夏志强
- 作品数:40 被引量:148H指数:7
- 供职机构:中国热带农业科学院热带生物技术研究所更多>>
- 发文基金:中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学轻工技术与工程理学更多>>
- 基因组选择拓展木薯生物能源应用潜力
- 、清洁能源生产与环境安全是二十一世纪这个时代的主题.热带地区丰富的环境资源及其特有的高生物转化物种如木薯、甘蔗等成为优先的选择。本研究组通过完成木薯的全基因组测序和比较基因组、转录组分析,发现栽培木薯在进化中形成的对高光...
- 王文泉卢诚陈新夏志强李开绵
- 关键词:木薯育种技术基因组学
- 基因组学进展及其在热带作物领域中的应用被引量:4
- 2020年
- 基因组学的发展,不仅能获得物种个体水平染色体的精准DNA序列,解析生命科学的基本问题,而且其超高通量技术使得在群体水平诠释物种遗传多样性成为可能,从而改变了现代生命科学的进程和研究方式。本文概述了基因组技术的最新进展,以及与相关组学技术结合,在物种群体遗传结构多样性、功能基因发掘、生物进化以及精准育种领域的广泛应用;同时简述了热带作物的生物学特性、基因组研究进展及其存在的问题,并对未来基因组学发展与新的应用领域进行了简评。
- 周新成夏志强陈新陈新邹枚伶卢诚王海燕
- 关键词:基因组学进化热带作物
- 木薯干旱胁迫下甲基化变化分析被引量:2
- 2017年
- 研究了两个个体特征差异较大且面对干旱有不同响应机制的木薯品种SC124和Arg7,比较了在干旱处理3 d、12 d、18 d后DNA甲基化的变化情况,探究DNA甲基化在木薯抵御干旱胁迫中的作用。利用全基因组甲基化检测技术扩增片段单核苷酸多态性位点和甲基化位点(AFSM)检测基因组上的DNA甲基化水平变化情况。根据AFSM建库标准构建了测序文库,并对文库进行了质量检测。根据AFSM测序数据分析表明,木薯基因组中叶片的甲基化比例为5.9%~28.6%,根的甲基化比例为4.1%~13.5%。干旱胁迫使植株甲基化总体水平产生变化,并且具有组织和时空特异性。木薯面对干旱胁迫根据品种的不同,DNA甲基化具有不同的相应特点,且和处理时期和组织部位相关。
- 冯素彬邹枚伶张圣奎夏志强王文泉
- 关键词:木薯DNA甲基化干旱胁迫
- 海南几种珍稀濒危和重要经济植物遗传多样性研究
- 卢诚王海燕周新成王文泉邹枚伶陈新夏志强符国瑷潘坤文明富付瑜华
- 该成果属于种质资源学与珍稀濒危植物保护生物学领域。采用居群生态分布调查与收集结合遗传多样性分析方法,阐明物种资源拥有量及濒危状况及可能原因。项目历时10年,对8种海南珍稀濒危植物和重要经济植物,包括海南白木香、益智、野生...
- 关键词:
- 关键词:经济植物
- 木薯种质库遗传多样性的EST-SSR标记被引量:30
- 2008年
- 采用49对表达序列标签-微卫星标记(EST-SSR)引物对76份木薯材料(39份新引进材料和37份原始材料)进行遗传多样性分析,共获得135个多态性位点,每对引物检测等位基因数为1~4个,平均为2.75个;扩增产物的片段大小范围在250~750bp之间。根据遗传相似系数的聚类分析将所有材料分为5组,即A、B、C、D和E组,其中A、C、D、E4个组均为新引进种质,B组以0.6250为阈值,又将其分为5个亚组,其中B1、B2除了个别外,均为新引进种质,B2来自非洲,而B3、B4和B5主要为原有种质和育种品系。同时估算了分组后组间的遗传多样性指数,发现其平均遗传多样性指数达到0.4465。比较原来多样性分析结果,说明新引进这一批国外种质具有新的遗传类型,丰富了我国木薯种质资源库。
- 韦祖生夏志强李开绵王文泉
- 关键词:木薯种质资源EST-SSR
- 一种胞嘧啶甲基化挖掘的方法
- 本发明公开了一种胞嘧啶甲基化挖掘的方法,包括步骤:A)、目标数据获得:对同一来源的基因组由HpaII与MspI甲基化敏感酶切后扩增通过高通量测序;B)通过AFSM技术建库:对同一样品构建HpaII与MpaI酶切DNA文库...
