国家自然科学基金(21366007)
- 作品数：16 被引量：25H指数：3
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- 相关机构：广西科学院广西大学南宁市疾病预防控制中心更多>>
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- Studies on the hydrolysis function of β-glucosidase toward heterocyclic glycosides and terpene glycosides compounds
- ＜正＞Heterocyclic compounds and terpene compounds are considered to be important drug candidates and pharmaceuti...
- Zilong WangZhikai ZhangTingting TangHao PangShuangshuang GuoYutuo WeiRibo HuangLiqin Du
- 文献传递
- 创面敷料的生物多糖大分子材料现状与展望被引量：2
- 2017年
- 伤口创面的护理理念在历史上经历了一系列的认知变革。湿润创面护理理念的提出,对敷料材料提出了新要求,推动了创面敷料材料的发展,并相应地出现各种新形态的敷料材料。天然成分的生物多糖作为敷料材料使用,具有无可比拟的优势。因此本文对作为敷料材料应用的β?葡聚糖、纤维素、海藻酸、透明质酸、几丁质、壳聚糖等多糖大分子的特性以及应用现状进行概述,同时对多糖大分子作为敷料材料使用的发展趋势进行分析展望。
- 唐强庞浩
- 关键词：创面敷料大分子
- 南宁市HIV-1/AIDS人群治疗前pol区遗传特性及蛋白结构分析
- 2019年
- 为探讨南宁市某县艾滋病病毒1型(HIV-1)感染人群中治疗前pol区遗传特性及蛋白结构变化情况,本研究通过RT-PCR扩增pol区部分序列并进行测序,将序列同源比对构建系统进化树;分型确定毒株亚型和斯坦福大学HIV耐药性数据库比对,分析耐药相关位点;SWISS-MODEL蛋白质同源数据库进行建模分析氨基酸的突变对蛋白质结构和功能的影响。本研究在90份HIV-1标本中获得46个pol区有效序列,共发现4种亚型,其中CRF01_AE占76.08%(35/46)、CRF08_BC占15.22%(7/46)、CRF07_BC占(3/46)6.52%、CRF59_01B1占2.17%(1/46);46个序列中有4例(8.69%)出现耐药突变位点,没有针对核苷酸反转录酶抑制剂(NRTI)的耐药突变;针对蛋白酶类抑制剂(PIs)1例,PR蛋白酶的柔性部位I47V位点发生突变,β折叠结构的I84V位点发生突变,都是异亮氨酸突变为缬氨酸;针对非核苷酸反转录酶抑制剂(NNRTI)有3例,2例位于活性中心的Y181C位点由酪氨酸突变为半胱氨酸,1例位于转角处的E138G位点由谷氨酸突变为甘氨酸。研究表明,南宁市某县HIV-1病毒CRF01_AE重组亚型比例最大,未经抗病毒治疗HIV1感染者中已经出现pol区耐药突变株,突变位点主要位于活性中心及柔性部位,传播水平已经处于中等流行状态。深入分析蛋白质与抑制剂相互作用机制,有助于为艾滋病抗病毒及耐药性监测方案提供科学依据。
- 裴建新唐驰秦剑秋潘海西栾苑周吉
- 关键词：人类免疫缺陷病毒1型耐药性突变同源建模蛋白结构
- perR基因的敲除对丙酮丁醇梭菌摇瓶发酵的影响被引量：2
- 2014年
