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microRNA识别和鉴定方法被引量：1: 2007年; microRNA是一类长约22nt的内源非编码小分子RNA,在线虫、果蝇、家鼠、人体及拟南芥等生物中普遍存在,并对其生长发育起着重要的调控作用。目前通过实验和计算机的方法在植物和动物中发现了越来越多的microRNA。通过对识别和鉴定新microRNA的主要方法策略的总结可以为microRNA今后的研究和发展提供一些思路和启发。; 王玫李思光罗玉萍; 关键词：MICRORNA 非编码RNA 计算机分析

调控过氧化物酶体生物合成和增殖的microRNA的计算机分析: 2009年; microRNA是真核生物中一大类参与基因转录后水平调控的长度为20￣24个核苷酸的非编码小分子RNA,它们在生物体的细胞增殖、细胞分化、细胞凋亡、形态建成、个体发育、激素分泌与信号转导等一系列生命活动中起重要作用。现以小鼠调控过氧化物酶体生物合成和增殖的蛋白质基因为靶基因,采用生物信息学方法搜寻到了调控这些靶基因表达且在系统发育上保守的microRNA,为进一步鉴定参与过氧化物酶体生物合成和增殖的microRNA,阐明microRNA在过氧化物酶体的生物合成和增殖中的作用和调控机制提供有价值的信息。; 张坤山李思光罗玉萍; 关键词：过氧化物酶体生物合成 MICRORNA 计算机分析

microRNA及其在植物生长发育中的作用被引量：9: 2006年; microRNA(miRNA)是真核生物中一类长度约为22个核苷酸的调控基因表达的非编码小分子RNA。文章介绍miRNA在植物生长发育、激素分泌与信号转导、对外界环境胁迫的应答以及调控自身合成中的作用的研究进展。; 章文蔚罗玉萍李思光; 关键词：MICRORNA 非编码RNA 植物生长发育

环境基因组技术在微生物多样性研究中的应用被引量：4: 2008年; 环境中的微生物具有极大的生物多样性,但99%的微生物不能通过标准的实验技术加以培养,不依赖于培养的环境基因组技术由于适合分析生态系统中整个复杂的微生物基因组而迅速发展起来。文章针对环境基因组技术的原理、方法以及目前该技术在环境微生物多样性研究中的应用等作一综述。; 吴兰葛刚李思光万金保; 关键词：微生物多样性

不同物种snR72～snR78的比较基因组分析: 2009年; 采用生物信息学技术对不同物种snR72～snR78(snR72、snR73、snR74、snR75、snR76、snR77和snR78)snoRNA基因进行了比较基因组学研究。结果发现,真菌中snR72～snR78具有较高的保守性,它们串联在一起形成基因簇。但在真菌的不同种中,基因簇中的部分snoRNA发生了缺失、位移和重组。动物和植物均存在着真菌snR72～snR78基因的同源分子。但是,与真菌snR72～snR78基因簇不同,动物和植物中的真菌snR72～snR78基因的同源分子并不是串联在一起形成基因簇,而是分散在基因组的不同位点。目前,在动物中尚未发现snR72和snR75,在植物中尚未发现snR76。值得注意的是,在真菌中,snR72～snR78基因簇的各成员只有一个拷贝,但在人、动物和植物中,snR72～snR78的一些成员有多个拷贝。人和小鼠的snR73和snR76有多个拷贝,拟南芥snR72、snR75、snR77和snR78有多个拷贝,水稻snR73、snR75和snR77有多个拷贝。而且,一些多拷贝的snoRNA基因串联在一起,表明动植物中的这些多拷贝的基因很可能是在进化过程中由局部复制产生。; 李春罗玉萍; 关键词：SNORNA 基因簇

miR-34基因家族的分子进化被引量：14: 2007年; 根据miRNA基因在进化中高度保守的特点,利用生物信息学方法在目前已测序的动物物种中搜寻参与哺乳动物早期发育调控的mir-34基因的同源序列,在33个不同的动物物种中获得了miR-34基因的54条同源序列,其中18条为新发现的序列。表明miR-34是高度保守的,广泛存在于后生动物中。目前发现的mir-34基因80%位于基因间隔区,少数位于蛋白编码基因的内含子区和3′UTR上。不同动物中,mir-34基因成熟序列的同源性为68%,前体序列为38.89%。在无脊椎动物中只有一个mir-34,而在几乎所有的脊椎动物中都有mir-34a,mir-34b,mir-34c,形成miR-34基因家族。系统进化分析表明,脊椎动物中miR-34基因家族是通过基因的串联和局部重复形成的,这个过程中伴随着个别碱基的变异。; 高佳莉罗玉萍李思光; 关键词：MICRORNA 分子进化

与肿瘤相关的MicroRNA研究进展被引量：1: 2008年; MicroRNA(smiRNAs)是一类进化上保守的单链非编码小分子RNA,它作为基因表达调控因子在转录后水平调节基因表达。最近研究发现,miRNA能够控制细胞生长、凋亡及分化;miRNA的表达与癌症相关,并在肿瘤的形成过程中发挥着重要的作用。因此,miRNA的研究对于揭示基因表达的调控机理、人类疾病防治及生物进化探索具有重要意义。; 姚绛罗玉萍李思光; 关键词：MIRNA 肿瘤基因表达调控

环介导等温扩增核酸技术及其应用被引量：53: 2007年; 环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,简称LAMP)是利用4个特殊设计的引物和具有链置换活性的DNA聚合酶,在恒温条件下特异、高效、快速地扩增DNA的新技术。该技术在1h内能扩增出109靶序列拷贝,扩增产物是一系列反向重复的靶序列构成的茎环结构和多环花椰菜样结构的DNA片段的混合物,电泳后在凝胶上显现出由不同大小的区带组成的阶梯式图谱。LAMP技术以其特异性强、灵敏度高、快速、准确和操作简便等优点在核酸的科学研究、疾病的诊断和转基因食品检测等领域得到了日益广泛的应用。; 匡燕云李思光罗玉萍; 关键词：核酸

U83 Box C/D snoRNA构建果蝇科系统发生树被引量：4: 2007年; 利用已报道的黑腹果蝇U83基因搜索果蝇基因数据库,鉴定了10种新的果蝇科U83同源基因,它们均位于相应物种核蛋白基因rpl3的内含子中。以冈比亚按蚊为外类群,对11种果蝇的U83核苷酸序列作进化关系分析,用邻接法重建了系统发生树,结果与传统方法构建的系统发生树相比,能反映果蝇科的大致进化关系,但还存在部分差别。为增加序列信息,把序列长度拓展至整个U83所在的内含子,同法构建系统发生树,结果与传统系统发生树几乎完全一致。该研究是用boxC/D snoRNA基因序列构建系统发生树的首次尝试,实验结果证明U83可以很好地用于构建果蝇科内各物种的种系发生树。; 徐玲罗玉萍周冬根李思光; 关键词：SNORNA 内含子系统发生树果蝇科

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