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不同沉淀方法对外源表达凝乳酶活性的影响被引量：1: 2015年; 从粗提重组凝乳酶的得率、保存活性2个方面比较了乙醇沉淀法和硫酸铵沉淀法的差别。结果表明,相对于硫酸铵沉淀法,乙醇沉淀法获得蛋白的量相差不是很大,但是乙醇沉淀法所获得蛋白的单位效价是硫酸铵沉淀法的1.27倍,且乙醇沉淀法所得产物的比活性提高了16.78%。综合考虑重组凝乳酶的得率与活性,用乙醇沉淀的效果较好。; 邓培渊郭红玲袁伟李玉华; 关键词：活性硫酸铵盐析

防腐剂苯甲酸与人血清白蛋白相互作用被引量：5: 2021年; 为研究食品防腐剂苯甲酸在人体内的转运和降解机制,在人体血液的生理条件下运用荧光光谱法和分子对接、分子动力学模拟和丙氨酸突变扫描等方法研究了苯甲酸与人血清白蛋白(Human Serum Albumin,HSA)相互作用机理。结果表明:苯甲酸和HSA的结合为静态猝灭过程,不同条件下结合常数KA均大于1.0×10^(4 )L/mol,结合位点数约为1,结合位点为Site II;根据Van′t Hoff方程和分子动力学模拟发现两者结合主要促进作用力是静电作用力,抑制力是极性溶剂化能,且是自由能降低的自发反应;分子对接结果显示复合物中苯甲酸与ARG186形成1个氢键,丙氨酸突变扫描计算显示ASP108、GLN425和GLV459是结合的关键氨基酸。; 邓培渊袁伟李长看陈龙欣杨莹莹; 关键词：苯甲酸人血清白蛋白荧光猝灭分子对接

地黄梓醇和乙酰胆碱酯酶作用的分子动力学模拟被引量：3: 2021年; 梓醇能有效的的改善阿茨海默尔症状,但与乙酰胆碱酯酶(Acetylcholinesterase,AchE)作用的分子机制尚不明晰.本文运用分子动力学模拟、结合自由能的计算和丙氨酸突变扫描的方法研究了两者的结合模式,结果表明:梓醇结合位点为乙酰胆碱酯酶的催化活性中心,并形成3个氢键,结合自由能为-60.59 k J/mol,结合的主要驱动力是范德华力和静电作用力,主要抑制力是极性溶剂化能,Tyr151和Gln176是两者结合的关键氨基酸.这些研究为开发高效的Ach E梓醇类似物抑制剂提供理论支持.; 邓培渊袁伟李长看徐欢欢; 关键词：乙酰胆碱酯酶梓醇分子动力学

小菜蛾性信息素结合蛋白与顺-9-十四碳烯酸酯作用的分子模拟被引量：2: 2018年; 【目的】研究小菜蛾性信息结合蛋白(PxylPBP2)与顺-9-十四碳烯酸酯(Z9-14∶Ac)结合的分子动力学模式、结合内驱力及关键作用氨基酸,阐明二者识别的分子机制,为小菜蛾性诱剂的研发和小菜蛾防治提供参考依据。【方法】运用YASARA对PxylPBP2进行同源建模,运用AutoDock 4.2进行PxylPBP2与Z9-14∶Ac的空间结构对接,运用YASARA平台进行分子动力学模拟,运用MMPBSA.py模块计算PxylPBP2-Z9-14∶Ac复合物的结合自由能,以Amber12软件包描述结合关键氨基酸,分析PxylPBP2与Z9-14∶Ac的结合模式及相互作用力。【结果】同源建模构建了合理的PxylPBP2空间模型,分子对接结果表明Z9-14∶Ac结合于PxylPBP2结合腔的内部,受体配体间无氢键,1.4 ns时对接复合物收敛平衡;PxylPBP2-Z9-14∶Ac结合自由能为-9.76 kcal/mol;Phe22和Ile104的贡献能量和占总结合自由能的43%。【结论】范德瓦斯力和非极性溶剂力是PxylPBP2与Z9-14∶Ac形成稳定复合物的主要内驱力,能量贡献最大的两个关键氨基酸(Phe22和Ile104)位于侧链上。; 赵奇邓培渊李玉华杨玉珍杨宗渠雷志华; 关键词：小菜蛾性信息素分子动力学模拟

甜菜夜蛾化学感受蛋白SexiCSP3结合特性分析被引量：2: 2015年; 本研究构建夜蛾科昆虫化学感受蛋白系统进化树,发现化学感受蛋白在种间保守性强,并与气味结合蛋白明显分为两类。运用反转录RT-PCR方法克隆了Sexi CSP3基因,并在大肠杆菌中正确表达,重组Sexi CSP3蛋白纯化后通过荧光竞争结合实验测定其与24种外源气味分子的结合特性。结果表明:Sexi CSP3与苯甲醛、苯乙酮、2-戊基-3-苯丙基-烯醛、1-苯基-1-丁酮、对甲氧基苯甲醛的结合能力较强,解离常数为0.76、1.39、2.23、3.23和5.30μmol/L,推测Sexi CSP3可能参与了甜菜夜蛾对这5种化学物质的识别过程。; 邓培渊袁伟李玉华王林青李长看; 关键词：甜菜夜蛾化学感受蛋白解离常数

