中央高校基本科研业务费专项资金(KYJ200909)
- 作品数：14 被引量：169H指数：10
- 相关作者：房经贵王晨慕茜孙欣上官凌飞更多>>
- 相关机构：南京农业大学江苏省农业科学院中国农业科学院果树研究所更多>>
- 发文基金：中央高校基本科研业务费专项资金江苏省科技支撑计划项目教育部“新世纪优秀人才支持计划”更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 葡萄夏芽成花过程中相关基因的cDNA-RAPD分析被引量：8
- 2011年
- 首次在果树作物上使用cDNA-RAPD技术,以藤稔葡萄正常成花花芽和摘心处理后成花花芽为材料,分析了摘心处理后与葡萄夏芽成花相关基因的差异表达。通过10条RAPD引物分析,在基因组和cDNA上共获得153条(差异性条带81条)扩增片段,并进一步将这些片段分为3种类型。摘心处理后的葡萄夏芽在成花过程中部分基因出现了不同程度的差异表达,且差异表达的基因大多数呈现表达增强的趋势。对差异性片段进行选择回收和测序,共获得14条核苷酸片段,其中有13个片段能在GenBank数据库中发现相应的同源序列。说明该技术是一种较好的可用来研究基因差异表达的方法。
- 郭磊王晨曹雪杨光慕茜房经贵
- 关键词：葡萄
- 葡萄浆果中的糖成分以及相关代谢研究的进展被引量：16
- 2011年
- 葡萄中的糖种类与含量对浆果品质及葡萄酒的质量具有重要影响,因此关于葡萄果实糖分的研究就显得尤为重要。该文就果实中糖分的生理功能、糖分对葡萄浆果品质及葡萄酒质量的影响以及蔗糖代谢相关酶在果实糖分积累中的作用等方面进行了研究,以期为这一领域的深入研究提供一定的理论依据。
- 冷翔鹏慕茜房经贵韩键
- 关键词：葡萄葡萄酒糖代谢
- 利用GenBank中大量葡萄EST序列分离有效基因的电子表达分析平台被引量：10
- 2011年
- 【目的】充分利用GenBank上的大量葡萄EST序列,建立本地化基因电子表达分析平台,实现基因表达模式的大规模快速分析。【方法】利用生物信息学方法对GenBank上的362 193条葡萄EST序列进行本地化及后续处理,建立电子分析平台,并通过RT-PCR技术对其电子分析准确性进行验证。【结果】建立了包含叶、花等11个组织类别和GA3等5个胁迫类型的基因电子表达分析平台。通过VvAG、VvCHS、VvF3H、VvLDOX等4个葡萄基因的RT-PCR和电子表达分析结果比较发现,平台预测效率较高,在预测EST来源数较多的果实、花序、花组织的表达效果较好,而对叶等EST来源较少的组织的预测效果需结合试验判断。随着dbEST库中源于葡萄各组织EST序列数量的大量增加,平台的预测效果将更加符合基因表达的实际情况。【结论】葡萄基因电子表达分析平台预测效率较高,为葡萄基因大规模快速表达分析以及重要相关信息的挖掘提供了很好的分析工具。
- 上官凌飞王晨房经贵李晓颖王西成宋长年
- 关键词：葡萄生物信息学
- 波尔多液作用机理及其在果树生产上的应用与相应药害研究进展被引量：13
- 2012年
- 波尔多液是在果树上应用时间最长、应用范围最广、药效最为稳定的杀菌剂。为更好、更科学地将波尔多液应用于果树生产,在总结前人研究的基础上,结合正在开展的有关研究,针对波尔多液的作用机理、配制与施用、药害以及相关microRNA398对植物铜离子胁迫的影响进行了简要介绍。
- 冷翔鹏孙欣房经贵宋长年
- 关键词：波尔多液果树铜离子
- 葡萄microRNA156b和microRNA172c及其靶基因在冬芽二次成花过程中的表达特性研究被引量：4
- 2012年
- 利用半定量RT-PCR与实时荧光定量RT-PCR(qRT-PCR)技术检测‘藤稔’葡萄microRNA156b(Vv-miR156b)和microRNA172c(Vv-miR172c)及其靶基因(Vv-SPL9和Vv-AP2)在摘心处理(5月14日、5月20日、5月28日)后不同发育时期冬芽中的表达情况,并利用RLM-5'-RACE验证了miRNAs作用其靶基因的方式。结果表明:仅5月28日摘心处理的冬芽能够进行花芽分化并形成花序,而其他处理及对照未能花芽分化。2种RT-PCR检测结果基本一致,5月28日摘心处理的2条miRNAs表达水平明显下降,且花序中有最低表达。相应的靶基因在冬芽二次成花过程中的表达水平呈现出与其miRNAs相反的变化趋势。RLM-5'-RACE结果显示,2条miRNAs介导靶基因裂解,裂解位点均在miRNAs 5'端的第10和11位碱基之间。表明microRNA156b和microRNA172c通过介导相应靶基因的裂解调控其靶基因的表达,从而影响葡萄冬芽的二次成花。
- 王晨张演义房经贵宋长年刘洪王西成
- 关键词：葡萄靶基因冬芽实时荧光定量RT-PCR
- 葡萄SBP基因家族生物信息学分析被引量：21
- 2010年