- 夏志强邹枚伶王文泉张圣奎冯素彬
- 文献传递
- 木薯MeHB2转录因子的克隆与表达分析被引量:3
- 2016年
- 该研究以木薯(Manihot esculenta Crantz)Ku50为实验材料,采用RT-PCR方法从叶片中克隆了1个HD-Zip基因MeHB2。MeHB2基因含有882bp的开放阅读框,编码293个氨基酸。蛋白质保守结构预测显示,MeHB2编码的蛋白含有Homeodomain、Leu zipper和HD-Zip_N等结构域,属于HD-Zip II成员。进化树分析表明,MeHB2与麻疯树、杨树和杞柳中同源基因的亲缘关系较近。实时荧光定量PCR分析表明,低温胁迫、渗透胁迫、ABA和H2O2均可诱导MeHB2基因的表达,而盐胁迫抑制其表达。此外,MeHB2的表达量还受到遮荫胁迫的诱导。研究表明,MeHB2在木薯非生物逆境调控中扮演重要角色。
- 丁泽红付莉莉铁韦韦颜彦夏志强王文泉胡伟
- 关键词:木薯HD-ZIP克隆基因表达
- DNA指纹图谱的构建方法、构建装置及终端设备
- 本申请适用于数据处理技术领域,提供了一种DNA指纹图谱的构建方法、构建装置及终端设备,包括:获取目标物种的M个单碱基多态性位点以及每个单碱基多态性位点上的碱基信息;根据所述每个单碱基多态性位点上的碱基信息,从所述M个单碱...
- 邹枚伶王文泉江思容夏志强张辰笈孙倩
- 文献传递
- 植物群体DNA甲基化研究进展被引量:1
- 2021年
- DNA甲基化是表观遗传学的重要组成部分,通常发生在植物胞嘧啶碱基中,包含CG、CHG、CHH三种类型。植物群体中DNA甲基化的变异是植物表型和基因表达变异的重要来源之一。对植物群体DNA甲基化的研究,弥补了群体遗传学中不符合孟德尔遗传定律的表型的重要认识,有利于进一步阐明群体表观遗传变异的遗传来源、因果关系,能更清楚地解释植物对于生长环境的适应性以及植物种内和种间多样性,对于解析表观遗传与复杂表型之间的关系也至关重要。本文主要回顾了植物群体中DNA甲基化在进化、遗传多样性、群体遗传稳定性与变异,及其在基因表达中的作用研究进展,以及展望了植物群体DNA甲基化新的研究手段和研究主题方面的前景,旨在为植物群体DNA甲基化研究提供帮助。
- 邹枚伶夏志强夏志强
- 关键词:DNA甲基化进化植物群体
- 木薯SAD基因片段的克隆及其序列分析被引量:7
- 2009年
- 通过比较拟南芥和蓖麻的SAD基因同源区域,设计引物并以木薯基因组DNA为模板进行PCR扩增,得到长度为240 bp的基因片段,命名为木薯SAD。序列相似性检索结果表明,木薯SAD基因的核苷酸序列与基因库中登陆的大戟科植物蓖麻、千年桐的mRNA序列同源性达94%,与大豆、芝麻、葵花等油料作物的mRNA序列同源性分别达到87%、86%和82%;系统进化分析进一步表明,木薯SAD基因与大戟科植物蓖麻、麻疯树和千年桐的亲缘关系最近,该结果与传统分类学将木薯与蓖麻、千年桐和麻疯树归于大戟科的结论相符,而木薯SAD基因与芝麻、大豆、莲花、葵花等植物种仁不饱和脂肪酸含量较高的植物在进化上具有较高的保守性。
- 杨鹏雅王文泉周建国李开绵夏志强
- 关键词:木薯克隆