张建武
- 作品数:29 被引量:173H指数:7
- 供职机构:中国农业科学院上海兽医研究所更多>>
- 发文基金:国家科技支撑计划国家高技术研究发展计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学医药卫生更多>>
- 猪源乙型脑炎病毒的分离鉴定及E基因分析
- 本文以RT-PCR检测猪病料中的乙型脑炎病毒,并对阳性病料作病毒分离与纯化。通过空斑减数试验,测定分离株和P3株的中和指数。克隆并分析了分离株的prM-E基因序列,将推导的E蛋白序列与GENBank中乙型脑炎病毒的E蛋白...
- 郑浩张建武袁世山
- 关键词:乙型脑炎病毒E基因
- 文献传递
- 猪源乙型脑炎病毒的分离鉴定及其E基因分析被引量:15
- 2009年
- 采用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)方法检测猪流产胎儿病料中的乙型脑炎病毒(JEV),并对阳性病料做病毒分离与纯化。通过空斑减数试验测定了分离株和JEV P3株的中和指数。对分离株的pr M-E基因进行克隆并测序,将推导的E蛋白序列与GenBank中登录的JEV毒株的E蛋白序列做比较分析。以E基因序列为基础,绘制进化树。结果显示,在检测的9份病料中有3份呈JEV阳性,并分离出1株JEV,命名为HEN0701。经测定,P3株的中和指数为12,分离株的中和指数为2。pr M与E基因的序列分析表明,分离株与P3和Beijing-1株的同源性较低,最高仅为87.7%;而与JEV/sw/Mie/40/2004、KV1899、SH17 M-07和YN79-Bao83株的同源性较高,最低为96.6%。进化分析表明,分离株属基因Ⅰ型。E蛋白序列分析结果显示,分离株与基因Ⅰ型JEV的E蛋白序列高度同源,且与SH-53、JEV/sw/Mie/40/2004和VN22/Viet Nam/2002/swine blood株的E蛋白序列完全相同,而与基因Ⅲ型JEV的E蛋白序列存在4个共同的氨基酸变异位点。
- 郑浩张建武袁世山
- 关键词:乙型脑炎病毒E基因
- 欧洲型PRRSV弱毒株全长基因组cDNA克隆的构建与分析被引量:3
- 2008年
- 为了获得欧洲型PRRSV弱毒疫苗株AMERVAC-PRRS/A3全基因组序列和病毒基因组全长cDNA克隆,通过RT-PCR技术扩增了AMERVAC-PRRS/A3弱毒株的全基因组,并对基因组cDNA序列进行了测定。根据测序结果,选择合适的酶切位点将各个亚克隆产物逐段克隆入改造过的pBluescriptⅡKS(+)载体中,从而获得了病毒的全长基因组cDNA克隆。测序结果表明,该弱毒株基因组序列全长为15 098 bp(不包括poly(A)尾)。同源性比较结果显示,Ningbo42株ORF7基因(EF473137)、FJ0603株Nsp2基因(EF592535)与该弱毒株的相应基因之间的同源性分别为100%和98%。这些数据暗示,国内欧洲型PRRSV Ningbo42株和FJ0603株的存在与欧洲型PRRSV弱毒疫苗株AMERVAC-PRRS/A3密切相关。测序及酶切鉴定结果表明,欧洲型PRRSV全长基因组cDNA克隆已构建成功。
- 庄金山袁世山张建武
- 2007年中国部分地区猪圆环病毒2型分子流行病学分析被引量:21
- 2009年
- 【目的】对采集自上海、江西、山东、江苏、河南和湖南等省的257份进行了PCV2的检测,确定中国PCV2感染情况及分子特征。【目的】设计一对针对PCV2ORF2的引物,利用PCR对其进行PCV2基因组的检测,对PCV2阳性的样品,进行了ORF2的克隆、序列测定和分析。【结果】结果显示PCV2阳性率为24.51%(63/257),并能从健康猪群中检测的阳性;各PCV2分离株间ORF2核苷酸序列同源性为84.4%~100%,氨基酸同源性为82.5%~100%,与所属群的不同而不同。【结论】中国有2个群的PCV2毒株在流行,以PCV2b群为主(70.97%,22/31),但也有PCV2a群毒株(29.03%,9/31)的流行,同时PCV2流行的基因型没有明显的地域间差异。部分毒株符合高致病性PCV2的特征,暗示中国已存在高致病性PCV2的流行。
- 张建武庄金山刘长龙王小敏袁世山
- 关键词:猪圆环病毒2型基因型
- 犬猫3种冠状病毒基因克隆的构建与芯片检测技术被引量:6
- 2008年
- 蔗糖密度梯度离心纯化浓缩犬冠状病毒(CCV)、猫冠状病毒(FCV)和猫传染性腹膜炎病毒(FIPV)的细胞培养物,分别设计7、17、11对引物,对病毒RNA进行反转录和PCR扩增,回收PCR产物连接pGEM-T载体并转化大肠杆菌TGI,构建35个基因片段的克隆。煮沸裂解法制备质粒DNA,回收PCR扩增产物,点制冠状病毒基因芯片。抽提病毒总RNA,利用Cy3-dCTP随机渗入反转录PCR标记,与芯片进行杂交检测,淘汰交叉的克隆片段,每种病毒只选择其4对引物克隆的基因片段。将特异克隆扩增片段重新点制基因芯片,与病毒样品PCR扩增产物杂交,未发现交叉现象。基因芯片检测比传统PCR敏感1000倍,可有效应用于3种病毒的检测与区分。
