姚剑 作品数:46 被引量:238 H指数:8 供职机构: 安徽出入境检验检疫局 更多>> 发文基金: 国家质检总局科技计划项目 安徽省自然科学基金 国家质检公益性行业科研专项 更多>> 相关领域: 农业科学 轻工技术与工程 生物学 理学 更多>>
Illumina Miseq平台深度测定酸奶中微生物多样性 被引量:22 2016年 目的:建立Illumina Miseq深度测序筛查酸奶中微生物的方法,分析酸奶中微生物的多样性。方法:以9种酸奶样品为研究对象,提取酸奶中细菌基因组DNA,应用高通量测序技术测定细菌的16S r DNA v1-v3变异区序列,得到9种样品中微生物群体分布和丰度、以及不同样品间的菌种差异与进化关系。结果:酸奶中微生物主要为厚壁菌门(Firmicutes),占据99.6%之高,其中厚壁菌门主要以链球菌属(Streptococcus、87.1%)、乳杆菌属(Lactobacillus、10.3%)、乳球菌属(Lactococcus、0.3%)组成,9种酸奶中有3种同时含有链球菌属和乳杆菌属,其余6种样品中链球菌属几乎占据全部(>97%)。结论:Illumina Miseq深度测序技术可快速精确深入掌握酸奶中微生物多样性,结果对比显示不同酸奶菌种同质化程度高,其中链球菌属占绝对优势,同时发现部分酸奶标签标示不符。 智楠楠 宗凯 杨捷琳 姚剑 魏兆军关键词:酸奶 微生物 多样性 烟草炭疽菌的分子鉴定与检测 被引量:3 2015年 克隆并测定烟草炭疽菌r DNA全序列,序列全长2870 bp。序列比对发现,烟草炭疽菌与胶孢炭疽菌的rDNA序列相似性最高,达96.0%~96.2%;从构建的系统关系树也可以看出,烟草炭疽菌与胶孢炭疽菌聚成一个单独的分支,说明烟草炭疽菌与胶孢炭疽菌的亲缘关系最近。因此,结合烟草炭疽菌的形态学特征,可以初步将从贵州烟草分离的烟草炭疽菌鉴定为胶孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides)。根据所测烟草炭疽菌的rDNA序列设计特异性引物,不仅可以从8种不同的烟草病原真菌中鉴定出烟草炭疽菌,而且可以从7种炭疽菌中鉴定出烟草炭疽菌。用烟草炭疽菌接种普通烟,以接种发病的病组织总DNA为模板,利用该特异性引物进行PCR扩增,同样可以扩增出特异性条带,表明该方法可用于烟草炭疽菌的鉴定和快速检测。 柴欣 徐业平 姚剑 余晓峰 宗凯 李云飞 江彤关键词:RDNA序列 分子鉴定 稻粒黑粉病、稻曲病、恶苗病病原真菌的MALDI-TOF-MS鉴定规范化条件研究 2017年 采用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,简称MALDI-TOF-MS)技术对水稻作物的3种主要病原真菌进行分析,以获得稳定的指纹图谱。从菌物预处理方法、基质、点样方法等3个方面进行比较,对影响MALDI-TOF-MS分析结果的主要因素进行优化。结果表明,菌物预处理方法对检测结果的影响最大,热处理法在细胞壁较厚的真菌样品处理中可以获得较完整的生物信息;构建稻粒黑粉病病菌(Tilletia horrida)、稻曲病病菌(Ustilaginoidea virens)、恶苗病病菌(Fusarium moniliforme)的MALDI-TOF-MS鉴定规范化方法,扩充MALDI-TOF-MS指纹图谱数据库,可简便、快速、准确地对细胞壁加厚的真菌样品进行鉴定。 周莉质 宗凯 李云飞 姚剑 檀根甲关键词:MALDI-TOF-MS 稻粒黑粉病 稻曲病 恶苗病 指纹图谱 外来入侵种红脂大小蠹COⅠ基因分化的研究 被引量:2 2010年 红脂大小蠹Dendroctonu svalens LeConte为近年来危害最为严重的外来入侵生物。本研究利用特异引物扩增出红脂大小蠹COⅠ基因序列(GenBank登录号:GQ495096-GQ495128),在160个位点中发现3个该种与大小蠹属其他种不同的特异位点;比较不同地理种群的红脂大小蠹,发现中国种群间遗传分化不明显,说明入侵种的瓶颈效应,而遗传变异是入侵种与环境长期互作的结果;基于COⅠ基因序列比对的研究发现,入侵中国的红脂大小蠹与该虫原发生地北美洲部分种群具有同源性。 