国家大学生创新性实验计划项目(091069702)
- 作品数：4 被引量：21H指数：3
- 相关作者：颜永杰吴宽谢海峰高云芳李娜更多>>
- 相关机构：西北大学西北农林科技大学西藏民族大学更多>>
- 发文基金：国家大学生创新性实验计划项目西藏自治区科技厅重大科技专项基金陕西省教育厅科研计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学医药卫生更多>>
- 小麦蓝矮病植原体核糖体蛋白rpl22和rps3的生物信息学分析被引量：3
- 2010年
- 【目的】将生物信息学方法应用于小麦蓝矮病植原体(WBD)的分类研究,确定了小麦蓝矮病植原体的分类地位。【方法】应用植原体核糖体蛋白(rp)基因通用引物对rpF1/rpR1,对WBD进行PCR扩增并得到特异片段,对特异片段进行测定及同源性分析。【结果】序列测定结果表明,WBDrp基因片段长1 240 bp,包含部分rps19基因和全部的rpl22和rps3基因,且后2个基因为重叠基因,分别编码129和252个氨基酸,rpl22和rps3蛋白的等电点分别为12.605和11.755。【结论】WBD与16SrⅠ-C亚组中三叶草绿变病(Clover phyllody)的KVE、KVG、CPh株系亲缘关系最近,核苷酸同源性依次为99.7%,99.6%和99.0%,WBD与KVE株系的rpl22和rps3基因编码的氨基酸同源性分别为100%和98%,因此将小麦蓝矮病植原体划归到16SrⅠ-C亚组。
- 吴宽颜永杰李蓓武科科
- 关键词：小麦蓝矮病植原体生物信息学核糖体蛋白
- 药用植物麦瓶草研究概况被引量：6
- 2011年
- 在广泛文献检索基础上,对麦瓶草的异名、生物学特性、化学成分、鉴定、临床应用、食用、栽培与生物工程等方面进行了概述,为深入研究开发提供资料。
- 颜永杰谢海峰高昂巩江李娜陈烨丹路锋侯恩太倪士峰
- 西北旱区枣疯病植原体核糖体蛋白基因的生物信息学分析被引量：6
- 2010年
- 枣疯病是枣树上的一种具有毁灭性的植原体病害,几乎分布于国内所有的枣树栽培区,造成了巨大的经济损失。对我国陕西、宁夏、甘肃3省枣疯病样品植原体核糖体蛋白基因进行克隆和测序,获得枣疯病植原体的核糖体基因片段为1 196bp,包含部分rps19,rpl22和rps3三个基因,其中rpl22和rps3大小分别354bp和753bp,分别编码118和251个氨基酸,且这两个基因为非重叠基因。序列同源性比较结果表明:我国陕西、宁夏、甘肃的枣疯病植原体的核糖体蛋白rp基因大小一致,归属于植原体16SrⅤ-B组;该植原体核糖体蛋白基因特性与樱桃致死黄化(CLY5)和桃树黄化印度分离株系(PY-In)植原体相似。首次报道了我国枣疯病核糖体蛋白基因rp基因的序列,把枣疯病植原体归到16SrⅤ-B组,为枣疯病植原体提供了新的分类依据。
- 吴宽颜永杰王海妮张珏
- 关键词：核糖体蛋白基因生物信息学
- 陕西马铃薯卷叶病病原的分子生物学鉴定被引量：8
- 2010年
- 【目的】对陕西榆林疑似感染马铃薯卷叶病毒(Potato leafroll virus,PLRV)的病株毒源进行分子生物学鉴定,为陕西省马铃薯卷叶病的防治提供参考。【方法】根据GenBank数据库已报道的马铃薯卷叶病毒外壳蛋白(Coat protein,CP)基因序列设计了1对引物,利用RT-PCR技术成功扩增了陕西PLRV.CP基因,然后进行克隆、测序,并与GenBank中已报道的27个PLRV分离物的CP基因进行同源性分析。【结果】获得的陕西PLRV.CP基因大小为627 bp,含有1个ORF,编码208个氨基酸的多肽,其与已报道的27个国内外PLRV.CP高度同源。【结论】陕西榆林的疑似病株确定为感染PLRV的马铃薯病株。
- 颜永杰吴宽谢海峰高云芳
- 关键词：马铃薯卷叶病毒RT-PCR分子生物学鉴定
