唐可成
- 作品数：2 被引量：3H指数：1
- 供职机构：国防科学技术大学计算机学院更多>>
- 发文基金：湖南省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学化学工程更多>>
- miRNA靶标预测算法和靶标作用机制的研究
- MicroRNA/(简称miRNA/)是一类对细胞生成、代谢有重要影响的非编码RNA,而预测miRNA作用靶标有助于认识其作用机制。依据种子完全连续匹配、自由能和保守性,研究者已经提出了许多靶标预测算法,但由于对miRN...
- 唐可成
- 关键词：MIRNA种子自由能保守性
- 文献传递
- 基于堆积协变信息与最小自由能预测含伪结的RNA二级结构被引量：3
- 2008年
- RNA伪结预测是RNA研究的一个难点问题。文中提出一种基于堆积协变信息与最小自由能的RNA伪结预测方法。该方法使用已知结构的RNA比对序列(ClustalW比对和结构比对)测试此方法,侧重考虑相邻碱基对之间相互作用形成的堆积协变信息,并结合最小自由能方法对碱基配对综合评分,通过逐步迭代求得含伪结的RNA二级结构。结果表明,此方法能正确预测伪结,其平均敏感性和特异性优于参考算法,并且结构比对的预测性能比ClustalW比对的预测性能更加稳定。文中同时讨论了不同协变信息权重因子对预测性能的影响,发现权重因子比值在λ1:λ2=5:1时,预测性能达到最优。
- 杨金伟骆志刚方小永王金华唐可成
- 关键词：RNA二级结构
