中国医学科学院北京协和医学院医药生物技术研究所卫生部抗生素基因工程重点实验室 作品数:42 被引量:119 H指数:6 相关作者: 李元 高群杰 张会图 齐小强 陈菲菲 更多>> 相关机构: 中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所合成生物学重点实验室 中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所 沈阳药科大学生命科学与生物制药学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家科技重大专项 国家高技术研究发展计划 更多>> 相关领域: 生物学 医药卫生 更多>>
异戊酰螺旋霉素生物合成基因簇的鉴定 必特螺旋霉素是4″酰化的螺旋霉素混合物,以4″-O-异戊酰螺旋霉素为主要成分,是将碳霉素产生菌(Streptomyces thermotolerans)中的异戊酰基转移酶基因(4″-O-isovaleryltransfe... 钟晶晶 张家瑚 赫卫清关键词:生物合成 调控基因 以Apo A-I为靶点的基因表达上调剂筛选模型的建立 被引量:3 2011年 目的建立靶向人ApoA-I转录调控序列的高通量药物筛选模型,用于筛选ApoA-I基因表达上调剂。方法以人基因组DNA为模板,PCR扩增ApoA-I上游的启动子序列,克隆至荧光素酶报告基因质粒pGL4.17上游,采用脂质体介导的方法将重组质粒转染人肝癌细胞HepG2,在G418抗性存在的条件下,通过有限稀释法筛选稳定转染细胞株。对溶剂浓度和药物作用时间进行条件优化,应用阳性化合物染料木素评价模型有效性,通过检测荧光素酶的表达活性变化来筛选人ApoA-I基因表达上调剂。结果通过PCR成功扩增了人ApoA-I基因上游的启动子序列,构建了相应的重组荧光素酶报告基因质粒pGL4-ApoP,并建立稳定转染细胞株ApoP-LucHepG2。对筛选条件优化后,应用阳性化合物进行评价,筛选窗相关系数Z’因子为0.68,大于0.5,适于进行高通量筛选。应用该筛选模型对5000余种化合物进行筛选,4个黄酮类化合物和白藜芦醇显示出较好的活性,半数有效浓度均小于10μg/ml。结论成功建立了人ApoA-I基因表达上调剂筛选模型,并利用该模型筛选到5个活性化合物。 杜郁 王丽 王丽非 司书毅 杨媛 洪斌关键词:载脂蛋白A-I 转录启动子 荧光素酶类 Advances of bacterial transferase Mra Y and its inhibitors 被引量:1 2015年 The phospho-mur NAc-pentapeptide translocase(Mra Y, translocase I) is a good target for the development of new antibiotics as it is ubiquitous and essential for bacterial growth. Furthermore, several inhibitors targeting towards this enzyme have been discovered. Recently, the crystal structure of Mra Y has been presented by Chung et al. Combination of the crystal structure and structure-activity relationship studies on these inhibitors could lead to the identification of active pharmacophores, and insight into their mechanisms of action. In this review, we described the structure and inhibitors of Mra Y. In addition, we also discussed the structure-activity relationship of these inhibitors and prospects of Mra Y as an antibacterial target. 金媛媛 刘娟娟 冯晓洲 李亚东 汪康游 孙婉 田喜凤 杨兆勇关键词:PEPTIDOGLYCAN 利用珍贵橙色束丝放线菌ATCC31565氨甲酰基化4,5-双氢-7-去氨甲酰基格尔德霉素 被引量:1 2011年 格尔德霉素(geldanamycin,GDM)和安丝菌素(ansamitocin,ASM)分别是由吸水链霉菌(如streptomyces hygroscopicus17997)和珍贵橙色束丝放线菌(如actinosynnema pretiosum ATCC31565)产生的具有抗肿瘤活性的安莎类抗生素. 刘昕 李书芬 牛沂菲 贾长虹 武临专 王以光关键词:格尔德霉素 放线菌 酰基化 甲酰基 吸水链霉菌 抗肿瘤活性 链霉菌隐性次级代谢产物生物合成基因簇的激活 被引量:2 2016年 链霉菌基因组中存在许多隐性次级代谢产物生物合成基因簇(cryptic secondary metabolite biosynthetic gene cluster,CSMG),在实验室条件下,它们多数处于沉默状态或者很低的表达水平。