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国家高技术研究发展计划(2007AA02Z477)

作品数:1 被引量:1H指数:1
相关作者:张华洪明晃曹京燕曾木圣罗东华更多>>
相关机构:中山大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
相关领域:医药卫生更多>>

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇医药卫生

主题

  • 1篇咽肿瘤
  • 1篇生物信息
  • 1篇生物信息学
  • 1篇肿瘤
  • 1篇外周
  • 1篇外周血
  • 1篇基因
  • 1篇基因芯片
  • 1篇癌患者
  • 1篇鼻咽
  • 1篇鼻咽癌
  • 1篇鼻咽癌患者
  • 1篇鼻咽肿瘤

机构

  • 1篇中山大学

作者

  • 1篇纪红
  • 1篇罗东华
  • 1篇曾木圣
  • 1篇曹京燕
  • 1篇洪明晃
  • 1篇张华

传媒

  • 1篇中华肿瘤防治...

年份

  • 1篇2011
1 条 记 录,以下是 1-1
排序方式:
鼻咽癌患者外周血全基因组表达谱芯片结果初步分析被引量:1
2011年
目的:从外周血水平比较健康对照者及鼻咽癌患者的外周血基因表达谱差异,寻找新的mRNA分子标志。方法:选取20例鼻咽癌患者和20名健康对照者进入本研究,两组性别、年龄基本匹配。采用QIAGENRNeasy○RMini Kit分离纯化外周血mRNA,行Agilent人类全基因寡核苷酸芯片检测。利用Gene Spring 10.0软件采用t-test une-qual unpaired算法,计算P<0.05时的差异基因并按差异倍数排序。利用Gene spring软件及DAVID Bioinformatics Resources 6.7对前期筛选的差异基因进行聚类分析,GO分析、Pathway分析,分析差异基因功能分类及相关通路。结果:差异倍数≥1.5倍且P<0.05的包含1 257个探针(上调687个,下调570个);差异倍数≥2.0倍的包含171个探针(上调132个,下调39个)。差异基因主要与细胞周期、免疫反应及对病毒的反应等生物学过程有关;主要参与肿瘤信号通路、细胞周期通路和p53信号通路等。结论:用全基因组表达谱芯片可以筛选出鼻咽癌患者与健康对照者外周血中的差异表达基因,进一步筛选这些基因可能寻找到鼻咽癌诊断相关的mRNA分子标志。
罗东华曹京燕纪红张华曾木圣洪明晃
关键词:鼻咽肿瘤基因芯片生物信息学
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