- 李健熊炜陈沁王权王巧全张建武胡永强李树清
- 关键词:冠状病毒克隆基因芯片杂交
- 猪源牛病毒性腹泻病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立被引量:12
- 2011年
- 本研究旨在建立一种荧光定量PCR检测方法,用于猪源牛病毒性腹泻病毒(BVDVs)检测,同时能鉴别诊断猪瘟病毒(CSFV)。根据BVDVs与CSFV 5′-UTR保守序列,设计一套引物和特异TaqMan探针,以本实验室构建的猪源BVDVs 5′-UTR阳性重组质粒为标准品,通过优化反应条件,建立了标准曲线。以构建的标准品为模板进行了特异性、敏感性、重复性试验、并应用于临床检测。结果显示,该方法检测CSFV、猪繁殖与呼吸综合征病毒均为阴性;最低可检测到每个反应相当于10拷贝的标准品DNA;重复性试验的批内变异系数为0.20%~0.95%;应用所建立方法对临床样品进行检测,其结果与普通RT-PCR结果的符合率为86.7%。本研究建立的实时荧光定量PCR具有特异、敏感、快速、重复性好等优点,可用于猪感染BVDVs、猪瘟疫苗污染BVDVs的监测。
- 邓宇张荣丛雁方张建武袁世山文心田郑浩
- 关键词:猪源牛病毒性腹泻病毒实时荧光定量RT-PCRTAQMAN探针
- 猪繁殖与呼吸综合征病毒嵌合感染性克隆的构建和应用被引量:5
- 2008年
- 高致病性猪蓝耳病近年来在我国广泛流行,目前尚无高效疫苗用于该病的防制。本研究以PRRSV弱毒感染性克隆-pAPRRS作为主要骨架,将高致病性猪蓝耳病病毒江西分离株(JX143)的主要结构蛋白基因(ORF4-7)以及3′UTR区域替换入pAPPRS相应编码区域,构建了pSX12(ORF4-7-3′UTR)、p5NX12(ORF5-7-3′UTR)以及p56N12(ORF5-6)三个PRRSV全长嵌合克隆。经DNA转染Marc-145细胞后拯救出嵌合病毒,并对拯救病毒进行了病毒生物学特性的分析;选取拯救病毒v56N12(ORF5-6)和vSX12(ORF4-7-3′UTR)免疫29日龄猪进行免疫原性试验,结果表明,以v56N12免疫后抗体水平相对较低,故免疫原性相对较差;而vSX12病毒免疫后14d血清ELISA抗体达到阳性值(IDEXXELISA值s/p≥0.4),免疫后28d中和抗体效价从原来的1:5以下上升到1:15以上,说明vSX12具有良好的免疫原性并可进行免疫监测;免疫后28d以强毒JX143株攻毒,结果vSX12免疫组未见发病,而未免疫攻毒对照组全部发病并有1头死亡,vSX12免疫猪攻毒后病毒血症持续6d后消失,而对照组攻毒后至少持续13d,说明vSX12可对高致病性猪蓝耳病提供有效的免疫保护。本研究构建的三个嵌合病毒为开发同时抗经典和变异株PRRSV感染的二价疫苗,以及探寻高致病性猪蓝耳病病毒的毒力因子奠定了基础。
- 李祥健张建武吕健余丹丹姚火春袁世山
- 关键词:猪繁殖与呼吸障碍综合征高致病性猪蓝耳病感染性克隆嵌合病毒候选疫苗
- 猫冠状病毒和猫传染性腹膜炎病毒RT-PCR检测方法的建立被引量:12
- 2006年
- 本文利用A-72细胞繁殖猫冠状病毒(FCV)和猫传染性腹膜炎病毒(FIPV),用蔗糖密度梯度离心纯化,根据病毒S基因序列设计引物,初步建立了检测FCV和FIPV的RT-PCR方法。采用此方法对人工攻毒猫组织进行检测,结果特异灵敏。
- 李健陈沁王权张建武胡永强
- 我国猪场PCV2a和PCV2b共感染情况的调查与分析
- 近年来我国猪场中猪圆环病毒2型的阳性率有所增加,给我国的养猪业带来了巨大的挑战.本研究主要是为了调查和分析我国猪2型圆环病毒两型间的共感染情况.我们采用差异PCR方法对2008年到2009年间采集的经普通PCR鉴定为PC...
- 翟少伦龙进学韦祖樟张建武岳城禤雄标袁世山
- 关键词:共感染同源重组
- 文献传递
- 中国部分地区高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒的分子流行病学研究被引量:41
- 2008年
- 【目的】对来自2006年猪病流行爆发地的组织样品进行多种病毒的检测,确定引起本次流行的致病病原及PRRSV的分子流行病学特征。【方法】利用(RT-)PCR对采集的样品进行PRRSV北美型和欧洲型、猪圆环病毒2型(PCV2)、猪血凝性脑脊髓炎病毒(PHEV)、日本乙型脑炎病毒(JEV)以及瘟病毒的检测,对PRRSV阳性的进行ORF5的序列测定并分析。【结果】检测到16份PRRSV北美型阳性样品,PCV2阳性样品2份,其它病毒均未检到。PRRSV ORF5序列分析表明笔者分离到的PRRSV株可分为2个群。【结论】(1)PRRSV与2006年肆虐中国养猪业的猪病流行有直接关系;(2)2006年PRRSV流行株主要是以JX0612株为代表,但不同遗传特征的PRRSV也在流行。
- 张建武庄金山袁世山
- 关键词:高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF5分子流行病学调查遗传进化分析