韩菲
- 作品数：2 被引量：1H指数：1
- 供职机构：青岛农业大学更多>>
- 发文基金：青岛市科技发展计划项目山东省优秀中青年科学家科研奖励基金国家苹果产业技术体系建设专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 柱型苹果分枝相关基因的克隆与表达分析
- 韩菲
- 文献传递
- 柱型苹果GRAS基因家族MdSCR的克隆与生物信息学分析被引量：1
- 2012年
- 以"富士×特拉蒙"杂交后代柱型株系新梢为试材,用同源克隆方法,得到了柱型苹果GRAS基因家族的MdSCR基因,开放阅读框(ORF)长度为1458bp,编码486个氨基酸,推测其蛋白质分子质量为54.894kD,等电点(pI)为5.96,具有GRAS基因家族典型结构域。MdSCR基因与毛果杨(Populus trichocarpa)GRAS转录因子的氨基酸序列具有67.8%的相似性,与江南卷柏(Selaginella moellendorffii)、葡萄(Vitis vinifera)、大豆(Glycine max)的SCARECROW-like氨基酸序列均有58.5%以上的相似性。氨基酸聚类分析表明,苹果和毛果杨、江南卷柏聚类关系最近,其次是葡萄,关系最远的是欧洲赤松;生物信息学分析表明,MdSCR的蛋白质二级结构有208个α-螺旋,54个延伸链和224个无规则折叠区。
- 韩菲戴洪义张玉刚
- 关键词：柱型苹果