- 为了提高丙酮丁醇梭菌对分子氧的耐受能力,降低厌氧发酵环境,构建了超氧化物阻遏蛋白(PERR)基因敲除的工程菌株。应用Ⅱ组内含子敲除系统,PCR克隆perR-Targetron基因与载体连接构建敲除质粒pSYperR,电转化丙酮丁醇梭菌C.acetobutylicum ATCC 824,PCR筛选验证获得突变菌株C.acetobutylicum ATCC 824-ΔperR,采用摇瓶发酵对其突变菌株进行发酵性能研究。结果表明:静止状态发酵丁醇C.acetobutylicum ATCC824-ΔperR比C.acetobutylicum ATCC 824丁醇产量提高7.89%,摇床转速为200 r/min时,C.acetobutylicum ATCC824-ΔperR的丁醇产量是C.acetobutylicum ATCC 824的3.34倍。研究表明,通过Ⅱ组内含子敲除系统,构建的C.acetobutylicum ATCC824-ΔperR在发酵过程中降低了氧分子的伤害,不需要严格的厌氧条件,从而降低发酵成本。
- 裴建新庞浩左文朴林丽华郭媛严少敏黄日波
- 关键词：丙酮丁醇梭菌丁醇
- 南宁市1株人感染高致病H7N9禽流感病毒遗传特性分析
- 2018年
- 目的通过对广西省南宁市2017年首例人感染高致病H7N9禽流感病毒株血凝素(HA)及神经氨酸酶(NA)基因测序,从分子水平分析毒株的溯源及遗传特性。方法通过RT-PCR扩增H7N9禽流感毒株HA基因和NA基因并测序,经NCBI数据库BLAST比对,利用MEGE 5.1等软件构建进化树及统计蛋白关键位点的变异情况。结果系统进化树表明中国H7N9毒株HA基因与NA基因主要为2个类群,长三角分支和珠三角地区分支,南宁毒株A/Nanning/01/2017(H7N9)HA和NA基因均在珠三角分支上,与广东毒株高度同源。病毒HA蛋白裂解位点插入4个氨基酸由PEIPKGR↓GLF突变为PEVPKRKRTAR↓GLF,含有5个碱性氨基酸,使其具有高致病性禽流感病毒的分子特征;毒力相关位点225由天冬氨酸(D)突变为甘氨酸(G)(D225G),毒力增强;受体结合186位点由甘氨酸(G)突变为缬氨酸(V)(G186V);飞沫传播关键氨基酸位点没有发生突变组合;糖基化位点高度保守。NA蛋白丢失5个氨基酸,毒力可能增强,耐药性位点、糖基化位点均相对保守,未发生突变。结论南宁市人感染H7N9禽流感病毒可能来源于广东省珠三角地区禽类的感染,人传人的可能性不大,对NA抑制剂药类敏感,但毒株已经具有高致病性禽流感病毒的分子特征,毒力增强。南宁市外环境已经检测到H7N9核酸阳性标本,提示需要加强监测有效防控传染源。
- 裴建新秦剑秋农皓詹鑫婕杨丞何冰刘海燕
- 关键词：高致病性
- 一株产结冷胶的少动鞘氨醇单胞菌的筛选鉴定被引量：1
- 2016年
- 为了获得利用蔗糖高产结冷胶的野生菌株,从北海涠洲岛表层土样分离筛选出一株利用蔗糖高产结冷胶的野生菌株,命名为gxas-815。经Biolog生理生化分析和16S r DNA序列分析,鉴定该菌为少动鞘氨醇单胞菌(Sphingomonas paucimobilis)。此菌株能以蔗糖为原料发酵生产结冷胶,摇瓶实验表明,在含3%蔗糖、0.3%蛋白胨、0.15%磷酸氢二钾、0.15%硫酸钾、0.25%磷酸二氢钾、0.3%无水硫酸镁的发酵培养基中的结冷胶产量达13.75 g/L,结冷胶每克蔗糖产率达0.458 g,并且能利用糖蜜中除蔗糖外的其他碳源。
- 林丽华裴建新尹金阳汤宏赤郭媛樊少林庞浩
- 关键词：少动鞘氨醇单胞菌结冷胶蔗糖
- 厌氧梭菌表达载体在大肠杆菌中的直接表达及活性筛选被引量：2
- 2013年
- 厌氧微生物的代谢途径改造、重组基因表达等分子生物学操作步骤多,易造成氧气接触,从而导致厌氧微生物死亡.针对厌氧梭菌-大肠杆菌穿梭载体的构建和筛选问题,利用纤维素内切酶基因Cphy3367作为报告基因,分析穿梭载体的硫解酶启动子在大肠杆菌中启动基因转录表达的可能性.含有重组质粒pSOS95-Cphy3367的大肠杆菌菌株相对于对照菌株生长迟缓,生物量降低.实时定量PCR检测及重组蛋白酶活检测结果中,发现硫解酶启动子在大肠杆菌中能启动基因转录表达,在37℃温度下48 h后达到高峰.表明硫解酶启动子在大肠杆菌中可以被宿主识别和启动基因表达,基因可以翻译成为蛋白质.在厌氧梭菌的穿梭载体构建中,含有硫解酶启动子的载体可以在大肠杆菌中进行重组载体的活性筛选这个步骤,从而降低梭菌厌氧操作的复杂度和难度.
