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国家自然科学基金(31172389)

作品数:5 被引量:10H指数:2
相关作者:周志刚欧阳珑玲李慧王秀媛于水燕更多>>
相关机构:上海海洋大学上海辰山植物园更多>>
发文基金:国家自然科学基金上海市教育委员会创新基金国家高技术研究发展计划更多>>
相关领域:生物学农业科学更多>>

文献类型

  • 4篇期刊文章
  • 2篇会议论文

领域

  • 4篇生物学
  • 4篇农业科学

主题

  • 4篇缺刻缘绿藻
  • 4篇绿藻
  • 2篇衣藻
  • 2篇转录
  • 2篇莱茵衣藻
  • 1篇代谢网络
  • 1篇序列克隆
  • 1篇亚基
  • 1篇乙酰辅酶A羧...
  • 1篇脂质
  • 1篇碳酸酐酶
  • 1篇转录组
  • 1篇羧化
  • 1篇羧化酶
  • 1篇微藻
  • 1篇磷酸烯醇式丙...
  • 1篇克隆
  • 1篇基因
  • 1篇基因克隆
  • 1篇基因克隆与表...

机构

  • 5篇上海海洋大学
  • 1篇上海辰山植物...

作者

  • 5篇周志刚
  • 1篇于水燕
  • 1篇毕燕会
  • 1篇陈思弘
  • 1篇李慧
  • 1篇李燕
  • 1篇欧阳珑玲
  • 1篇王秀媛

传媒

  • 2篇水产学报
  • 1篇基因组学与应...
  • 1篇Journa...