但在一定条件下这些CSMG可以被激活合成次级代谢产物,这为寻找新的活性天然产物提供新来源。本文总结了目前激活链霉菌CSMG所使用的方法,包括改变发酵条件、核糖体工程、共培养、异源表达、CSR(cluster-situated regulator)基因的遗传改造等。 钟晶晶 赫卫清关键词:链霉菌 高效液相色谱-串联质谱分析微量格尔德霉素类似物 被引量:1 2009年 安莎类抗生素例如利福霉素和安丝菌素,通常由一组化学结构相似的组分组成。格尔德霉素为苯安莎类抗生素,已经发现4个组分。本研究采用高效液相色谱-串联质谱方法对格尔德霉素(GDM)制品中的微量组分进行了分析,发现5个新的和1个已知的GDM类似物。依据质谱数据、结合GDM生物合成机制,对6个GDM类似物的化学结构进行了推测:分子式为C29H42N2O10的新化合物3个,分别为GDM安莎链上C2-C3、C4-C5和C8-C9之间的C-C双键变为单键并同时单羟基化的GDM衍生物;分子式为C28H38N2O8的新化合物2个,其中1个为17(或12,或4)-去甲氧基格尔德霉素,另1个为4,5-双氢-10,11-脱水-17-去甲基-17-羟基格尔德霉素;分子式为C29H42N2O9的已知化合物1个,为4,5-双氢格尔德霉素。这些GDM类似物的发现有助于加深对GDM生物合成的认识,并对通过基因阻断、组合生物合成技术获得GDM衍生物的研究有启示作用。 倪四阳 张侃 王玉成 赫卫清 王以光 贺玖明 武临专关键词:高效液相色谱-串联质谱 格尔德霉素 生物合成 麦迪霉素3-O-酰基转移酶在螺旋霉素链霉菌F21中的酰化特性 2008年 螺旋霉素(SP)与麦迪霉素(MD)均为16元大环内酯类抗生素,并且结构非常相似。螺旋霉素含有3个组分,其结构差异表现在16元内酯环C3上的一个取代基的差异,SPI组分为羟基、SPII组分羟基乙酰化、SPIII组分羟基丙酰化;麦迪霉素是以麦迪霉素A1为主要组分的多组分抗生素,麦迪霉素16元内酯环C3上连接的均为丙酰化羟基。已知这类抗生素16元内酯环C3羟基酰化是由一种称为3-O-酰基转移酶的蛋白催化完成。本研究将螺旋霉素产生菌—Streptomyces spiramyceticus F21中的螺旋霉素3-O-酰基转移酶基因用Streptomyces mycarofaciens ATCC 21454中的麦迪霉素3-O-酰基转移酶基因原位替换后,发现所产生的螺旋霉素仍然含有3个组分,并且螺旋霉素III组分也不是主要组分,说明麦迪霉素3-O-酰基转移酶在螺旋霉素产生菌—S.spiramyceticus F21中不具有16元内酯环C3羟基丙酰化特异性以及酰化高效性,也提示其在麦迪霉素产生菌中的丙酰化特异性和高效性可能与该菌株(种)的特性有关。 马春燕 武临专 戴剑漉 周红霞 李京艳 孙晓春 张侃 夏焕章 王以光关键词:螺旋霉素 麦迪霉素 酰化 基于微生物基因组的新型天然产物发现策略 被引量:7 2012年 微生物天然产物的生物合成是一个从基因到化合物的过程。微生物基因组内未被发掘的孤儿或沉默途径所编码的新型次级代谢产物的合成潜力远远超过现已发现的代谢产物数量。微生物基因组大规模测序的广泛开展,为天然产物的发现和研究提供了新的研究领域和契机。本文主要介绍基于微生物基因组序列的新型天然产物的发现策略及其研究进展。可以预计,随着实验技术的不断发展,采用基于基因的药物发现模式可以充分发掘微生物产生天然产物的潜力,微生物基因组内的孤儿或沉默途径编码的未知代谢产物将成为新药开发的重要源泉。 何庆 李青连 王丽非 洪斌新一代必特螺旋霉素基因工程菌的微波诱变 被引量:13 2009年 本文探讨微波诱变对新一代必特螺旋霉素基因工程菌的育种效果。以经紫外诱变筛选的新一代必特螺旋霉素产生菌Streptomyces spiramyceticusNBT-U149为出发菌株进行微波诱变筛选。辐射分四种方式:培养皿加盖冷却;加盖不冷却;不加盖冷却;不加盖不冷却,辐射时间分别为10、20、30、40、50、60、80、100和120 s。每次辐射5 s后,冰上快速冷却20 s再照射,并将照射时间累计。以不同的辐射时间设定为不同的微波处理剂量,计算致死率。结果表明,必特菌株对微波敏感,微波辐射60 s时致死率达到92.55%。微波诱变在以脉冲频率为2450MHz的800W家用微波炉条件下,其最佳作用方式为培养皿不加盖、冰上快速冷却,最佳辐射时间为50 s。初筛摇瓶正突变率达到57.14%,复筛摇瓶发酵效价是出发菌株1.6倍以上的有10株,占初筛菌株的2%。最终筛选得到突变株Streptomyces spiramyceticusNBT-UM22,其必特螺旋霉素发酵产量是出发菌株的1.87倍,且组分比例无明显变化。 戴剑漉 李瑞芬 武临专 王以光关键词:必特螺旋霉素 微波 诱变育种 大鼠α-酰胺化酶在大肠杆菌中的表达、纯化及活性研究 被引量:1 2007年 α-酰胺化是神经和内分泌系统中许多生物活性肽重要的翻译后加工过程,C末端α酰胺基团的存在对于许多生物活性肽的生物活性极为重要。通过PCR扩增获得了编码大鼠α-酰胺化酶的基因,以pET-30a为载体,重组质粒pET-A转化至E.coli BL21成功表达了α-酰胺化酶。采用Ni2+-NTA亲和层析纯化重组蛋白,纯度为86%。该蛋白具有催化三肽底物((Dns-Tyr-Val-Gly)成为酰胺化二肽(Dns-Tyr-Val-NH2)的酶活性,这表明重组蛋白是α-酰胺化酶,有可能用于生物活性肽的酰胺化研究。 郭连宏 齐小强 姜蓉 姚晨 李元关键词:克隆表达 酰胺化 生物活性肽