袁志栋
- 作品数：32 被引量：60H指数：4
- 供职机构：湖南科技大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金湖南省自然科学基金湖南省普通高等学校教学改革研究项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学文化科学环境科学与工程更多>>
- 基于Web技术的核小体在线预测平台实现被引量：1
- 2010年
- 核小体定位是真核生物基因转录调节的重要方式,要彻底了解基因表达调控信息,就必须考虑核小体定位的调控作用,因此提供一个快速、准确的核小体在线预测平台十分必要。基于本实验室开发的运用弯曲度谱预测核小体位置的核心算法,我们构建了基于Matlab Web服务和ASP技术的核小体在线预测平台(http://www.gri.seu.edu.cn/icons/)。本文详细介绍了该平台的设计、实现过程及平台的预测结果。
- 张德金刘宏德袁志栋孙啸
- 关键词：核小体定位MATLABWEB技术
- 鸡BF1和BF2基因实时荧光定量PCR检测方法的建立
- 2013年
- 目的建立鸡主要组织相容性复合体(Major histocompatibility complex,MHC)BF1和BF2基因实时荧光定量PCR[Real-time fluorescent quantitative(FQ)-PCR]检测方法。方法从鸡外周血淋巴白细胞(Peripheral blood leuk-ocytes,PBLs)中提取细胞总RNA,以其为模板,根据BF1、BF2和GAPDH基因相对保守序列各设计一对引物,应用RT-PCR法扩增目的基因,分别克隆至pGM-T载体上,制备重组质粒标准品,经PCR、EcoRⅠ酶切及测序鉴定;优化反应体系及反应条件,绘制标准曲线,建立Real-time FQ-PCR检测方法,并验证其敏感性、特异性及重复性。结果重组质粒标准品经PCR、酶切及测序鉴定构建正确;建立的定量标准曲线临界循环数(Threshold cycle,Ct)与BF1、BF2和GAPDH起始质粒DNA拷贝数的对数之间线性关系良好,相关系数分别为1.00、0.98、0.99,扩增效率分别为0.8、1.1、1.1;该方法的敏感性可达101copies/μl;融解曲线分析表明扩增效率一致,特异性较好;质粒DNA标准品3次检测的CV值误差不超过0.5,均小于5%。结论已成功建立了鸡BF1和BF2基因实时荧光定量PCR检测方法,为下一步应用该法检测BF1和BF2基因的转录水平奠定了基础。
- 金元昌李玉峰袁志栋
- 关键词：主要组织相容性复合体实时荧光定量PCR
- 生物技术专业实践教学体系改革与实践探讨被引量：8
- 2013年
- 实践教学是培养高素质应用型生物技术专业人才的重要途径,在整个教学体系中占有重要地位。阐述了生物技术专业实践教学体系的组成特点,结合存在的问题,从改革生物技术实验教学体系、拓宽校内外实践教学交流平台、建立产学结合培养机制和打造高水平应用型师资队伍等方面对加强和完善实践教学体系进行了研究和探讨。
- 谭树华袁志栋刘文海
- 关键词：生物技术实践教学体系
- 两种PrP截短型多肽的神经毒性
- 2005年
- PrP106～126和PrP118～135分别对应于人PrPC序列中106～126残基和118～135残基,两个肽段在试验中具备PrPSc的部分病理特症,因此PrP106～126和PrP118～135就成为了研究PrPSc神经细胞毒性致病机制的合适的模型。
- 袁志栋王志亮刘雨田吴晓东刘海生
- 关键词：神经细胞毒性
- microRNA序列和表达模式的多样性被引量：2
- 2015年
- microRNA(miRNA)在后生动植物细胞分化、生长发育、正常生理功能的维持、疾病的发生发展和转归中发挥重要功能.通常认为,已知miRNA对应的序列就是存储于miRBase数据库中相应的成熟miRNA序列.然而,人们忽视了miRNA序列长度和碱基的可变性,低估了来源于同一miRNA基因、非主要表达的miRNA的多样性及其功能的重要性.由于测序技术的快速发展和广泛使用,人们利用二代测序技术数据发现了miRNA序列和miRNA表达水平的多样性.基于miRNA序列和表达的多样性,本文介绍了miRNA序列5′端、3′端和内部的变异体、miRNA变异体的时空差异性表达和miRNA优势表达臂转换等方面近年来的研究进展.
- 丁素萍刘丽莉黄婷王营严明理袁志栋
- 关键词：MIRNA多样性
- 水牛朊蛋白成熟片段基因的克隆与原核表达被引量：4
- 2006年
- 目的克隆、分析水牛朊蛋白(prionprotein,PrP)成熟片段基因,并获取纯化的表达产物。方法将应用PCR技术扩增的水牛成熟PrP的核酸序列克隆到表达载体pET-32a,并分析其序列;把阳性克隆质粒pET-32a-BPrP转化表达菌BL21(DE3),鉴定纯化的表达产物。结果水牛朊蛋白成熟片段核酸序列及其推导的氨基酸序列与已知其他牛科动物的成熟PrP核酸、氨基酸序列间的相似性分别在97.1%和97.2%以上,并且发现水牛成熟PrP有5个重复序列,编码的氨基酸序列其中有2个九肽和3个八肽重复序列。具有较高的表达水平的PrP融合蛋白被纯化后,用Western印迹实验证明该蛋白具有PrP抗原活性。结论首次报道了克隆、分析水牛朊蛋白成熟片段基因,发现水牛成熟PrP有5个重复序列,并获得了具PrP抗原活性的水牛成熟PrP融合蛋白。
- 袁志栋王志亮刘雨田吴晓东赵永刚刘海生
- 关键词：克隆原核表达
- 人类胚胎干细胞分化成视网膜色素上皮细胞过程中的microRNA的变化
- 老年黄斑变性(AMD)是一种累及视网膜黄斑的变性眼疾，至今都没有特效治疗手段。近年来发展了用多能干细胞衍生视网膜色素上皮细胞(RPE)作为AMD替代性治疗新的方案。为了解胚胎干细胞(ESC)分化过程中microRNA(m...
- 丁素萍黄婷王营刘丽莉严明理袁志栋
- 关键词：胚胎干细胞视网膜色素上皮细胞
- 水貂朊蛋白前体基因的克隆与原核表达
- 通过设计克隆表达引物,PCR扩增了水貂朊蛋白前体基因,构建了水貂朊蛋白前体基因的表达载体并进行了测序分析.将所筛选出的阳性克隆质粒转化到表达菌BL21(DE3).纯化表达产物,WesternBlot鉴定表明获得了目的产物...
- 袁志栋王志亮刘雨田吴晓东刘海生
- 关键词：基因克隆基因序列原核表达PCR扩增
- 文献传递
- 可传递性海绵状脑病
- 可传递性海绵状脑病(Transmissible Spongiform Encephalopatbies,TSEs),又称朊病毒病(PrionDisease),是动物与人的一类慢性、致死性中枢神经系统疾病。包括羊痒病(Sc...
- 袁志栋王志亮
- 文献传递
- Identification of novel microRNAs in primates by using the synteny information and small RNA deep sequencing data
- Background: Current in-silico methods that are used for genome-wide microRNA (miRNA) prediction are mainly bas...
- 袁志栋刘宏德聂玉敏丁素萍严明理谭树华金元昌
- 关键词：GENOME-WIDEMAMMALIANSYNTENYSEQUENCING
