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基于面心立方体格点模型的蛋白质结构预测算法研究: 蛋白质是生命的物质基础,研究蛋白质的折叠机理并有效地预测其空间结构不仅对实验生物学起着重大的指导作用,在药品研发、疾病治疗等方面也有着广泛的应用价值。随着蛋白质工程技术的发展,测定氨基酸序列的速度己远远超过用理化实验方法...; 宋蓓蓓; 关键词：蛋白质结构预测; 文献传递

一种在格点模型上模拟蛋白质折叠结构的优化算法: 2014年; 蛋白质折叠问题是生物信息学中一个经典的多项式复杂程度的非确定性(non-deterministic polynomial,NP)难度问题.势能曲面变平法(ELP)是一种启发式的全局优化算法.通过对ELP方法中的直方图函数提出一种新的更新机制,并将基于贪心策略的初始构象的产生,基于牵引移动的邻域搜索策略与ELP方法相结合,为面心立方体(FCC)格点模型的蛋白质折叠问题提出一种改进的势能曲面变平(ELP+)算法.采用文献中9条常用序列作为测试集.对于每条序列,ELP+算法均能找到与文献中的算法所得到的最低能量相等或更低的能量.实验结果表明,ELP+算法是求解FCC格点模型的蛋白质折叠问题的一种有效算法.; 刘景发宋蓓蓓刘朝霞孙媛媛黄维波

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宋蓓蓓