姚剑 温劲松 张龙娃 李云飞 陈雪娇 余晓峰关键词:红脂大小蠹 遗传分化 系统发育分析 世界大小蠹研究 被引量:6 2009年 通过对大小蠹属重要种的发生、为害的介绍和所有种形态、分布的总结,明确了D.rhizophagus的分类地位,列出大小蠹属19个种的检索表,供研究使用,以加强检验检疫,维护我国农林业生产和生态安全。 姚剑 殷玉生 余晓峰 张萍 郑海松 张龙娃 李云飞关键词:大小蠹 寄主 为害 球孢白僵菌菌株寄主专化性的研究 本研究测定了来源不同的12株球孢白僵菌(Beauveria bassiana)对马尾松毛虫(Dendrolimus punctatus)3~4龄幼虫的毒力及其中的8株对淡色库蚊(Culex pipiens pallens... 姚剑 李增智 樊美珍 张桂云关键词:球孢白僵菌 马尾松毛虫 淡色库蚊 生物测定 文献传递 利用多重PCR诊断水稻白叶枯病和细菌性条斑病的复合发生 被引量:4 2016年 为准确检测水稻白叶枯病菌、细菌性条斑病菌及这两种病菌的复合发生,利用软件DNAStar分析比较这两种菌的部分核酸序列,设计了检测这两种病菌的特异性引物。引物Xoo F-Xoo R能特异性扩增出水稻白叶枯病菌中一条大小162 bp的条带;引物Xooc F1-Xooc R1和Xooc F2-Xooc R2能够分别特异性扩增出水稻细菌性条斑病菌中690 bp和945 bp的条带。通过优化PCR反应条件,成功建立了多重PCR技术,可以对不同国家的水稻白叶枯病菌和细菌性条斑病菌进行准确检测,对由这两种病菌引起的复合侵染实现了准确诊断。 李云飞 陈雪娇 杨雪 张爱芳 谷春艳 高同春 陈雨 姚剑关键词:水稻白叶枯病菌 水稻细菌性条斑病菌 多重PCR 复合侵染 红脂大小囊信息素和遗传分化性及其在检疫上的应用研究 姚剑 张龙娃 温劲松 方元炜 余晓峰 郑海松 李刚 李云飞 陈昌骏 张萍 李增智 该课题利用形态学、分子生物学和化学生态手段,对该虫进行了系统研究,为检验检疫提供了理论依据,为昆虫生物防治提供了可行方案,为防范外来生物入侵提供了技术支撑。关键词: 四纹豆象及其近缘种基于COI基因的分子检测技术研究 2017年 四纹豆象是口岸检疫中经常截获的种类,本文以四纹豆象及其近缘种为研究对象,测定分析了COI基因516 bp碱基序列。序列分析结果表明:保守位点为353个,变异位点为163个,简约信息位点为134个,自裔位点为29个。基于Kimura 2-parameter模型分析遗传距离,结果显示:种内遗传距离介于0.001~0.013之间,平均遗传距离为0.008,种间遗传距离介于0.114~0.193,平均遗传距离为0.161。采用邻接法构建的COI基因序列系统发育树显示,同一物种聚为同一小支,且分支自展值均为100%。结果表明应用COI基因片段对四纹豆象及其近缘种进行分子鉴定具有可行性。 胡飞 李云飞 盛磊 宗凯 姚剑 魏兆军关键词:四纹豆象 分子检测 COI基因 物种鉴定 安徽省四地市水稻细菌性条斑病对链霉素的抗药性监测 被引量:1 2013年 于2010年采集安徽省滁州、安庆、宣城和巢湖4个城市水稻细菌性条斑病菌108株,以及2011年水稻细菌性条斑病菌168株,测定其对链霉素的抗药性。从这4个城市的发病叶片样本中分离纯化病原菌,并采用区分剂量法,配置含有10μg/mL链霉素的NA平板,能够在含药平板上生长的菌株为抗药性菌株,不能生长的为敏感菌株。从病原菌样本中分离纯化水稻细菌性条斑病菌,总的分离率为45.10%;抗药性监测结果表明,2010—2011年采自安徽省4个城市水稻细菌性条斑病菌在含10μg/mL链霉素的NA平板上不能生长,因此被认为是对链霉素的敏感菌株,未发现抗药性菌株。虽然未分离到田间对链霉素抗药性的水稻细菌性条斑病菌菌株,但由于链霉素具有较高的抗药性风险,因此对于该病菌对链霉素的抗药性仍需要连年进行。 李云飞 陈雪娇 檀根甲 姚剑关键词:水稻细菌性条斑病菌 链霉素 抗药性