山东省自然科学基金(ZR2010CM042)
- 作品数：2 被引量：20H指数：2
- 相关作者：李静王超冯鸽许姗姗张璇更多>>
- 相关机构：中国海洋大学更多>>
- 发文基金：山东省自然科学基金青岛市医药科研指导计划山东省科技发展计划项目更多>>
- 相关领域：环境科学与工程医药卫生更多>>
- 红树林放线菌多样性及新型糖苷类化合物合成潜力发掘被引量：7
- 2013年
- 目的从红树林海泥中分离放线菌,探讨其多样性;并对分离菌株合成新型糖苷类化合物的代谢潜力进行评估和发掘。方法利用3种培养基进行菌株分离,对排重后菌株进行16SrDNA序列多样性分析;对分离菌株进行糖基转移酶基因筛选,对阳性菌株进一步进行合成潜力的评估及抗肿瘤活性的筛选。结果分离纯化得到148株红树林放线菌,分布于链霉菌属(Streptomyce)的54个种、原小单胞菌属(Promicromonospora)、糖多孢菌属(Saccharopolyspora)和诺卡氏菌属(Nocardia)。3株菌株有合成新型糖苷类次级代谢产物的潜力并均表现出较好的抗肿瘤活性。结论红树林土壤蕴含丰富的放线菌资源和合成活性次级代谢产物的潜力,是新药开发和天然活性产物的重要来源。
- 孙艺华冯鸽王超许姗姗李静
- 关键词：多样性糖基转移酶
- 黄河三角洲滨海湿地非培养放线菌多样性被引量：14
- 2013年
- 【目的】利用免培养技术对黄河三角洲滨海湿地土壤中放线菌多样性进行分析。【方法】提取样品总DNA,利用放线菌门特异引物扩增放线菌16S rRNA基因序列,构建放线菌16S rRNA基因克隆文库,文库经RFLP分析后挑选代表序列测序并进行多样性指数分析和系统发育分析。【结果】构建的放线菌16S rRNA基因克隆文库覆盖率(C)为96.3%,116个测序序列可化分为46个OTUs,58.7%的OTUs(27个)存在于放线菌亚纲(Actinobacteridae)放线菌目(Actinomycetales)的7个亚目中,分布于10个科中,其中弗兰克氏菌亚目(Frankineae)最多,共7个OTUs,有30.4%的OTUs(14个)存在于酸微菌亚纲(Acidimicrobidae)醋微菌亚目(Acidimicrobineae)中,没有发现与红色杆菌亚纲(Rubrobacteridae)和科里氏杆菌亚纲(Coriobacteridae)亲缘关系较近的序列。有10.9%的OTUs序列与有效发表的所有类群无亲缘关系,在进化树上成为一个独立的进化分支,有可能代表新亚目或更高级分类单元的类群。【结论】黄河三角洲滨海湿地蕴含着丰富的放线菌物种多样性及潜在的放线菌新类群,具有深一步研究的价值。
- 冯鸽许姗姗王超严立恩张璇李静
- 关键词：黄河三角洲湿地放线菌多样性
