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徐晓秋
作品数:
1
被引量:8
H指数:1
供职机构:
大连大学物理科学与技术学院物理学系
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相关领域:
生物学
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合作作者
谭欣欣
大连大学信息工程学院数学系
左铭杰
大连大学物理科学与技术学院物理...
初立元
大连大学物理科学与技术学院物理...
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大连大学学报
年份
1篇
2001
共
1
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DNA分类方法的探讨
被引量:8
2001年
DNA序列分类的方法有很多种.本文给出了两种模型都是在图象的基础上,利用图象的直观、易于分析等优点,找到各种碱基不同的特征,得出一个比较合理的方法. 在建立模型时,先计算出给定的前20种DNA序列中各碱基A,G、C、T的含量 (将一串长序列简化成了四个百分含量数值,大大简化了序列),并以此含量为数据作出直角坐标系下的二维曲线.根据曲线的特征,得出了两个算法,一个是以其中的一个DNA序列中碱基的含量大于其它三种含量为特征分出类别,对21至40种序列的分类正确率达到 80%,对于题中所给的 182种序列分类正确率为 42%;另一个是通过转化曲线为直线的方法找出符合分类特征的区间,根据是否在此区间内而分出类别,对21至40种序列的分类正确率达到100%,对于题中所给的182种序列分类正确率为85%. 最后,通过对比两种模型的结果,判断出两种模型的优劣,并分析了其中的原因.
徐晓秋
初立元
左铭杰
谭欣欣
关键词:
DNA序列
碱基
人类基因组计划
生物信息学
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