年份

  • 1篇2018
  • 1篇2017
  • 1篇2015
  • 1篇2014
  • 2篇2011
5 条 记 录,以下是 1-6
排序方式:
编码缺刻缘绿藻乙酰辅酶A羧化酶BCCP亚基的基因克隆与表达分析
2014年
为了探讨在氮饥饿对缺刻缘绿藻花生四烯酸(ArA)合成与积累的影响,通过cDNA末端快速扩增(RACE)和设计简并引物进行反转录(RT)-PCR扩增,克隆了编码该藻异质型乙酰辅酶A羧化酶(ACCase)的2个生物素羧基载体蛋白(BCCP)的基因序列。其中MiBCCP1基因的cDNA序列长1 267 bp,包含的5'-非翻译区(UTR)长44 bp,3'-UTR长524 bp,开放阅读框(ORF)长699 bp,编码232个氨基酸并含有45个氨基酸序列的叶绿体定位信号肽;预测成熟蛋白分子量约为20 ku。MiBCCP2基因的ORF长789 bp,编码263个氨基酸并含有49个氨基酸的叶绿体定位信号肽,推测成熟蛋白分子量约为22 ku,但其羧基端缺乏生物素酰基化位点。邻接法(NJ)构建的聚类图显示它们分属于2个不同的分支(靴带值为100)。采用半定量反转录(RT)-PCR技术分析这2个基因的表达量,结果显示,在氮饥饿光照培养条件下,它们的相对转录量都先短暂升高然后持续下调,从而表明缺刻缘绿藻脂肪酸的从头合成能力有下降的趋势。结合该藻的ArA含量在该培养条件下明显增加的结果,推测胞质中同质型ACCase对缺刻缘绿藻ArA合成与积累起着更重要的作用。
李燕周志刚
关键词:缺刻缘绿藻乙酰辅酶A羧化酶
莱茵衣藻PEPC基因转化与表达分析被引量:2
2017年
为了获得表型稳定的工程藻株,实现基因工程改造策略加快微藻生物燃料产业发展的步伐,本研究应用同源重组的方法将内源性的磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶的编码基因转到莱茵衣藻细胞中,期望获得表型稳定的工程藻株。基于pHyg3质粒我们分别构建了ppc1和ppc2的重组载体,采用玻璃珠法转化莱茵衣藻CC400和CC406藻株,应用潮霉素抗性的固体培养基筛选得到转入目的片段的藻株。研究表明,转化的藻细胞中,目的片段可在基因组上稳定存在。同源片段长度在0.5~1 kb时,相对较长的片段不利于整合到基因组中。从转化藻株的基因组中能够扩增得到转入的片段,说明转入的目的片段以非同源重组的形式整合到基因组上。转化的藻细胞多次传代培养后,仍能检测到转入的外源片段。本研究进一步为微藻细胞的转基因工程和同源重组策略的研究提供了行之有效的方法。
王秀媛于水燕周志刚
关键词:微藻基因转化磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶
基于转录组高通量测序数据构建缺刻缘绿藻脂质代谢网络
缺刻缘绿藻(Myrmecia incisa)是迄今为止所知花生四烯酸(20:4ω6,AA)含量最高的微藻种类之一,尤其在氮饥饿胁迫条件下,其AA含量可达脂肪酸总量的45%、藻体干重的7%。利用ROCHE 454 GS F...
陈思弘周志刚
文献传递
缺刻缘绿藻碳酸酐酶(CA)基因的序列克隆及特征分析被引量:1
2015年
从缺刻缘绿藻的转录组数据库中搜索到5条编码该藻碳酸酐酶(carbonic anhydrase,CA)的contig序列,据此序列设计基因特异性引物,利用c DNA末端快速扩增(rapid amplification of c DNA ends,RACE)技术,克隆得到c DNA全长序列,分别命名为M iαCA1、M iαCA2、M iβCA1、M iβCA2和M iγCA,开放阅读框(ORF)长分别为963、1 089、1 041、738和687 bp,相应编码由320、362、346、245和228个氨基酸组成的蛋白。这些蛋白均富含疏水性氨基酸,分别占氨基酸总量的41.25%、45.31%、43.35%、42.45%和43.42%。基于缺刻缘绿藻和其他物种CA的蛋白序列所构建的Neighbor-Joining系统演化树显示,这些CA很明显地被聚类成α-、β-和γ-CA等3支。缺刻缘绿藻的2个α-CA都存在与Zn2+结合的3个His残基,2个β-CA也具有与Zn2+结合的2个Cys残基和1个His残基,但MiγCA中的Zn2+结合位点分别为Arg、His和Asn,不同于报道中的3个His。MiαCA1与莱茵衣藻的CAH3亲缘关系较近,因具有2个信号肽,它可能位于叶绿体的类囊体腔中并发挥作用。MiαCA2与莱茵衣藻的CAH1亲缘关系较近,因具有1个信号肽,可能在细胞的周质空间起着与CAH1类似的功能。M iβCA1和M iβCA2与莱茵衣藻的CAH7和CAH8亲缘关系更近,可能在细胞质中参与CO2和HCO-3之间的转化。MiγCA则与高等植物的γ-CA聚在一起,可能位于线粒体内发挥作用。由此推测,自缺刻缘绿藻所克隆的5个CA基因应在细胞的不同部位协同作用,通过参与CO2和HCO-3之间的转化以调节p H并实现CO2在细胞内转运的目的。
梅守华毕燕会周志刚
关键词:缺刻缘绿藻莱茵衣藻碳酸酐酶克隆CO2
缺刻缘绿藻FAD基因的序列特征及其相对转录量对氮饥饿的响应
缺刻缘绿藻(Myrmecia incisa)是迄今为止所知道的花生四烯酸(20:4ω6,AA)含量最高的藻类之一。基于脂肪酸成分推测,AA在缺刻缘绿藻中是自油酸(18:1,oleic acid)开始到亚油酸(18:2,l...
刘凡李慧李春阳欧阳珑玲周志刚
文献传递
Functional characterization of a Δ6 fatty acid desaturase gene and its 5′-upstream region cloned from the arachidonic acid-rich microalga Myrmecia incisa Reisigl(Chlorophyta)被引量:1
2018年
It is suggested that Δ6 fatty acid desaturase(FAD) plays a critical role in the biosynthesis of polyunsaturated fatty acids in plants and microalgae. But why does it adapt to the changed environments such as nitrogen starvation is seldom understood. One Δ6 FAD gene( MiD6 fad) from an arachidonic acidrich microalga M yrmecia incisa Reisigl(Chlorophyta) was first heterologously expressed in S accharomyces cerevisiae for the identification of function. The fatty acid profile of transgenic yeast detected by gas chromatography-mass spectrometry illustrated that the enzyme MiD6 FAD could convert linoleic and ?-linolenic acids to γ-linolenic and stearidonic acids, respectively, demonstrating that M iD6 fad encoded a Δ6 FAD. A 1 965-bp fragment of the cloned 2 347-bp 5′-upstream region of M iD6 fad was next subcloned and fused upstream with green fluorescent protein(GFP) gene to replace the GAL1 promoter of the vector pYES2. The generated construct was transformed into S. cerevisiae for function determination. Confocal microscopic images of the transformed line illustrated that this inserted fragment could drive GFP expression, which was further verified by fluorescence intensity quantification and Western blot analysis using antiGFP antibody. The conversion efficiency(approximately 2%-3%) of MiD6 FAD was much lower than the reported ? 3 FAD and Δ6 elongase in this microalga, suggesting that MiD6 FAD catalysed the possible ratelimiting step for ArA biosynthesis. The presence of several putative c is-acting regulatory elements in this identified promoter sheds new light on the regulation mechanism research of Δ6 FAD transcription for the ArA production in M. incisa in changing environmental factors.
张利曹海生宁璞周志刚
关键词:ACIDMICROALGA
共1页<1>
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