- 刘春宇陈燕黄金群裴建新庞浩黄日波
- 关键词：大肠杆菌纤维素酶菌株筛选
- 差异柠檬酸杆菌GXW-1 β-葡萄糖苷酶的酶学性质及分子改造被引量：7
- 2017年
- 【目的】筛选鉴定1株产β-葡萄糖苷酶的菌株,克隆、表达该菌株中的β-葡萄糖苷酶基因,研究重组酶的酶学性质并进行分子改造。【方法】在自然界中采集土样,筛选到1株具有β-葡萄糖苷酶活性的菌株,对野生菌进行16S rDNA鉴定,比对分析Gen Bank数据库中与野生菌同属的β-葡萄糖苷酶基因序列,设计简并引物PCR扩增基因保守区;设计引物扩增目的基因,以pQE30为表达载体构建重组质粒,转化至大肠杆菌中进行诱导表达;采用镍亲和层析对重组酶进行纯化,研究其酶学性质;采用易错PCR和定点随机突变相结合的方法对野生型β-葡萄糖苷酶进行分子改造。【结果】一个来自于差异柠檬酸杆菌GXW-1的β-葡萄糖苷酶基因被克隆并在大肠杆菌中表达。酶学性质研究结果表明该β-葡萄糖苷酶CBGL的最适温度为45°C,最适p H为6.0,V_(max)值是(0.1704±0.0073)μmol/(mg·min),K_(cat)值为(0.2380±0.0102)/s。CBGL能水解α-pNPG、甜菊苷、黄豆苷和染料木苷。对野生酶进行分子改造,获得V_(max)是野生酶2.54倍的突变体W147F。【结论】CBGL不仅具有β-1,4-糖苷键水解能力,还可能具有一定的α-糖苷键水解酶活性。此外,CBGL还能够水解天然底物甜菊苷、黄豆苷和染料木苷。这些特性表明该β-葡萄糖苷酶在理论研究及在工业中有一定的应用价值。
- 江民华林厚民尹金阳王子龙庞浩黄日波杜丽琴
- 关键词：Β-葡萄糖苷酶酶学性质
- 一株南宁市人源高致病H7N9禽流感病毒全基因组特性分析被引量：2
- 2018年
- 目的通过全基因组序列分析南宁市1株人感染高致病H7N9禽流感病毒的分子遗传特性。方法不明原因肺炎患者1例,采集其下呼吸道痰液,经荧光RT-PCR检测H7N9核酸阳性后送中国疾病预防控制中心分离病毒并应用illumina平台深度测序,用MEGA5.1进行同源性和重要氨基酸位点分析,采用Neighbor-Joining法构建进化树。结果分离毒株命名为A/Nanning/01/2017(H7N9),测序分析该毒株的8个基因与A/chicken/Heinan/ZZ01/2017(H7N9)和A/Guangdong/HP001/2017(H7N9)高度同源。其中,HA蛋白裂解位点由PEIPKGR↓GLF突变为PEVPKRKRTAR↓GLF,具有高致病性的分子特征;受体结合位点G186V发生变异,毒力相关位点D225G发生突变,糖基化位点保守,飞沫传播关键氨基酸158D/224K/226L、110Y/160A/226L/228S和196R/226L/228S任一组合未发生突变。NA蛋白茎杆区丢失5个氨基酸,糖基化位点和耐药性位点保守。M2蛋白耐药性位点V27G和S31N发生突变。PB1蛋白I368V位点,PA蛋白K356R位点,M1蛋白N30D位点和T215A位点及NS1蛋白P42S位点均发生突变。PB2蛋白关键氨基酸位点E627K和D701N未突变。结论生物信息学分析A/Nanning/01/2017(H7N9)毒株可能来源于珠三角地区禽类的感染,具有高致病性禽流感病毒的分子特征,但未发现二代传播,人传人的可能性不大。该毒株对神经氨酸酶抑制剂药类敏感,对M2离子通道抑制剂可能产生耐药性。
- 裴建新秦剑秋詹鑫婕杨丞农皓刘海燕周吉
- 关键词：高致病性基因组
- Characterization and molecular modification of β-glucosidase from Citrobacter koser GXW-1
- ＜正＞P-glucosidase is widely used in the preparation of fiber fuel ethanol,food,pharmaceutical and other industr...
- Minhua JiangHoumin LinJinyang YinHao PangFangfang ZhengRibo HuangLiqin Du
- 文献传递
