冯维
- 作品数:4 被引量:18H指数:2
- 供职机构:上海海洋大学更多>>
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- 相关领域:农业科学更多>>
- 鲢长江群体与国外移居群体间遗传变异的主要组织相容性复合体分析被引量:2
- 2012年
- 利用MHCⅠ类α2结构域基因片段,分析鲢长江群体(YZL)与多瑙河群体(DAN)、密西西比河群体(MIS)间的遗传变异。从3群体共40尾个体的117个有效克隆中,获得MHCⅠ类α2结构域等位基因68个。主要结果为:(1)YZL、DAN和MIS群体的等位基因数分别为21、27和20个,且群体间核苷酸序列(54.1%~99.5%)、氨基酸序列(39.4%~98.6%)的同源性变异范围大,揭示3群体MHCⅠ类α2结构域的多态性都较丰富。(2)群体内平均核苷酸/氨基酸序列同源性的大小顺序为MIS>DAN>YZL;而群体内核苷酸/氨基酸多样性指数(π/πaa)的大小顺序恰与此相反,表明鲢YZL群体MHCⅠ类α2结构域的变异较DAN和MIS群体大。(3)以氨基酸序列进行AMOVA分析的结果表明,3群体间、国内群体与国外移居群体间都存在显著的遗传分化(P<0.05)。(4)3群体抗原结合区(PBR)的非同义碱基/同义碱基替换值ω的大小顺序为YZL(1.652 5)>MIS(1.499 5)>DAN(1.337 0)>1,且在PBR区检测到5个正向选择位点,揭示3群体鲢MHCⅠ类分子均受到正向选择压力的作用,其中YZL群体的选择压力最大。
- 冯维刘至治李思发李雪松唐文乔杨金权
- 关键词:主要组织相容性复合体
- 大弹涂鱼微卫星引物的开发
- 应用5'-锚定PCR技术直接从大弹涂鱼基因组DNA中扩增SSR序列.采用PCR法快速筛选阳性克隆,随机挑取134个克隆进行测序,发现均含有微卫星序列,阳性克隆的得率达到了100%.设计出39对大弹涂鱼微卫星引物,...
- 刘至治马晓茜冯维陆桑倪
- 关键词:大弹涂鱼微卫星引物
- 鲢中国本土群体和欧美移居群体遗传变异的主要组织相容性复合体(MHC)分析
- 1.鲢国内本土群体与国外移居群体间遗传变异的MHC I类α2结构域的克隆与序列分析
利用MHC I类α2结构域基因片段,分析鲢国内本土群体(长江群体与黑龙江群体,分别简称为YZL和AMU群体)与国外移居群体(匈牙...
- 冯维
- 关键词:主要组织相容性复合体选育群体
- 文献传递
- “全红”体色瓯江彩鲤MHC-DAB基因多态性及其与鱼体抗病力关系的分析被引量:17
- 2011年
- 利用一对特异性引物DABF和DABR,分别从21尾感病和16尾抗病"全红"体色瓯江彩鲤的cDNA中,扩增出长度为624 bp的MHC-DAB基因片段。共测序185个有效克隆,获得76个不同的核苷酸序列。MHC-DAB基因片段包括第1~4外显子,分别编码信号肽、β1和β2结构域及跨膜区。长度为276 bp的β1结构域有144个核苷酸变异位点(52.17%)和70个氨基酸变异位点(76.07%),而长度为282 bp的β2结构域只有98个核苷酸变异位点(34.75%)和50个氨基酸变异位点(53.19%),显示β1结构域的变异要明显大于β2结构域。在β1结构域的24个抗原结合位点(PBR)上,有23个发生了变异。β1结构域的PBR、非抗原结合位点(non-PBR)及β2结构域的ω值(ω=dN/dS)分别为1.367、0.886和0.754,表明"全红"体色瓯江彩鲤MHC-DAB基因(特别是β1结构域)在进化过程中受到正向选择作用。在所得的20个不同的等位基因中,基因DAB3*15在抗病群体中出现的频率(13.75%)显著高于感病群体中出现的频率(3.81%)(P<0.05);基因DAB3*09和DAB3*10的出现频率都为3.75%(P<0.05),仅存在于抗病群体中;而基因DAB3*02和DAB3*14的出现频率分别为7.62%(P<0.05)和8.57%(P<0.01),仅存在于感病群体中。
- 李雪松刘至治赵雪锦马晓茜冯维王成辉
- 关键词:瓯江彩鲤主要组织相容性复合体多态性