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博士科研启动基金(XNBS1268)

作品数：2 被引量：1H指数：1
相关作者：张庆刚时术华张少龙陈建中更多>>
相关机构：山东师范大学山东建筑大学山东交通学院更多>>
发文基金：山东省自然科学基金博士科研启动基金国家自然科学基金更多>>
相关领域：生物学理学更多>>

文献类型

  • 2篇中文期刊文章

领域

  • 1篇生物学
  • 1篇理学

主题

  • 2篇动力学
  • 2篇动力学研究
  • 2篇分子
  • 2篇分子动力学
  • 2篇分子动力学研...
  • 1篇动力学模拟
  • 1篇抑制剂
  • 1篇制剂
  • 1篇物理化学
  • 1篇相关矩阵
  • 1篇分子动力学模...
  • 1篇PMI
  • 1篇APV
  • 1篇MDM2
  • 1篇MM-PBS...

机构

  • 2篇山东建筑大学
  • 2篇山东师范大学
  • 1篇山东交通学院

作者

  • 2篇张少龙
  • 2篇时术华
  • 2篇张庆刚
  • 1篇陈建中

传媒

  • 1篇原子与分子物...
  • 1篇山东建筑大学...

年份

  • 1篇2015
  • 1篇2013
共 2 条 记 录，以下是 1-2
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排序方式：
抑制剂PMI与MDM2结合模式的分子动力学研究
2013年
p53-MDM2相互作用已经成为治疗癌症药物设计的重要靶标。采用分子动力学模拟和MM-PBSA方法计算了肽类抑制剂PMI与MDM2的绝对结合自由能,通过基于残基的自由能分解方法计算了MDM2的各残基与PMI的相互作用。结果表明:CH-π、CH-CH和π-π相互作用驱动了PMI在MDM2疏水性裂缝中的结合;相关矩阵的计算表明PMI在一定程度上诱导了MDM2内部的相关运动。
时术华陈建中张庆刚张少龙
关键词：物理化学分子动力学模拟相关矩阵PMI
分子动力学研究抑制剂APV与HIV-1蛋白酶的作用机制被引量：1
2015年
采用分子动力学模拟和结合自由能计算研究了抑制剂APV与HIV-1蛋白酶的作用机制.研究结果表明范德瓦尔斯作用主控了APV与HIV-1蛋白酶的结合.采用基于残基的自由能分解方法计算了抑制剂-残基相互作用,结果表明9个残基Gly27、Ile32、Val47、Ile50、Ile84、Ala28'、Gly49'、Ile50'和Arg87'与APV产生了大于1.0 kcal/mol的强相互作用,而且证明CH-π,CH-O相互作用和极性作用是其结合的主要形式.期待该结果可以为以HIV-1蛋白酶为靶标的抗艾滋病药物设计提供理论上的指导.
时术华张少龙张庆刚
关键词：分子动力学MM-PBSA
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