胡颖
- 作品数：10 被引量：96H指数：7
- 供职机构：广西大学农学院亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广西壮族自治区自然科学基金广西高校优秀人才计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 金柑花蕾酵母双杂交cDNA文库构建及评价被引量：14
- 2019年
- 为了探索金柑花发育的分子机制并研究与金柑花发育相关重要基因编码的蛋白质之间的相互作用,本研究以融安金柑不同生长时期的花蕾为材料,采用SMART技术构建了cDNA文库,对该文库进行了鉴定评价。经检测,所构建的cDNA文库滴度为2.83×10^8cfu/mL,文库库容为1.42×10^10cfu,重组率为97.91%,插入的双链cDNA片段长度主要分布在250~2 000 bp之间。结果表明,该文库达到了建库标准,理论上涵盖了全部与融安金柑花蕾发育相关的基因,为后续利用酵母双杂交技术筛选互作蛋白提供了物质基础。
- 苏玲李彬王青胡颖罗聪何新华
- 关键词：金柑CDNA文库SMART技术酵母双杂交技术
- 柠檬总RNA提取方法研究被引量：13
- 2015年
- 为了获得高质量的柠檬RNA,本研究从操作时间、成本、所得RNA的纯度与浓度等方面比较了5种方法提取香水柠檬不同组织总RNA的效果,并筛选最适合提取柠檬组织样品RNA的方法。结果表明:改良的RNA试剂盒提取法效果最好。该方法极适合提取香水柠檬总RNA。利用此方法可以成功提取白花柠檬、广西土柠檬和金柑的总RNA,也可以提取高质量的芒果总RNA。
- 安振宇何新华董龙张树伟胡颖罗聪黄桂香
- 关键词：总RNA纯度
- 广西西北部高原地区柿种质资源调查及遗传多样性分析被引量：23
- 2012年
- 调查和研究了广西西北部云贵高原地区柿种质资源状况,并对收集到的柿种质进行表型系统聚类和SCoT遗传多样性分析。结果表明,广西西北部云贵高原地区柿种质资源较丰富,至少拥有柿、油柿和野柿3个种31个不同品种和类型,部分地方仍保存有原始的野生种。不同柿种质在形态和DNA水平上都表现出很大的变异,具有丰富的多样性。35个相对独立的表型性状被用于柿种质的Q型系统聚类分析,在欧氏距离D=9.8处,31份种质被分为5组,与果形及种质类型在一定程度上相吻合。13条SCoT多态性引物可从31份柿种质中扩增出161个DNA位点,多态性带比例为95.65%;UPGMA聚类分析显示,SCoT标记能将31份柿种质完全区分开,在相似系数0.686的水平将其分为5大类,与表型分析结果基本一致。
- 邓立宝何新华李天文胡颖
- 关键词：种质资源
- 低温胁迫下龙眼碳酸酐酶基因(CA)的克隆与表达分析被引量：12
- 2012年
- 应用蛋白质组学研究低温胁迫下龙眼叶片蛋白质组变化时发现碳酸酐酶(CA)蛋白下调表达。利用RT-PCR方法克隆CA基因的全长cDNA,GenBank登录号JN033201,长度为1119bp,包括1个966bp的开放阅读框,编码321bp的氨基酸序列,同源性分析表明,12个不同植物同源性为81%～88%。龙眼CA基因具有典型的CA结构域,并且非常保守。实时荧光定量分析结果表明,CA在龙眼根、茎、叶中都有表达,为组成型表达,在叶中的表达量最高,茎和根中的表达量最少。CA基因在低温胁迫下随着低温胁迫时间的延长而发生变化。将CA在大肠杆菌中表达,获得1个约40.5kD的外源蛋白。推测CA表达与低温胁迫有关。
- 陈虎何新华罗聪杨丽涛黄杏胡颖
- 关键词：龙眼低温胁迫蛋白质组学差异蛋白碳酸酐酶
- 龙眼水通道蛋白基因(DLPIP1)的克隆与表达分析被引量：11
- 2012年
- 应用蛋白质组学研究低温胁迫下龙眼叶片蛋白质组变化时，发现PIP1蛋白在龙眼低温胁迫中上调表达。应用RACE技术克隆龙眼水通道蛋白基因全长eDNA，命名为DL纠纠，基因登陆号为JN572691，长度为1132bp，包括1个900bp的开放阅读框，编码299个氨基酸序列，同源性分析表明，DLPIP1在21个不同植物中的一致性为90％-93％。应用生物信息学软件对DLPIP1氨基酸序列分析表明，含有7个跨膜区，有2个NPA单元，其氨基酸残基与MIP家族蛋白保守区序列完全一致。氨基酸序列比对发现，该序列与其他物种PIP质膜水通道蛋白氨基酸序列有很高的同源性。利用实时荧光定量技术对现肼川在低温胁迫下不同组织表达谱分析表明，现用纠在龙眼根、茎、叶中都有表达，在根中的表达量最高，其次是茎和叶。DLPIP1在低温胁迫时，随着低温胁迫时间的延长而发生变化。这说明DLPIP1蛋白在龙眼低温逆境过程中起作用。
- 陈虎何新华罗聪邓立宝胡颖李明娟杨丽涛
- 关键词：龙眼水通道蛋白低温胁迫克隆
- 柠檬F-box基因的克隆及表达分析被引量：3
- 2015年
