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马翔
作品数:
1
被引量:5
H指数:1
供职机构:
中国科学技术大学信息科学技术学院电子科学与技术系
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发文基金:
中国科学院知识创新工程重要方向项目
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相关领域:
生物学
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合作作者
谢丹
中国科学技术大学信息科学技术学...
冯焕清
中国科学技术大学信息科学技术学...
李骜
中国科学技术大学信息科学技术学...
王明会
中国科学技术大学信息科学技术学...
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谢丹
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中国生物医学...
年份
1篇
2006
共
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基于加权模糊k近邻方法的蛋白质亚细胞位点预测
被引量:5
2006年
蛋白质只有在特定的亚细胞位点(如细胞核、线粒体、细胞质等)才能参与正常的生命活动,因此蛋白质的哑细胞定位信息对于了解其功能有重要的意义。提出一种应用于蛋白亚细胞定位的多模糊k近邻加权投票算法。使用PSI-BLAST搜索得到的PSSM矩阵,以及1~7阶氨基酸对的信息作为输入特征,分别建立了8个模糊k近邻分类器,最后对所有分类器的结果使用加权投票得到最终预测结果。对包含四类亚细胞位置的RH-2427数据集进行jacknife测试,总预测精度达到88.1%,好于包括单一模糊k近邻在内的多种其它预测方法。同时,该方法可以方便地扩展到对包含叶绿体、高尔基体、溶酶体等更多类亚细胞位点的预测。
马翔
王明会
李骜
谢丹
冯焕清
关键词:
投票算法
亚细胞定位
生物信息学
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