国家自然科学基金(30660099)
- 作品数：5 被引量：30H指数：5
- 相关作者：刘齐元赵婷朱滕义范东东程元强更多>>
- 相关机构：江西农业大学湖南农业大学西南林学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家教育部博士点基金更多>>
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- 烟草线粒体基因coxⅡ的SNP检测及其与CMS的相关性分析被引量：13
- 2010年
- 对烟草胞质雄性不育性(CMS)的分子机理进行了研究。以7个CMS系及其相应的保持系为材料,利用特异引物PCR法扩增其线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅱ(coxⅡ),通过直接测序和比对,检测到coxⅡ中有3个核苷酸位点存在碱基变异,分别是:C-770G、G-772A和G-773C,其中第770位碱基的变化导致了相应位点编码氨基酸的改变,第772和773位碱基的变化共同导致了1个编码氨基酸的改变。对coxⅡ基因中第770位C→G的突变进行了240个烟草植株个体的PCR-RFLP检测及分析,结果表明,所有保持系单株的线粒体coxⅡ基因片段都可以被HapⅡ酶切,酶切后出现2种条带;而全部雄性不育系单株的线粒体coxⅡ基因片段由于第770位C→G的突变都不能被HapⅡ酶切,电泳图中仅有1条未被切开的条带。说明coxⅡ基因第770位的SNP位点与烟草CMS特性存在极显著的相关性。
- 朱腾义范东东赵婷刘齐元王建革朱肖文程元强
- 关键词：烟草CMS单核苷酸多态性
- 异常线粒体基因ORF25可能导致烟草雄性不育被引量：12
- 2009年
- 克隆和测定烟草胞质雄性不育系MS革新3号及其保持系革新3号线粒体基因ORF25的序列。结果表明:保持系的ORF25基因序列能推导出完整的氨基酸序列,应该具有正常的生物学功能;而雄性不育系的ORF25基因序列与保持系有较大差异,共有11个位点发生了变化,特别是在89位点发生的碱基C→A的变化及336位点发生的碱基T→A的变化,使得雄性雄性不育系在这2个位点出现终止密码子(TAA和TGA),导致不育系的ORF25基因不能推导出完整的氨基酸序列,使该基因不能产生完整的蛋白质多肽。因此,烟草雄性不育系的ORF25基因不能发挥其在保持系中所发挥的作用,这是否与烟草的雄性不育性有关还有待于进一步深入研究。
- 刘齐元朱滕义赵婷黄海泉
- 关键词：烟草胞质雄性不育
- 烟草atp6基因SNP的错配碱基法检测及其与CMS的相关性
- 以7个烟草雄性不育系MS云烟85、MS中烟90、MS K346、MS K326、MS G28、MS Nordel、MS净叶黄及其同型保持系云烟85、中烟90、K346、K326、G28、Nordel、净叶黄为材料，提取其...
- 刘齐元朱腾义程元强范东东
- 关键词：烟草CMS
- 烟草CMS相关基因orf25的生物信息学分析被引量：7
- 2011年
- 线粒体基因orf25异常可能导致烟草细胞质雄性不育(CMS)。为探讨orf25基因导致CMS的可能机理,本文采用生物信息学方法,分析烟草雄性不育系‘MS革新3号’及其保持系中的orf25基因在其编码蛋白各结构层次上存在的差异。结果显示,不育系中orf25基因因碱基改变提前出现终止子从而导致其编码蛋白缺失结构域,这极可能成为干扰线粒体F(0)F(1)-ATP合成酶功能的关键因素,从而成为导致烟草‘革新3号’CMS的根本原因之一。
- 周玮黄河周伯楠刘齐元
- 关键词：烟草生物信息学不育机理
- 雄性不育烟草atp6基因育性相关生物信息学分析被引量：6
- 2012年
- 线粒体基因atp6与多种植物细胞质雄性不育(CMS)关系密切。为探索atp6基因致烟草CMS的潜能,以2对烟草不育系和相应保持系为材料克隆atp6基因,测序结果显示不育系与保持系atp6基因间有6个碱基差异。进一步的生物信息学分析结果表明,6个碱基差异导致4个预测氨基酸残基差异及差异残基所处区域的亲/疏水性改变,不育系atp6基因预测蛋白在二级结构和结构域上均呈现出周期结构(主要为α-螺旋)增加而非周期结构(主要为无规卷曲)减少的趋势,不育系atp6基因的碱基差异能在一定程度上引起编码亚基空间结构类型发生改变。推测atp6编码亚基尤其是亚基结构域空间结构类型的改变可能干扰线粒体F0F1-ATP合成酶的功能,从而成为影响烟草育性的因素之一。
- 周玮刘齐元朱腾义范东东朱肖文程元强
- 关键词：烟草细胞质雄性不育育性生物信息学
- 烟草线粒体基因atp6的SNP及其与CMS的相关性被引量：17
- 2009年
- 为更好地在烟草育种中利用雄性不育,对烟草胞质雄性不育(CMS)的分子机理进行了研究。atp6基因是影响植物CMS的一个重要候选基因。本研究以7个烟草CMS系及其相应的保持系为材料,利用PCR特异引物扩增其线粒体基因atp6,通过直接测序和比对,发现atp6中A-59C、T-92C、T-185G、T-253C、T-418C和T-768C共6个核苷酸位点存在碱基变异,其中第59位、92位、185位和418位碱基的变化导致了相应位点编码氨基酸残基的改变,另两个位点(第253位和768位)为同义突变。对atp6基因中第59位A→C的突变进行了大量个体(共222个烟草植株个体)的PCR-RFLP检测及分析,结果表明,所有保持系单株的线粒体atp6基因片段都可以被Bst1107I酶切,酶切后出现两种条带;而96%以上的雄性不育系单株的线粒体atp6基因片段部分能被Bst1107I酶切,部分由于第59位A→C突变不能被Bst1107I酶切,酶切后出现3种条带。说明atp6基因第59位的SNP位点与烟草CMS特性存在显著的相关性。
- 赵婷朱滕义刘齐元张美良蒋海燕
- 关键词：烟草CMS单核苷酸多态性