河南省电网涉鸟故障发生的规律、类型、特征及防治对策研究被引量：14: 2015年; 2013年1月至2014年9月,采用样线法和样点法对河南省域高压输电线路涉鸟故障进行调查,并对2003到2013年间该地区涉鸟故障相关信息进行统计分析.结果显示,该地区发生的涉鸟故障跳闸事故64次.涉鸟故障发生的地理环境特征为豫中西部53次,占82.8%,且与候鸟迁徙通道相重叠.涉鸟故障的季节性规律为冬春季节是鸟害的高发期,与冬候鸟迁徙活动周期相同,发生在10月至次年3月,6个月间共计48次,占涉鸟故障总数的75%.涉鸟故障的日节律表明晚间为高发期,晚19:00至次日7:00时段发生鸟害跳闸50次,占78.13%;其中6:00至7:00时段发生17次,占26.56%.对涉害鸟类生物学习性进行分析,依据鸟害的原因及特点,将涉鸟故障划分为鸟粪闪络、鸟巢短路、鸟体短接、叨啄复合绝缘子4种类型.建议将目前普遍采取的以"堵"为主的隔离型、驱逐型措施,改进为以引导型为主,隔离型、驱逐型相辅,"堵"、"疏"相结合的综合措施.; 李长看胡扬宇庞锴杨宗渠邓培渊; 关键词：高压输电线路生物学习性

吲哚胺2,3-双加氧化酶Ⅰ与抑制剂INCB024360作用的分子动力学研究: 2019年; INCB024360是进入临床试验的吲哚胺2,3-双加氧化酶Ⅰ(IDO1)抑制剂之一,但其结合机理尚不明晰。本文运用分子对接、分子动力学、自由能计算和丙氨酸突变扫描方法研究了IDO1和INCB024360的结合模式。结果表明,IDO1和INCB024360的复合物形成了6个氢键,结合自由能为-70. 82 k J/mol,静电作用力是主要驱动力,极性溶剂化能是主要抑制力;丙氨酸突变扫描发现,Ser263和Glu171是两者结合的关键氨基酸,ΔΔGbind值分别为15. 35和54. 39 k J/mol。本文的结果可为阐明IDO1和INCB02436结合的分子机制提供重要依据。; 邓培渊孔庆寒袁伟李长看; 关键词：分子对接分子动力学

家蚕性信息素结合蛋白与蚕蛾醛作用的分子模拟研究: 2018年; 为明确家蚕性信息素结合蛋白(pheromone binding protein,PBP)和蚕蛾醛作用的分子机制,运用分子对接、分子动力学、结合自由能的计算和能量分解等分子模拟方法分析二者结合的模式和关键氨基酸。结果表明蚕蛾醛与PBP的Trp59位点形成1个H键,结合自由能为-53. 87 k J/mol,范德华力和非极性溶剂化能是主要驱动力,极性溶剂化能是主要抑制力,能量分解发现Leu30、Phe34、Ala95、Leu112和Phe130是二者结合的关键氨基酸残基。这些结果为阐明家蚕性信息素蚕蛾醛在家蚕识别性信息素过程中的作用机制提供了参考。; 邓培渊袁伟李玉华王广军李长看; 关键词：信息素结合蛋白分子对接分子动力学

人血清白蛋白与氯氰菊酯相互作用的分子模拟研究被引量：2: 2018年; 运用分子对接、分子动力学、结合自由能计算和丙氨酸扫描等分子模拟方法,研究了人血清白蛋白（human serum albumin,HSA）与氯氰菊酯的结合模式。结果表明：氯氰菊酯与HSA结合形成了稳定的复合物,与其氨基酸残基Arg209形成1个氢键,结合自由能为–83.43 kJ/mol,其中范德华力是结合的主要驱动力,极性溶剂化能是主要抑制力。丙氨酸突变扫描结果显示,氨基酸残基Lys199的ΔΔG_（bind）值为16.78 kJ/mol,是HSA和氯氰菊酯结合的关键氨基酸。该研究结果为阐明氯氰菊酯在人体内的代谢机制提供了理论参考。; 邓培渊王辉袁洪哲王广军李长看; 关键词：人血清白蛋白氯氰菊酯

生物科学专业分子生物学实验改革探索被引量：3: 2015年; 针对生物科学专业学生的知识结构和特点,从学校和学院的制度、教师和学生的素质两个方面讨论了分子生物学实验教学存在的问题,分析了原因,提出了改进措施,探索适合生物科学专业学生的分子生物学实验教学方式方法,以期改善实验教学效果。; 邓培渊袁伟郭红玲李玉华刘会丽; 关键词：分子生物学实验教学生物科学

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郑州师范学院郑州市生物物种资源研究重点实验室

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