华南基因组研究中心
- 作品数：74 被引量：122H指数：5
- 相关作者：崔东更多>>
- 相关机构：南方医科大学上海大学暨南大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广东省医学科学技术研究基金广东省自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学自动化与计算机技术经济管理更多>>
- TOPO克隆构建SARS-CoV M蛋白基因裂殖酵母表达载体及其稳定性被引量：2
- 2007年
- 目的利用TOPO克隆法构建SARS-CoV M蛋白基因的裂殖酵母重组表达载体,并验证重组载体在宿主细胞中的稳定性。方法运用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术从SARS-CoV RNA中扩增出M蛋白基因,AT克隆构建出序列正确的pMD18-T-M重组载体。设计含Kozak序列的引物从pMD18-T-M载体上亚克隆出M蛋白基因,与裂殖酵母表达载体pNMT1-TOPO进行TOPO克隆,构建出重组表达载体pNMT1-M,转化TOP10感受态细胞,菌落PCR鉴定阳性转化子后进行测序鉴定。将序列正确的pNMT1-M重组载体电转化入裂殖酵母TCP1菌株中,在EMM培养基中诱导表达,连续传代100代,在EMM+T培养基中验证其稳定性。结果RT-PCR获得666 bp的片段,pMD18-T-M重组载体经测序验证序列正确;重组表达载体pNMT1-M经菌落PCR和测序鉴定均正确;重组裂殖酵母菌经诱导后,SDS-PAGE检测出了表达条带;重组表达载体连续传代后,未发现丢失现象。结论成功地构建出了SARS-CoV M蛋白基因的裂殖酵母表达载体,验证了其在裂殖酵母中能稳定地进行遗传,为下一步的表达优化、活性和功能研究垫定了基础。
- 赵林蔡金艳郑文岭马文丽
- 关键词：表达载体构建裂殖酵母
- SARS冠状病毒刺突蛋白在裂殖酵母中的表达被引量：1
- 2005年
- 根据SARS冠状病毒S蛋白主要抗原表位的分析,将S蛋白基因扩增成大小为800bp^1000bp的5个片段,分别与裂殖酵母载体pNMT1连接,经电穿孔转化TCP1菌株,得到诱导表达5个片段的裂殖酵母菌株。对诱导表达产物进行SDS-PAGE和Westernblot分析表明,S基因5个片段在裂殖酵母中分别得到不同程度的表达,为进一步研究新一代SARS疫苗提供了材料。
- 吴朝霞郑文岭张宝师永霞马文丽
- 关键词：SARS刺突蛋白裂殖酵母
- 乳腺癌转移相关通路的基因集富集分析被引量：1
- 2013年
- 目的探讨与乳腺癌转移相关的生物信号通路及因素。方法以乳腺癌转移相关的3组基因芯片表达谱数据为研究材料,登录号分别为GSE2034、GSE2603以及GSE12276。将乳腺癌样本分为原发癌和转移癌两组,原始数据经RMAExpress软件进行质量检验和标准化,采用GSEA通路富集工具对乳腺癌转移相关通路进行分析。结果有20条生物信号通路与乳腺癌的转移有着密切关系,其中基因集上调的有17个,下调的有3个,主要涉及细胞周期与增殖、代谢途径、血管生成、迁移、免疫系统等信号通路。结论乳腺癌转移除与肿瘤细胞的活力和增殖能力提高有关外,还与肿瘤细胞的迁移和运动能力进一步增强及机体免疫系统损害有关。
- 余海浪刘安玲周珏宇孟伟郑文岭马文丽
- 关键词：乳腺肿瘤通路
- 沉默SEMA3A基因对胶质瘤细胞U251增殖和转移的影响
- 2015年
- 探讨了SEMA3A基因在恶性胶质瘤细胞U251迁移和侵袭能力中的作用,及其用于胶质瘤临床治疗的可行性.用特异识别SEMA3A基因的短发卡RNA(short hairpin RNA,sh RNA)片段与真核表达载体p FH-GFP-L连接,再与辅助质粒联用来包装慢病毒.通过荧光显微镜观察感染胶质瘤细胞U251的感染效率.通过实时定量PCR技术和Western-blot技术验证了U251细胞中SEMA3A基因的沉默效果.通过MTT法、PI染色法和Transwell小室分别检测了U251细胞增殖、细胞周期和运动能力的变化.结果表明,SEMA3A-sh RNA慢病毒感染U251能有效下调SEMA3A基因的表达水平(P<0.01),使U251细胞的增殖能力、迁移和侵袭能力明显降低(P<0.05),细胞大量阻滞在G2/M期,并促进了细胞凋亡(P<0.05).
