐刘怡郑明辉徐德林
- 关键词：白及基因鉴定系统发育分析
- 芝麻籽粒脂肪含量核磁共振无损快速测定方法的建立被引量：3
- 2016年
- 以冷榨芝麻油为标样,制作出核磁共振检测芝麻脂肪含量的标准曲线,建立了核磁共振无损快速测定芝麻籽粒脂肪含量的方法（简称核磁共振法,NMR）。分别采用索氏提取法和核磁共振仪检测方法,测定了50份国内外芝麻种质资源籽粒的脂肪含量,对这2种方法测定值进行比较分析结果表明,利用NMR法与索氏提取法测定的结果同样稳定,籽粒脂肪含量范围在29.48%-58.71%,而且2组测定结果极显著相关（系数为r=0.9918）,测定值的绝对偏差仅为0.10-2.05百分点。与索氏抽提法相比,核磁共振法可保证籽粒不破损,而且操作简便、快速,所测数据准确、可靠,不受种子含水量、种皮色等因素的影响。因此,该方法在今后芝麻籽粒脂肪含量快速测定和品质性状研究中具有广泛的应用前景。
- 魏利斌苗红梅李春张海洋
- 关键词：芝麻脂肪含量索氏提取法核磁共振法
- 芝麻高油酸基因SiFAD2-1及其SNP标记
- 本发明属于芝麻分子遗传育种技术领域，具体涉及一个控制芝麻油酸含量性状的基因<I>SiFAD2‑1</I>及其SNP标记<I>SiSNPFAD2‑1</I>。该基因位于芝麻第4条染色体上，属于不完全显性控制基因；与野生型等...
- 苗红梅张海洋马琴曹恒春琚铭王硕李春段迎辉张战有
- 一组用于区分芝麻13对染色体的BAC标记
- 本发明属于芝麻染色体组技术领域，具体涉及一组用于区分芝麻13对染色体的BAC标记专利申请事宜。该组BAC标记共包括17个BAC信息，BAC标记基本信息具体如下表所示，BAC双末端碱基序列信息具体如SEQ ID NO.1~...
- 苗红梅张海洋赵瑞红马琴李春魏利斌段迎辉徐芳芳琚铭常淑娴
- 文献传递
- 芝麻栽培种与Sesamum radiatum野生种远缘杂交后代的分子鉴定方法
- 本发明公开了一种芝麻栽培种与Sesame radiatum野生种远缘杂交后代的分子鉴定方法，属生物技术领域。通过提取栽培种（Sesame indicum L.,2n=26）、野生种（Sesame radiatum,2n=...
- 张海洋苗红梅张体德魏利斌李春琚铭王慧丽
- 从枯萎病菌毒素中分离镰刀菌酸和脱氢镰刀菌酸的方法
- 本发明属于芝麻病害防治技术领域，具体涉及一种从枯萎病菌毒素中高效分离镰刀菌酸和脱氢镰刀菌酸的方法。该方法包括样品溶解、采用XBridge Prep C18色谱柱梯度洗脱分离、成分收集、提纯等步骤，其中在17.520min...
- 苗红梅张海洋李海玲段迎辉常淑娴魏利斌琚铭赵瑞红徐芳芳李春曲文文张文颖马琴芦海灵王慧丽
- 文献传递
- 一种与芝麻籽粒种皮色基因紧密连锁的SNP分子标记
- 本发明属于分子遗传育种技术领域，具体涉及一种与芝麻籽粒种皮色基因紧密连锁的SNP分子标记<i>Si</i>SCC2385。该标记在芝麻SNP遗传图谱中位于第9连锁群，195.48-197.79cM...
- 苗红梅张海洋李春魏利斌段迎辉徐芳芳张体德常淑娴曲文文
- 文献传递
