北京市自然科学基金(5072027)
- 作品数：3 被引量：28H指数：3
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- 苹果砧木珠眉海棠盐胁迫应答基因的微列阵研究被引量：5
- 2009年
- 以盐胁迫下苹果的耐盐砧木珠眉海棠为材料,用SMARTTM方法构建了cDNA文库。随机挑取5 000个cDNA克隆制备芯片,得到差异表达的基因388个,其中249个表达上调、139个表达下调。分析其中变化量在8倍以上的42个基因,并对部分基因进行RT-PCR验证,结果与芯片杂交结果一致。根据功能把这些基因分为5类:光合作用相关基因、物质转运相关基因、基础代谢相关基因、逆境相关基因以及其他基因。其中直接参与盐应答的基因占34%,包括上游调控蛋白、合成植体内小分子渗透调节物的限速酶、胁迫产生的活性氧清除剂、直接调节离子运输和储存的蛋白等。用此cDNA微列阵体系,将基因芯片技术与cDNA文库相结合,成为全面研究盐胁迫下基因表达的有效途径。为进一步研究盐应答基因功能及盐胁迫机制提供参考。
- 刘佳李擎天孔瑾许雪峰韩振海
- 关键词：CDNA文库基因芯片差异表达基因
- 珠眉海棠cDNA-AFLP分析体系的建立被引量：15
- 2008年
- 以珠眉海棠(Malus zumiMats)为研究材料,对cDNA-AFLP反应体系的关键因素(酶切时间、预扩增体系、选择性扩增体系)进行探索,建立了重复性好的cDNA-AFLP分析体系。结果表明,EcoRI和MseI的组合4h可将ds-cDNA酶切完全,与相应接头连接过夜后产物直接用于预扩增,1μl稀释20倍的预扩增产物作为模板用于选择性扩增,可以获得带型丰富且重复性好的结果。珠眉海棠cDNA-AFLP反应体系的建立为进一步的分子生物学研究建立了平台。
- 李志红唐美玲刘佳王忆李天忠韩振海许雪峰孔瑾
- 关键词：ECORI
- 珠美海棠MzWRKY基因家族盐胁迫应答模式研究被引量：8
- 2010年
- 对苹果属植物现有的58个WRKY的EST序列进行分析,得到了37条uniESTs。珠美海棠(Malus zumi Mats)是耐盐的优良苹果砧木,能在土壤全盐含量为0.6%的盐碱地上存活。根据已知的37条uniESTs序列,通过半定量RT-PCR研究了珠美海棠中MzWRKY基因家族的盐应答模式。28个MzWRKY基因能检测到RT-PCR的产物,其中21个基因受盐诱导,1个受盐抑制。根据MzWRKY基因盐应答模式可将这些基因分为两组,基因表达模式的差异说明MzWRKY在珠美海棠的盐应答中角色的多样性。
- 蒋阿维张素维孙杨吾褚欣然赵宇许雪峰孔瑾
- 关键词：珠美海棠WRKY转录因子盐胁迫半定量RT-PCR
