陈婕
- 作品数:2 被引量:7H指数:1
- 供职机构:复旦大学生命科学学院生物多样性与生态工程教育部重点实验室更多>>
- 发文基金:上海市教育委员会重点学科基金科技基础性工作专项国家大学生创新性实验计划更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 利用8个基因的DNA序列探讨南洋杉科的系统发育关系和起源时间被引量:1
- 2009年
- 南洋杉科是最原始的松杉纲类群之一,其系统发育关系与起源(分支)时间研究具有极为重要的意义.利用自行测定和Gen Bank中获得的核核糖体18S和26S,叶绿体16S,rbcL,matK和rps4以及线粒体coxⅠ和atp1等8个基因的DNA序列,构建了南洋杉科的分子系统树,确定该科属间系统发育关系应为((瓦勒迈杉属,贝壳杉属),南洋杉属).以瓦勒迈杉属和南洋杉属Araucaria族和Eutacta族的化石记录作为时间标定,估计南洋杉科的起源在(308±53)百万年前,即该科在石炭纪晚期起源,而非以往认为的三叠纪.用相同基因组合还估计出南洋杉属起源于(246±47)百万年前,贝壳杉属起源于(61±15)百万年前.对不同基因所构建的系统树进行统计分析并对它们所估计的起源时间进行比较表明,叶绿体matK和rps4基因较为适合南洋杉科的系统发育与起源时间估计研究.
- 刘念朱勇魏宗贤陈婕王庆彪简曙光周党卫施婧杨永钟扬
- 关键词:系统发育
- 麻黄属rbcL基因的适应性进化检测与结构模建被引量:6
- 2010年
- 采用PAML程序检测麻黄属14种及其他9种裸子植物rbcL基因的适应性进化.以"分支"模型检测到该属植物RbcL蛋白催化活性区先后经历了3次大范围的选择;以"分支-位点"模型检测出在该基因第365位密码子位点存在正选择的物种;计算机三维结构模建进一步显示该位点引起RbcL蛋白βG折叠、βH折叠和βE折叠的空间结构变化,这些变化可能与麻黄属该蛋白对环境的适应有关.
- 刘念王庆彪陈婕朱勇扎西次仁胡祎瑶陈凡钟扬
- 关键词:麻黄属裸子植物