- SBP(squamosa promoter binding protein,SBP)基因家族是植物所特有的一类重要转录因子,广泛参与植物生长、发育以及多种生理生化反应的信号传导。葡萄是继拟南芥、水稻和杨树之后完成全基因组测序的第四种开花植物,因此葡萄逐渐成为分子生物学研究的重点对象,进行葡萄基因组信息挖掘与分析对于葡萄功能基因组学的发展具有重要意义。本文利用生物信息学方法对葡萄家族45条SBP蛋白序列的系统发生和SBP基因组定位进行分析,然后对其氨基酸组成成分、理化性质以及二级和三级结构进行预测和分析,同时还分析了葡萄与拟南芥的SBP基因家族之间的联系。结果显示这45条蛋白序列与拟南芥16个SBP基因蛋白序列一起分成了3个亚族,说明拟南芥与葡萄SBP基因间具有较高的保守性;进一步的基因组定位结果发现其分布在14条染色体上,较拟南芥在染色体上的分布更为分散。研究还发现不同亚家族间氨基酸数目、氨基酸序列间的疏水性存在一定的差异;而二级结构预测结果发现,41条氨基酸序列以随机卷曲为主要组成部分,这与拟南芥相似,且45条氨基酸序列三维结构十分相似。本文实验结果均为葡萄SBP基因家族的进一步功能分析提供了重要研究基础。
- 曹雪上官凌飞于华平杨光王晨谭洪花房经贵
- 关键词：葡萄拟南芥生物信息学
- 巨峰葡萄系谱的SSR与RAPD分析被引量：16
- 2011年
- 利用RAPD和SSR 2种标记分别对系谱关系明确的22个巨峰系葡萄品种进行聚类分析,以验证2种标记方法的正确性与可靠性。结果显示,11条RAPD引物和12对SSR引物,分别扩增了82和43个清晰的条带。RAPD与SSR引物扩增的条带中分别有58和31条多态性带,其多态性比率分别为70.7%和72.1%。2种分子标记聚类结果基本一致,并且都能有效地将品种区分开来以及正确反映22个葡萄品种的亲缘关系。研究结果说明RAPD和SSR 2种分子标记均适合于巨峰系葡萄的系谱分析和种质遗传多样性研究。
- 冷翔鹏刘崇怀房经贵谭洪花上官凌飞
- 关键词：SSRRAPD葡萄系谱分析
- 5个葡萄microRNAs及其靶基因在冬芽二次成花过程中的表达被引量：10
- 2011年
- 试验以‘藤稔’葡萄为材料,利用荧光定量PCR技术检测5个葡萄miRNAs(vv-miR160a、vv-miR171a、vv-miR159、vv-miR164c和vv-miR167c)及其靶基因在不同摘心处理的冬芽发育过程中的动态表达特征,以探讨mi-croRNAs调控花发育的分子机理。结果显示:5条miRNAs及其靶基因在二次成花的冬芽中的表达发生了明显变化。其中,vv-miR160a、vv-miR171a和vv-miR159表达水平明显增强,在花序中有最高表达;vv-miR164c和vv-miR167c的表达水平明显减弱,在花序中的表达最低或较低,而这些vv-miRNAs在对照组中表达水平均无明显变化。研究表明,上述miRNAs参与了葡萄冬芽的二次花的发育;从miRNAs与其靶基因的表达呈现的消长变化趋势看,这些vv-miRNAs通过负调控其靶基因表达而起作用。
- 王晨孙欣房经贵冷翔鹏李晓颖慕茜
- 关键词：葡萄MICRORNAS靶基因冬芽成花过程
- 中国外来引进葡萄品种命名情况分析被引量：11
- 2010年
- 在我国,葡萄是泊来果树树种之一。目前,我国很多栽培品种与砧木多为通过引种引进的品种。实际生产中,由于受引种渠道、方式以及来源地等的多样性以及存在葡萄品种命名尚未达成统一与共识等现状的影响,造成了目前品种命名相对混乱,同物异名与同名异物现象时有发生,对葡萄育种、生产以及科研等易造成不利的影响。本文对我国大量引进葡萄品种的命名方式和标准进行了统计与分析,以期为更好地认识我国从国外引进葡萄品种的命名情况以及为将来规范与统一外来葡萄品种的命名提供重要参考资料。
- 王文艳王晨陶建敏杨光房经贵
- 关键词：葡萄品种栽培品种同物异名同名异物葡萄育种源地
- 葡萄NAC转录因子家族生物信息学分析被引量：26
- 2011年
- NAC基因家族是植物所特有的一类重要转录因子,广泛参与植物生长、发育以及器官建成、逆境胁迫应答等反应。目前,基因组信息的挖掘和分析已经成为葡萄功能基因组学研究的重要组成部分。本文利用生物信息学方法对葡萄143条NAC蛋白序列的系统发生和NAC基因组定位进行分析,然后对其氨基酸组成成分、理化性质以及二级和三级结构进行预测和分析,同时还分析了葡萄与拟南芥的NAC基因家族之间的联系。结果显示这143条蛋白序列与拟南芥94个NAC基因蛋白序列一起分成了16个亚族,说明拟南芥与葡萄NAC基因间具有较高的保守性。基因组定位结果发现143条NAC基因分布在17条染色体上。研究还发现不同亚家族间氨基酸数目、氨基酸序列间的疏水性存在一定的差异;而它们的二级结构都主要以随机卷曲为组成部分,且143条氨基酸序列三维结构十分相似。本文试验结果将为葡萄NAC基因家族的进一步功能分析提供重要研究基础。
- 孙欣上官凌飞房经贵宋长年王晨慕茜
- 关键词：葡萄拟南芥NAC转录因子生物信息学