- 何志敏马文丽郑文岭
- 关键词：胶质瘤增殖
- 基于web的基因检测服务现状分析被引量：4
- 2010年
- 芯片技术把数以万计的寡核苷酸以点阵的方式排列在固体介质表面,实现了基因（组）的快速、高能量、敏感和高效率检测。基因检测在一定程度上可以预测疾病风险及个体特性,而将基因检测服务和无处不在的网络平台相结合,则真正实现了个人遗传信息（personal genetic information,PGI）快捷可读,实现了预防医学、IT科技和商业的完美结合。通过互联网进行基因检测服务销售与广告，将加快实现基因检测服务商业化进程和推动其快速发展。
- 李晓云高建郑文岭
- 关键词：基因检测介质表面寡核苷酸芯片技术网络平台
- 三种基因芯片杂交体系的实验比较
- 2009年
- 目的探讨基因芯片3种不同的杂交体系对杂交后得到的探针荧光信号强度的影响。方法提取人慢性髓系白血病K562细胞株的mRNA,经荧光标记后与K562表达谱芯片杂交,杂交分别在Corning"三明治"式芯片杂交盒、Agilent基因芯片杂交仪和Gene TAC基因芯片工作站进行,在同等条件下清洗和扫描杂交后的芯片,得到探针的荧光信号强度予以分析研究。结果不同芯片杂交体系下荧光信号强度的差异具有显著性,多重比较进一步发现差异最明显的存在于第一种杂交体系与其他两种之间。结论样品在流动体系中与芯片上探针杂交的效果要好于传统的"三明治"式杂交法。
- 丁大鹏马文丽张海燕梁爽郑文岭
- 关键词：基因芯片杂交
- 人乳头瘤病毒疫苗研究进展被引量：2
- 2008年
- 张进芳马文丽危敏郑文岭
- 关键词：人乳头瘤病毒疫苗高危型人乳头瘤病毒HPV感染HPV16感染妇科恶性肿瘤HUMAN
- HIV感染动力学模型概述被引量：2
- 2010年
- 自1981年美国首次发现艾滋病以来,艾滋病在世界范围内广泛传播,引起医学专家、生物学家、数学家和物理学家等的极大关注。近年来,HIV动力学模型成为HIV治疗领域的研究热点。HIV基本动力学模型的研究有助于实现对未来疾病发展状况的描述与预测,HIV感染控制模型的研究有助于改善HIV病毒患者的治疗方案,对控制模型的优化有利于发现对HIV患者的有效治疗策略。本文概述了几种基本的HIV感染动力学模型,分析比较了它们的性能差异和各自存在的优缺点,介绍了HIV控制模型及其优化控制模型的计算机Matlab/simulink模拟。
- 孙立哲马文丽孙汉顺高静宇郑文岭
- 关键词：HIV感染优化控制
- 靶向COL1A1基因的shRNA对人乳腺癌MDA-MB-231细胞增殖与凋亡的影响被引量：2
- 2012年
- 目的:探讨抑制Ⅰ型胶原α1链(COL1A1)基因表达对人乳腺癌MDA-MB-231细胞增殖及凋亡的影响。方法:用已构建的pSilencer2.1-U6-COL1A1重组质粒转染乳腺癌细胞MDA-MB-231,采用RT-PCR和Western blotting技术检测重组质粒对COL1A1基因表达的影响,MTT比色法测定细胞增殖的抑制情况,流式细胞术检测细胞周期和细胞凋亡的变化,Hoechst 33258荧光染色观察细胞凋亡的形态学变化。结果:RT-PCR及Western blotting结果证实重组质粒在mRNA和蛋白水平分别显著抑制COL1A1基因表达;pshRNA-COL1A1转染组细胞的增殖速度明显减慢且呈时间依赖关系;与对照组相比,pshRNA-COL1A1组细胞明显阻滞于G0/G1期,细胞凋亡率显著升高(P<0.05),出现细胞质浓缩、核凝聚等凋亡形态学变化。结论:pshRNA-COL1A1能有效抑制乳腺癌MDA-MB-231细胞增殖,并诱导其凋亡,为以COL1A1为靶点的乳腺癌基因治疗提供实验依据。
- 余海浪刘安玲周珏宇孟伟郑文岭马文丽
- 关键词：RNA干扰
- 乳腺癌组织PIGF表达及其临床意义的探讨被引量：1
- 2010年
- 目的:研究胎盘生长因子(PIGF)在乳腺癌组织中的表达及其临床意义。方法:分别采用实时荧光定量PCR(real-time quantitative,Q-PCR)和免疫组织化学方法检测56例乳腺癌组织和72例癌旁组织中PIGF的表达。结果:Q-PCR检测乳腺癌组织中PIGFmRNA的表达水平为0.987±0.171,相应癌旁组织中PIGFmRNA的表达量为0.265±0.114;免疫组化检测乳腺癌组织中PIGF蛋白阳性率为80.4%(45/56),相应癌组织中PIGF蛋白阳性率为12.5%(8/72);癌组织中PIGF的表达均显著高于癌旁组织(P<0.05)。PIGF的高表达与淋巴结转移及Nottingham预后指数有相关性(P<0.05),但与乳腺癌的病理类型、临床分期及ER状态无相关性。结论:PIGF在乳腺癌组织中高表达,且与乳腺癌的发生、发展及临床预后密切相关。PIGF很可能在乳腺癌的发病机制中起着重要的作用。
- 余海浪马文丽周珏宇郑文岭
- 关键词：胎盘生长因子实时定量PCR
