重庆市科技计划项目(6455)
- 作品数：3 被引量：15H指数：2
- 相关作者：陈大霞李泉森李隆云钟国跃更多>>
- 相关机构：重庆市中药研究院更多>>
- 发文基金：重庆市科技计划项目国家科技攻关计划更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 不同产地仙茅遗传多样性的ISSR分析被引量：8
- 2012年
- 目的从DNA水平上对仙茅种质资源进行遗传多样性分析。方法对我国25个主要分布区的仙茅进行ISSR-PCR扩增与检测。扩增结果转化为"0"、"1"矩阵后,利用Treeconw软件计算遗传距离,并采用UPGMA聚类法构建亲缘关系树状图。结果 14条引物共得到176条清晰可辨的扩增条带,其中有151条呈现多态性,占85.8%。遗传距离变化范围在0.177 2～0.403 0。25份样品分为两大类,聚类较为复杂,大多种质不具明显地理相关性,仅在小分支中呈现出一定的地域性分布规律。结论我国仙茅植物的遗传多样性十分丰富,为筛选优质种质资源提供了丰富的遗传基础。
- 李隆云陈大霞钟国跃李泉森
- 关键词：仙茅ISSR种质资源多态性
- 仙茅随机扩增多态性DNA反应体系的优化被引量：2
- 2011年
- 目的:对仙茅随机扩增多态性DNA(RAPD)反应体系进行优化筛选。方法:以仙茅基因组DNA为模板,通过单因子试验就RAPD反应体系中主要参数(Mg2+、dNTP、引物、模板、TaqDNA聚合酶)对扩增结果的影响进行研究,并找出各自的最适条件。结果:建立了适合仙茅RAPD分析的反应体系,即25μL反应体系中各组分的最适浓度分别为:1×PCRbuffer、2.0mmol·L-1Mg2+、200μmol·L-1dNTP、40ng引物、20ng模板、1IUTaqDNA聚合酶。结论:利用此优化反应体系对仙茅进行RAPD-PCR扩增,可得到清晰的图谱,证实了该体系稳定、可靠。
- 李隆云陈大霞李泉森
- 关键词：仙茅随机扩增多态性DNA技术
- 我国仙茅属植物遗传关系的RAPD分析被引量：9
- 2011年
- 目的从分子水平研究我国仙茅属(Curculigo Gaertn.)植物的遗传关系。方法对我国仙茅属植物7个国产种30个单株进行RAPD分析。运用Popgene Version1.31软件计算相关参数,采用UPGMA聚类法进行聚类分析。结果 11个RAPD引物共扩增出157条带,其中有145条呈多态性。我国仙茅属植物的遗传多样性极为丰富,在物种水平上,多态位点百分率(PPB)为92.36%,平均每个位点的有效等位基因数(Ne)为1.493 7,Nei’s基因多样性指数(H)为0.300 1,Shannon’s多样性信息指数Hsp为0.457 7。在种内水平上,PPB=5.09%,Ne=1.036 6,H=0.020 4,种内Shannon’s多样性信息指数(Hpop)为0.029 8。Nei’s基因多样性指数计算的种间遗传分化系数(Gst=0.931 3)与Shannon’s分化系数(0.934 9)基本一致,均说明大部分遗传变异存在于种间。种间基因流(Nm)为0.036 9,说明种间基因流动较少,遗传分化程度较高。两种间的Nei’s遗传一致度(I)的范围为0.520 8～0.823 7。根据Nei’s遗传距离进行UPGMA聚类,基于RAPD分子标记的聚类结果与传统分类一致。结论我国仙茅属植物的遗传多样性十分丰富,且种间的遗传差异大于种内的遗传差异。
- 李隆云陈大霞钟国跃李泉森
- 关键词：随机扩增多态性DNA聚类分析
