国家自然科学基金(30860221)
- 作品数：4 被引量：88H指数：3
- 相关作者：程汉黄华孙安泽伟赵彦宏谢黎黎更多>>
- 相关机构：中国热带农业科学院海南大学鲁东大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家科技支撑计划中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 橡胶树EST-SSR标记的开发与应用被引量：53
- 2009年
- 通过对橡胶树10778条EST序列进行拼接,共得到Unigene3090条,从中发掘出分布于353条Unigene的430个EST-SSR位点,SSR发生频率为11.42%,平均分布距离为3.93kb。在橡胶树EST-SSR中,二核苷酸和三核苷酸重复是主要的重复类型,分别占63.49%、32.09%。TC/AG、CT/GA和CTT/GAA、AAG/TTC、AGA/TCT是二、三核苷酸的优势重复类型。利用PRIMER5.0设计引物148对,随机挑选21对引物进行合成,并用其中15对扩增较好的引物,通过变性聚丙烯酰胺凝胶结合银染的方法对44个橡胶树无性系进行了遗传多样性检测,构建了聚类分析树状图。研究结果表明,从橡胶树EST中开发SSR标记是有效、可行的,文章所开发的EST-SSR引物可用于橡胶树遗传分析研究。
- 安泽伟赵彦宏程汉李维国黄华孙
- 关键词：橡胶树SSREST
- 橡胶树冷应答转录组cDNA-AFLP分析被引量：28
- 2010年
- 以橡胶树11个抗寒无性系和12个不抗寒无性系为研究对象,利用cDNA-AFLP技术对23个橡胶树无性系低温处理前后的基因表达谱进行差异分析。结果表明:通过100对引物组合的扩增筛选,共获得12条在2组材料中表现一致的差异片段(GenBank登录号:GO269543-GO269554);BLASTn和BLASTx比对分析显示,TDF7-8,TDF5-15,TDF16-103条片段分别与植物抗逆相关的ABC转运蛋白、3-脱氧-D-阿拉伯庚酮糖-7-磷酸合成酶(DAHPS)、WRKY基因有较高相似性,其余9条片段在GenBank未比对到同源序列。
- 安泽伟陈根辉程汉赵彦宏谢黎黎黄华孙
- 关键词：橡胶树CDNA-AFLP胁迫抗寒性分子育种
- 云南超高产橡胶树的SSR、AFLP和TRAP分析被引量：3
- 2010年
- 利用SSR、AFLP和TRAP3种分子标记对云南勐腊农场发现的2株超高产橡胶树云PR107、云RRIM501与正常产量单株(PR107、RRIM501)进行遗传分析,共筛选到具有多态性的SSR引物7对、AFLP引物28对和TRAP引物12对,3种标记分别检测到多态性条带9、94和21条,平均每对引物可分别检测到1.16、3.36和1.4条多态性条带,结果表明,2株超高产橡胶树的遗传组成均发生了改变。
- 张燕燕黄华孙胡彦师程汉安泽伟
- 关键词：橡胶树SSRAFLPTRAP高产
- 基于SSR标记的橡胶树无性系鉴定方法的建立被引量：8
- 2009年
- 从88对橡胶树SSR引物中筛选出5对产物清晰、扩增稳定的引物,采用6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳结合快速银染检测的方法,构建了87份橡胶树的DNA指纹图谱。5对引物共扩增出16条带,平均每对引物可扩增出3.2条带,多态性条带为15条,扩增条带分布在148～342bp,无性系之间只存在1～2个片段差异,说明遗传差异小;根据建立的无性系数字指纹图谱,能逐一区分65个无性系,表明应用SSR分子标记技术进行橡胶树无性系的鉴定是可行的。
- 谢黎黎黄华孙安泽伟程汉胡彦师曾霞
- 关键词：橡胶树SSR指纹图谱