- 本研究以香水柠檬幼嫩叶片为材料,在前期通过De Novo技术获得的F-box基因片段基础上设计引物,利用RT-PCR技术成功克隆出长度为585 bp的F-box基因,命名为LFB1,该基因编码194个氨基酸,该氨基酸序列在N端具有F-box结构域,生物信息学分析表明:该蛋白分子量为48.94 k D,等电点:5.2。进化分析发现其与克里曼丁桔(Citrus clementina)聚在一起。q RT-PCR分析表明:该基因在植株的根、茎、嫩叶、老叶、花蕾、花苞、幼果、成熟果中均有表达,LFB1基因在组织中的表达量是:茎>老叶>根>花蕾>成熟果>嫩叶>幼果;在花的不同器官的表达分析,发现该基因在雄蕊中的表达量最高,其它组织则相对较低,在雄蕊中基因的表达量是其它组织的10倍左右;在逆境胁迫下,该基因的表达量发生明显变化,表明该基因与植株的生长发育、花粉的发育以及环境胁迫可能有着一定的关系。
- 安振宇张树伟何新华李丽淑罗聪黄桂香林蔚胡颖董龙
- 关键词：柠檬克隆
- 芒果类黄酮磺基转移酶基因克隆及表达分析被引量：8
- 2014年
- 利用前期芒果逆境差异显示的基因数据设计引物,从四季芒基因组DNA和cDNA中克隆了1条长为1208 bp的基因片段。生物信息学分析发现,该基因属于类黄酮磺基转移酶(flavonoid sulfotransferase)基因,在第71-334个氨基酸中包含一个保守的Sulfotransferase结构域,命名为芒果类黄酮磺基转移酶基因(MiST)。该基因编码341个氨基酸,分子量为85.14 ku,等电点为5.09,不含内含子,在不同芒果品种之间其核苷酸和氨基酸序列均高度保守。半定量表达模式分析显示,该基因在四季芒茎、叶、花和果中均有表达,但在谢花后20 d的小果和谢花后40 d的中果中的表达量较高,表明该基因可能与芒果果实中黄酮的生物合成有关。
- 董龙罗聪何新华胡颖余海霞
- 关键词：芒果
- 金柑开花关键基因FcFT1的克隆及表达分析被引量：2
- 2016年
- 本研究以融安金柑为试材,采用同源克隆技术获得成花素基因Fc FT1全长序列,并对该基因的生物信息学和遗传进化关系进行了分析。利用q RT-PCR技术,分析了Fc FT1在花发育期间不同花器官、不同组织,以及日周期中Fc FT1在花、茎、叶的表达情况。结果表明:Fc FT1基因完整开放阅读框为531 bp,编码177个氨基酸。Fc FT1编码的蛋白具有单一而非常保守的PEBP结构域;蛋白质结构比较不稳定,为亲水蛋白。系统进化树表明Fc FT1与甜橙、温州蜜柑和枳壳中的FT同源基因亲缘关系最近。q RT-PCR结果显示,在花发育期,花药中Fc FT1表达量最高;日周期变化中,Fc FT1在花、茎、叶中的平均表达量差距不显著,表达较稳定。本研究结果为进一步揭示FT基因在金柑开花调控中的功能奠定了基础。
- 张奕何新华胡颖旦帅男徐趁林蔚
- 关键词：金柑克隆
- 杧果MGAPDH同源基因的克隆及其表达分析被引量：11
- 2011年
- 甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)是糖代谢和能量代谢过程中的关键酶。根据GAPDH基因保守序列设计PCR引物,利用RT-PCR和改良RACE技术,首次从杧果中分离克隆出MGAPDH同源基因的cDNA全长序列。该序列全长为1 356 bp,开放阅读框为1 203 bp,编码401个氨基酸。利用分子生物学软件对MGAPDH蛋白进行生物信息学分析,结果显示:MGAPDH蛋白分子量为42.8 ku,等电点为8.9;该蛋白包含2个功能域,即NADB_Rossmannsuperfamily和Gp_dh_C superfamily;MGAPDH蛋白不含信号肽序列和跨膜结构,是非分泌蛋白,位于叶绿体中。氨基酸序列进化分析结果显示,杧果MGAPDH蛋白可能与光合作用有关。半定量分析显示,杧果MGAPDH同源基因在杧果不同组织中均表达,并且表达水平差异不明显,说明杧果MGAPDH同源基因可作为杧果基因差异表达的内参基因。
- 罗聪何新华胡颖谭超欧世金
- 关键词：杧果
- 金柑FcSOC1同源基因的克隆及表达分析被引量：6
- 2015年
- 通过检测这对同源基因的表达水平,来分析这对同源基因与花器官发育的关系。采用同源克隆技术从金柑花中克隆出Fc SOC1基因的c DNA全长序列并进行生物信息分析;利用实时荧光定量PCR技术分析Fc SOC1基因在金柑不同组织、器官的表达特性。序列分析表明获得这对同源基因全长为660 bp和636 bp,分别编码220和212个氨基酸,分别命名他们为Fc SOC1a和Fc SOC1b。同源性分析显示,其与同属于芸香科的克里曼丁桔,相似性达98%,和甜橙的相似性也达到90%以上。实时荧光定量PCR表示Fc SOC1a和Fc SOC1b在营养器官和生殖器官均有表达。在营养器官的表达略有不同,但是在生殖器官的表达均在花蕾发育初期与后期急剧升高,并且在花中的表达量明显大于在其他部位的表达量。这对同源基因的高表达部位为茎、叶、花蕾、花芽、花瓣、花托、子房。Fc SOC1a和Fc SOC1b在花中显著表达,根据其表达特性推测,其可能在调控花器官发育上起着重要作用。根据这两个基因在营养器官的表达不同以及之间同源性较低,说明其功能已经出现分化。
- 旦帅男胡颖何新华张奕安振宇安振宇罗聪罗聪
- 关键词：金柑克隆
